{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004551989592110454],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.000444656459732233],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004467887240082508],
[445.9372821409138, 1015.191803925389, 1, 0, 0.3052004688658139, 0.002242467808923869, 0, -0.02624494049072515, 1, 0.3052004688658139, 0.000446842300576629],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004468958771449964],
[445.8315485451527, 1015.29753752115, 0, 1, 0.305128104557438, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.694871895442562, 1, 0.0004469092712870871],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004469360595712662],
[445.9129939204414, 1015.186869489064, 0, 1, 0.3051899497683169, 0, 0.0009850403212004633, 0.01152851537399644, 0.6948100502316832, 1, 0.0004469494537133544],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762907, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004469762419975305],
[445.9129939204414, 1015.223705738576, 0, 1, 0.3051822557222081, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.6948177442777919, 1, 0.000445205355196348],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004447601782965731],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.000447003030281704],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004447735055699942],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004470164244237898],
[446.0190314894725, 1015.142260363287, 1, 0, 0.305249690076253, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.305249690076253, 0.0004447868328434093],
[446.0190314894725, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3052342667344624, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052342667344623, 0.0004447868328434093],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004470298185658758],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470298185658758],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470298185658758],
[445.9129939204414, 1015.165696583887, 0, 1, 0.3051943723623285, 0, 0.0009850608657927264, 0.0115287558196337, 0.6948056276376715, 1, 0.0004448001601168215],
[445.9053803277268, 1015.223705738576, 0, 1, 0.305178635193833, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.694821364806167, 1, 0.0004470298185658758],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762907, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0004448134873902279],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470432127079598],
[446.2495303292534, 1014.879555737049, 0, 1, 0.3054141722211967, 0, 0.000985338599390503, 0.01153200630185553, 0.6945858277788033, 1, 0.0004448134873902279],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004475040844926495],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004115223129394976],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002449176664418155],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000446619798785591],
[445.942216577239, 1015.186869489064, 0, 1, 0.3052038460050224, 0, 0.0009850403212004631, 0.01152851537399644, 0.6947961539949776, 1, 0.0006915894123605519],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006915454693921627],
[444.7009187823792, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3050126234145715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002454832785600188],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004460671878423803],
[445.9944392957302, 1015.134646770573, 0, 1, 0.3052395873498421, 0, 0.0009850909957425647, 0.01152910844843727, 0.6947604126501579, 1, 0.0006916116740500615],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004109268130017956],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002804026384466117],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.000411155715801923],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915482961252559],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004101234229928843],
[445.965485506273, 1015.288277143068, 0, 1, 0.3051937294571688, 0, 0.0009849419347319874, 0.01152736389837661, 0.6948062705428313, 1, 0.0006916937861100982],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006917367157447114],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.000691674608794433],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006917367322987143],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004453684327652974],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004263572612795774],
[444.6812604769333, 1013.506270902965, 0, 1, 0.3049547818147414, 0, 0.0009866737174788946, 0.01154763198648676, 0.6950452181852586, 1, 0.000526673651043678],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001650361855397933],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001604560409552111],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0005310314176406363],
[446.1142701034246, 1014.879555737049, 0, 1, 0.305349866791385, 0, 0.000985338599390503, 0.01153200630185553, 0.694650133208615, 1, 0.0006917969549689993],
[445.888705699969, 1015.365056949372, 1, 0, 0.3051411856702739, 0.002242712110032415, 0, -0.02624779969255186, 1, 0.3051411856702739, 0.0006916895030579089],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000280281345317138],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004112738591122947],
[444.9129939204414, 1013.004017007799, 0, 1, 0.3051703153097651, 0, 0.0009871629166425121, 0.011553357376562, 0.6948296846902349, 1, 0.0006951028598383389],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0006918868873022592],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006917084046354484],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006918081999064909],
[446.2495303292534, 1014.879555737049, 0, 1, 0.3054141722211966, 0, 0.0009853385993905028, 0.01153200630185553, 0.6945858277788034, 1, 0.0006915101867098483],
[445.4129939204414, 1015.716092145861, 0, 1, 0.30484164484029, 0, 0.0009845270816644654, 0.01152250862508074, 0.69515835515971, 1, 0.0006916986672840584],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0006918588438758912],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006912213180453545],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004467753298661552],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002204526147093508],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004713390228243586],
[446.4129939204414, 1015.318979458458, 0, 1, 0.305400033693267, 0, 0.0009849121509905899, 0.01152701532145726, 0.694599966306733, 1, 0.0006937857705755284],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0006917550189131605],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006919535291723063],
[444.765330355293, 1013.422201024605, 0, 0, 0.3050124354954585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002431248182049189],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0004484472250388518],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002431340171959535],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004484407024497076],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002597708470989672],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004317258316770019],
[445.8315485451527, 1015.29753752115, 0, 1, 0.305128104557438, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.694871895442562, 1, 0.0006918982607206693],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002804036235709487],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000411155715801923],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006912573017344254],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006914965588438307],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00026234532627772],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004292344659512621],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0006917948688014898],
[446.3315485451526, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.6945296943292121, 1, 0.0006916696907803384],
[445.9053803277268, 1015.223705738576, 0, 1, 0.305178635193833, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.694821364806167, 1, 0.0006919034398463235],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918245337794356],
[445.9129939204414, 1015.245314802659, 0, 1, 0.3051777423831116, 0, 0.0009849836147181607, 0.01152785170415577, 0.6948222576168883, 1, 0.000691402567795033],
[444.6999345968702, 1013.542857832526, 1, 0, 0.3049560312628128, 0.002248707324201702, 0, -0.02631796526571012, 1, 0.3049560312628128, 0.0006915663558937998],
[444.6181852483115, 1013.543161805795, 1, 0, 0.3049170012266231, 0.002249120780881955, 0, -0.02632280419625153, 1, 0.3049170012266231, 0.0006912470856003753],
[444.7777336946127, 1013.355982834746, 0, 1, 0.3050321987981117, 0, 0.0009868200483729482, 0.01154934458436268, 0.6949678012018883, 1, 0.000691312721190861],
[444.6424734687839, 1013.437428210034, 1, 0, 0.3049506909441843, 0.002248997924554333, 0, -0.02632136633525102, 1, 0.3049506909441844, 0.0006914676548584967],
[445.7777336946127, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051025107855534, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948974892144466, 1, 0.0006917576306957326],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003251141735211865],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0003663265713588712],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006917355808256132],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0006917759566959945],
[444.3739916000032, 1013.543019328237, 0, 0, 0.3048006081752726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002714623192369979],
[445.6434927602223, 1015.350333080252, 1, 0, 0.3050276358997305, 0.002243946150332432, 0, -0.02626224240343859, 1, 0.3050276358997305, 0.0004200626101026572],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0003520109459528423],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002658826920965638],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004256397650643481],
[445.3155462864079, 1012.659909955428, 0, 0, 0.3054341857264729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002793407514462808],
[446.1142701034246, 1014.908778393847, 0, 1, 0.3053437593351271, 0, 0.0009853102281591839, 0.01153167425638551, 0.6946562406648729, 1, 0.0004122559235261565],
[445.7501031698638, 1012.437428210034, 0, 0, 0.3056877758020917, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002657959888646847],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0004255724994164314],
[444.2399211028174, 1013.947610277081, 0, 0, 0.3046521188412772, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002795880165261497],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004120048697803119],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0006914764657212051],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006917210610483454],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915914767857008],
[445.0190314894725, 1013.168499890426, 1, 0, 0.3051864193821123, 0.002247094908846963, 0, -0.02629909420550446, 1, 0.3051864193821123, 0.0006915789633421774],
[445.1250690585036, 1013.062462321394, 0, 0, 0.3052591381283292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002955183843661555],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0003957103460437227],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006918104160669909],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006916519740037602],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000691612810657616],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006915577998081132],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002650974248819681],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004264177328439733],
[444.7009187823792, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3050126234145715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00027800128635672],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004135111836451782],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002786917441288856],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000412830556947812],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002827894106846309],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004086804449107146],
[444.3254151590584, 1013.75448651976, 0, 0, 0.304733241743108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002928701151481193],
[445.6192045397499, 1015.456066676013, 1, 0, 0.3049940090827419, 0.002244068455336957, 0, -0.02626367381197552, 1, 0.3049940090827419, 0.00039863024468484],
[445.1250690585036, 1013.062462321394, 0, 0, 0.3052591381283292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002946949622572518],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0003964697733690222],
[444.2399211028174, 1014.218130728738, 0, 0, 0.3045956107856058, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002739372427375767],
[445.5764575116294, 1015.687888780502, 0, 1, 0.3049252920200594, 0, 0.0009845544197643846, 0.01152282857919676, 0.6950747079799406, 1, 0.0004178268753769257],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006914687825403341],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006917874549708453],
[444.659292786262, 1013.528238593636, 1, 0, 0.3049397167492416, 0.002248912855804586, 0, -0.0263203707248499, 1, 0.3049397167492416, 0.0006919469331275687],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006914977176805756],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006914743136731722],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915913863457415],
[446.1142701034246, 1014.908778393847, 0, 1, 0.3053437593351271, 0, 0.0009853102281591839, 0.01153167425638551, 0.6946562406648729, 1, 0.0006918573471924452],
[445.9372821409138, 1015.06712734235, 1, 0, 0.3052265135179402, 0.002242467808923869, 0, -0.02624494049072515, 1, 0.3052265135179402, 0.0006914024283087319],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006914611357165429],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006917972299339549],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006915635713151771],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006914633185779572],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918631885536315],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006914038708280973],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006918636848144204],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918634456048612],
[445.6434927602223, 1015.350333080252, 1, 0, 0.3050276358997305, 0.002243946150332432, 0, -0.02626224240343859, 1, 0.3050276358997305, 0.0006914830739565844],
[446.5472348548317, 1015.052628554673, 0, 1, 0.3055194831594753, 0, 0.0009851705930005751, 0.01153004002270175, 0.6944805168405247, 1, 0.0006915341479249777],
[444.5948812133481, 1013.59265016655, 1, 0, 0.3048955443972445, 0.002249238671553956, 0, -0.02632418394121766, 1, 0.3048955443972445, 0.0004538398360656075],
[444.7301414391769, 1013.457389940721, 0, 1, 0.3049883035403026, 0, 0.0009867213066140764, 0.01154818895056708, 0.6950116964596974, 1, 0.0004530606686684615],
[444.5948812133481, 1013.486612597519, 1, 0, 0.30491771763137, 0.002249238671553956, 0, -0.02632418394121766, 1, 0.30491771763137, 0.0006917863860882732],
[444.7009187823792, 1013.35135237169, 0, 1, 0.3049965543624797, 0, 0.0009868245576024129, 0.01154939735856907, 0.6950034456375203, 1, 0.0006923913293533927],
[444.6194734070905, 1013.568057972808, 0, 1, 0.3049124093019382, 0, 0.0009866135698870142, 0.01154692804328486, 0.6950875906980618, 1, 0.0006919951406821369],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006917297483337623],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006916117950809796],
[445.7117177374581, 1015.523405897876, 0, 1, 0.3050239557810479, 0, 0.0009847138866443451, 0.01152469491536362, 0.6949760442189521, 1, 0.0006911687821502527],
[444.683514372099, 1013.649860876418, 0, 1, 0.3049258296624526, 0, 0.0009865339488483566, 0.01154599619070127, 0.6950741703375474, 1, 0.001038773564899739],
[445.7117177374581, 1015.552628554673, 0, 2, 0.3050178558509446, 0, 0.001969371102752581, 0.02304872658158634, 0.4830001806860184, 1, 0.001037920033277123],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 0, 0.3051838459536401, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002465263601033493]
],
"NAMES": [
["Node1455"],
["Node1452"],
["Node1446"],
["Node1443"],
["Node1440"],
["Node1437"],
["Node1434"],
["Node1431"],
["Node1425"],
["Node1422"],
["Node1419"],
["Node1416"],
["Node1413"],
["Node1410"],
["Node1407"],
["Node1401"],
["Node1398"],
["Node1395"],
["Node1392"],
["Node1389"],
["Node1386"],
["Node1383"],
["Node1380"],
["Node1377"],
["Node1374"],
["Node1371"],
["Node1368"],
["Node1365"],
["Node1362"],
["Node1359"],
["Node1356"],
["Node1353"],
["Node1343"],
["Node119"],
["Node118"],
["Node140"],
["Node147"],
["Node155"],
["Node154"],
["Node165"],
["Node174"],
["Node178"],
["Node177"],
["Node1253"],
["Node1211"],
["Node1214"],
["Node281"],
["Node306"],
["Node316"],
["Node429"],
["Node426"],
["Node416"],
["Node415"],
["Node411"],
["Node410"],
["Node521"],
["Node531"],
["Node555"],
["Node554"],
["Node547"],
["Node542"],
["Node551"],
["Node570"],
["Node573"],
["Node581"],
["Node595"],
["Node617"],
["Node624"],
["Node632"],
["Node631"],
["Node643"],
["Node654"],
["Node663"],
["Node673"],
["Node672"],
["Node682"],
["Node681"],
["Node691"],
["Node690"],
["Node699"],
["Node703"],
["Node702"],
["Node711"],
["Node722"],
["Node734"],
["Node733"],
["Node762"],
["Node748"],
["Node757"],
["Node781"],
["Node777"],
["Node1164"],
["Node1161"],
["Node1157"],
["Node1156"],
["Node1148"],
["Node1138"],
["Node1137"],
["Node1128"],
["Node1133"],
["Node1111"],
["Node1110"],
["Node1115"],
["Node1079"],
["Node1078"],
["Node1092"],
["Node1091"],
["Node1099"],
["Node1098"],
["Node1104"],
["Node1103"],
["Node1070"],
["Node1064"],
["Node1067"],
["Node1057"],
["Node1056"],
["Node1055"],
["Node1049"],
["Node1052"],
["Node1040"],
["Node1043"],
["Node1031"],
["Node1030"],
["Node1021"],
["Node1020"],
["Node1016"],
["Node1015"],
["Node1011"],
["Node1010"],
["Node1006"],
["Node1005"],
["Node1001"],
["Node1000"],
["Node996"],
["Node995"],
["Node981"],
["Node976"],
["Node972"],
["Node971"],
["Node968"],
["Node965"],
["Node962"],
["Node959"],
["Node956"],
["Node953"],
["Node950"],
["Node947"],
["Node944"],
["Node941"],
["Node938"],
["Node934"],
["Node931"],
["Node928"],
["Node892"],
["Node868"],
["Node896"],
["Node902"],
["Node921"],
["Node826"],
["Node925"],
["Node987"],
["Node991"],
["Node990"],
["Node1"]
],
"RESOLVED": [
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004551989592110454],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.000444656459732233],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004467887240082508],
[445.9372821409138, 1015.191803925389, 1, 0, 0.3052004688658139, 0.002242467808923869, 0, -0.02624494049072515, 1, 0.3052004688658139, 0.000446842300576629],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004468958771449964],
[445.8315485451527, 1015.29753752115, 0, 1, 0.305128104557438, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.694871895442562, 1, 0.0004469092712870871],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004469360595712662],
[445.9129939204414, 1015.186869489064, 0, 1, 0.3051899497683169, 0, 0.0009850403212004633, 0.01152851537399644, 0.6948100502316832, 1, 0.0004469494537133544],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762907, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004469762419975305],
[445.9129939204414, 1015.223705738576, 0, 1, 0.3051822557222081, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.6948177442777919, 1, 0.000445205355196348],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004447601782965731],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.000447003030281704],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004447735055699942],
[445.8315485451526, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051281045574379, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948718954425621, 1, 0.0004470164244237898],
[446.0190314894725, 1015.142260363287, 1, 0, 0.305249690076253, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.305249690076253, 0.0004447868328434093],
[446.0190314894725, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3052342667344624, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052342667344623, 0.0004447868328434093],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004470298185658758],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470298185658758],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470298185658758],
[445.9129939204414, 1015.165696583887, 0, 1, 0.3051943723623285, 0, 0.0009850608657927264, 0.0115287558196337, 0.6948056276376715, 1, 0.0004448001601168215],
[445.9053803277268, 1015.223705738576, 0, 1, 0.305178635193833, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.694821364806167, 1, 0.0004470298185658758],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762907, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004470432127079598],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0004448134873902279],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0004470432127079598],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004470432127079598],
[446.2495303292534, 1014.879555737049, 0, 1, 0.3054141722211967, 0, 0.000985338599390503, 0.01153200630185553, 0.6945858277788033, 1, 0.0004448134873902279],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004475040844926495],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004115223129394976],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002449176664418155],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000446619798785591],
[445.942216577239, 1015.186869489064, 0, 1, 0.3052038460050224, 0, 0.0009850403212004631, 0.01152851537399644, 0.6947961539949776, 1, 0.0006915894123605519],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006915454693921627],
[444.7009187823792, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3050126234145715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002454832785600188],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004460671878423803],
[445.9944392957302, 1015.134646770573, 0, 1, 0.3052395873498421, 0, 0.0009850909957425647, 0.01152910844843727, 0.6947604126501579, 1, 0.0006916116740500615],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004109268130017956],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002804026384466117],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.000411155715801923],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915482961252559],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0004101234229928843],
[445.965485506273, 1015.288277143068, 0, 1, 0.3051937294571688, 0, 0.0009849419347319874, 0.01152736389837661, 0.6948062705428313, 1, 0.0006916937861100982],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006917367157447114],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.000691674608794433],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006917367322987143],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004453684327652974],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004263572612795774],
[444.6812604769333, 1013.506270902965, 0, 1, 0.3049547818147414, 0, 0.0009866737174788946, 0.01154763198648676, 0.6950452181852586, 1, 0.000526673651043678],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001650361855397933],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0001604560409552111],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0005310314176406363],
[446.1142701034246, 1014.879555737049, 0, 1, 0.305349866791385, 0, 0.000985338599390503, 0.01153200630185553, 0.694650133208615, 1, 0.0006917969549689993],
[445.888705699969, 1015.365056949372, 1, 0, 0.3051411856702739, 0.002242712110032415, 0, -0.02624779969255186, 1, 0.3051411856702739, 0.0006916895030579089],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.000280281345317138],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004112738591122947],
[444.9129939204414, 1013.004017007799, 0, 1, 0.3051703153097651, 0, 0.0009871629166425121, 0.011553357376562, 0.6948296846902349, 1, 0.0006951028598383389],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0006918868873022592],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006917084046354484],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006918081999064909],
[446.2495303292534, 1014.879555737049, 0, 1, 0.3054141722211966, 0, 0.0009853385993905028, 0.01153200630185553, 0.6945858277788034, 1, 0.0006915101867098483],
[445.4129939204414, 1015.716092145861, 0, 1, 0.30484164484029, 0, 0.0009845270816644654, 0.01152250862508074, 0.69515835515971, 1, 0.0006916986672840584],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0006918588438758912],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006912213180453545],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004467753298661552],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002204526147093508],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0004713390228243586],
[446.4129939204414, 1015.318979458458, 0, 1, 0.305400033693267, 0, 0.0009849121509905899, 0.01152701532145726, 0.694599966306733, 1, 0.0006937857705755284],
[445.9129939204414, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052121001701828, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947878998298171, 1, 0.0006917550189131605],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006919535291723063],
[444.765330355293, 1013.422201024605, 0, 0, 0.3050124354954585, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002431248182049189],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0004484472250388518],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002431340171959535],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004484407024497076],
[444.6424734687839, 1013.545057911114, 0, 0, 0.3049281823497791, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002597708470989672],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0004317258316770019],
[445.8315485451527, 1015.29753752115, 0, 1, 0.305128104557438, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.694871895442562, 1, 0.0006918982607206693],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002804036235709487],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000411155715801923],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006912573017344254],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006914965588438307],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00026234532627772],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004292344659512621],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0006917948688014898],
[446.3315485451526, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.6945296943292121, 1, 0.0006916696907803384],
[445.9053803277268, 1015.223705738576, 0, 1, 0.305178635193833, 0, 0.0009850045801210871, 0.01152809707479163, 0.694821364806167, 1, 0.0006919034398463235],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918245337794356],
[445.9129939204414, 1015.245314802659, 0, 1, 0.3051777423831116, 0, 0.0009849836147181607, 0.01152785170415577, 0.6948222576168883, 1, 0.000691402567795033],
[444.6999345968702, 1013.542857832526, 1, 0, 0.3049560312628128, 0.002248707324201702, 0, -0.02631796526571012, 1, 0.3049560312628128, 0.0006915663558937998],
[444.6181852483115, 1013.543161805795, 1, 0, 0.3049170012266231, 0.002249120780881955, 0, -0.02632280419625153, 1, 0.3049170012266231, 0.0006912470856003753],
[444.7777336946127, 1013.355982834746, 0, 1, 0.3050321987981117, 0, 0.0009868200483729482, 0.01154934458436268, 0.6949678012018883, 1, 0.000691312721190861],
[444.6424734687839, 1013.437428210034, 1, 0, 0.3049506909441843, 0.002248997924554333, 0, -0.02632136633525102, 1, 0.3049506909441844, 0.0006914676548584967],
[445.7777336946127, 1015.29753752115, 0, 1, 0.3051025107855534, 0, 0.0009849329512228513, 0.01152725875900215, 0.6948974892144466, 1, 0.0006917576306957326],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0003251141735211865],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0003663265713588712],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006917355808256132],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0006917759566959945],
[444.3739916000032, 1013.543019328237, 0, 0, 0.3048006081752726, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002714623192369979],
[445.6434927602223, 1015.350333080252, 1, 0, 0.3050276358997305, 0.002243946150332432, 0, -0.02626224240343859, 1, 0.3050276358997305, 0.0004200626101026572],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0003520109459528423],
[444.7009187823792, 1013.486612597519, 0, 0, 0.3049682631434614, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002658826920965638],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0004256397650643481],
[445.3155462864079, 1012.659909955428, 0, 0, 0.3054341857264729, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002793407514462808],
[446.1142701034246, 1014.908778393847, 0, 1, 0.3053437593351271, 0, 0.0009853102281591839, 0.01153167425638551, 0.6946562406648729, 1, 0.0004122559235261565],
[445.7501031698638, 1012.437428210034, 0, 0, 0.3056877758020917, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002657959888646847],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0004255724994164314],
[444.2399211028174, 1013.947610277081, 0, 0, 0.3046521188412772, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002795880165261497],
[445.5764575116294, 1015.552628554673, 0, 1, 0.3049535196860834, 0, 0.0009846855513762909, 0.01152436329079317, 0.6950464803139166, 1, 0.0004120048697803119],
[446.3315485451527, 1014.79753752115, 0, 1, 0.305470305670788, 0, 0.0009854182366688669, 0.01153293834450211, 0.694529694329212, 1, 0.0006914764657212051],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006917210610483454],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915914767857008],
[445.0190314894725, 1013.168499890426, 1, 0, 0.3051864193821123, 0.002247094908846963, 0, -0.02629909420550446, 1, 0.3051864193821123, 0.0006915789633421774],
[445.1250690585036, 1013.062462321394, 0, 0, 0.3052591381283292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002955183843661555],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0003957103460437227],
[445.8069563514103, 1015.322129714892, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006918104160669909],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006916519740037602],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000691612810657616],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006915577998081132],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002650974248819681],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004264177328439733],
[444.7009187823792, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3050126234145715, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00027800128635672],
[445.8069563514103, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051334178539777, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051334178539777, 0.0004135111836451782],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002786917441288856],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.000412830556947812],
[444.9129939204414, 1013.274537459457, 0, 0, 0.3051137006358953, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002827894106846309],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0004086804449107146],
[444.3254151590584, 1013.75448651976, 0, 0, 0.304733241743108, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002928701151481193],
[445.6192045397499, 1015.456066676013, 1, 0, 0.3049940090827419, 0.002244068455336957, 0, -0.02626367381197552, 1, 0.3049940090827419, 0.00039863024468484],
[445.1250690585036, 1013.062462321394, 0, 0, 0.3052591381283292, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002946949622572518],
[446.0190314894725, 1015.11005457683, 1, 0, 0.3052564183019988, 0.002242056794438834, 0, -0.02624013014265342, 1, 0.3052564183019988, 0.0003964697733690222],
[444.2399211028174, 1014.218130728738, 0, 0, 0.3045956107856058, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002739372427375767],
[445.5764575116294, 1015.687888780502, 0, 1, 0.3049252920200594, 0, 0.0009845544197643846, 0.01152282857919676, 0.6950747079799406, 1, 0.0004178268753769257],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006914687825403341],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006917874549708453],
[444.659292786262, 1013.528238593636, 1, 0, 0.3049397167492416, 0.002248912855804586, 0, -0.0263203707248499, 1, 0.3049397167492416, 0.0006919469331275687],
[445.8391621378672, 1015.289923928436, 1, 0, 0.305133315317245, 0.002242961329832145, 0, -0.02625071646076008, 1, 0.3051333153172451, 0.0006914977176805756],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006914743136731722],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 1, 0, 0.3051838459536401, 0.002242589952824782, 0, -0.02624637001377025, 1, 0.30518384595364, 0.0006915913863457415],
[446.1142701034246, 1014.908778393847, 0, 1, 0.3053437593351271, 0, 0.0009853102281591839, 0.01153167425638551, 0.6946562406648729, 1, 0.0006918573471924452],
[445.9372821409138, 1015.06712734235, 1, 0, 0.3052265135179402, 0.002242467808923869, 0, -0.02624494049072515, 1, 0.3052265135179402, 0.0006914024283087319],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006914611357165429],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006917972299339549],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006915635713151771],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006914633185779572],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918631885536315],
[446.0482541462702, 1015.080831920033, 0, 1, 0.3052764183533812, 0, 0.0009851432206718876, 0.011529719667986, 0.6947235816466188, 1, 0.0006914038708280973],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 1, 0.3051838459536401, 0, 0.0009850119671431733, 0.01152818352952435, 0.69481615404636, 1, 0.0006918636848144204],
[445.7777336946126, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006918634456048612],
[445.6434927602223, 1015.350333080252, 1, 0, 0.3050276358997305, 0.002243946150332432, 0, -0.02626224240343859, 1, 0.3050276358997305, 0.0006914830739565844],
[446.5472348548317, 1015.052628554673, 0, 1, 0.3055194831594753, 0, 0.0009851705930005751, 0.01153004002270175, 0.6944805168405247, 1, 0.0006915341479249777],
[444.5948812133481, 1013.59265016655, 1, 0, 0.3048955443972445, 0.002249238671553956, 0, -0.02632418394121766, 1, 0.3048955443972445, 0.0004538398360656075],
[444.7301414391769, 1013.457389940721, 0, 1, 0.3049883035403026, 0, 0.0009867213066140764, 0.01154818895056708, 0.6950116964596974, 1, 0.0004530606686684615],
[444.5948812133481, 1013.486612597519, 1, 0, 0.30491771763137, 0.002249238671553956, 0, -0.02632418394121766, 1, 0.30491771763137, 0.0006917863860882732],
[444.7009187823792, 1013.35135237169, 0, 1, 0.3049965543624797, 0, 0.0009868245576024129, 0.01154939735856907, 0.6950034456375203, 1, 0.0006923913293533927],
[444.6194734070905, 1013.568057972808, 0, 1, 0.3049124093019382, 0, 0.0009866135698870142, 0.01154692804328486, 0.6950875906980618, 1, 0.0006919951406821369],
[445.8069563514103, 1015.322129714893, 1, 0, 0.3051112736052813, 0.002243123364839878, 0, -0.02625261285326054, 1, 0.3051112736052812, 0.0006917297483337623],
[445.7777336946127, 1015.35135237169, 0, 1, 0.3050912735538989, 0, 0.000984880748584387, 0.01152664780033666, 0.6949087264461011, 1, 0.0006916117950809796],
[445.7117177374581, 1015.523405897876, 0, 1, 0.3050239557810479, 0, 0.0009847138866443451, 0.01152469491536362, 0.6949760442189521, 1, 0.0006911687821502527],
[444.683514372099, 1013.649860876418, 0, 1, 0.3049258296624526, 0, 0.0009865339488483566, 0.01154599619070127, 0.6950741703375474, 1, 0.001038773564899739],
[445.7117177374581, 1015.552628554673, 0, 2, 0.3050178558509446, 0, 0.001969371102752581, 0.02304872658158634, 0.4830001806860184, 1, 0.001037920033277123],
[445.9129939204414, 1015.216092145861, 0, 0, 0.3051838459536401, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0002465263601033493]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6246233958726652, 2.126023438050172, 1, 0, 0.2270823677432475, 1.600964687854661, 0, -18.73704621011325, 1, 0.2270823677432475, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406965522461589, 2.059303447753842, 1, 0, 0.3135655174153862, 1.063042059219031, 0, -12.44141631479205, 1, 0.3135655174153862, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300340225407502, 2.269965977459251, 1, 0, 0.24334467418025, 1.369799172536757, 0, -16.03157807858291, 1, 0.24334467418025, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003388209572073159, 2.996611790427927, 0, 1, 0.001129403190691053, 0, 0.3337102267281663, 3.905610152696047, 0.9988705968093089, 1, 0.08544381381685158],
[0.9964613502833656, 2.003538649716634, 0, 1, 0.3321537834277886, 0, 0.4991169000615151, 5.841463270019406, 0.6678462165722114, 1, 0.08544381381685158],
[0.6733118998265036, 2.077334934096335, 0, 1, 0.2447831148378503, 0, 0.4813860218621951, 5.633948209451932, 0.7552168851621497, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9417912170455573, 2.058208782954443, 0, 1, 0.3139304056818524, 0, 0.4858593590124303, 5.686302346637611, 0.6860695943181476, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9841750427874307, 2.015824957212569, 1, 0, 0.3280583475958103, 1.016079413239081, 0, -11.89178441188314, 1, 0.3280583475958103, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406960750360942, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3198889144042362, 1.063042598494557, 0, -12.4414226262557, 1, 0.3198889144042362, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.730703020950951, 2.26929697904905, 1, 0, 0.2435676736503169, 1.368545046794224, 0, -16.01690029576271, 1, 0.243567673650317, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -5.851798716191999, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995739788116209, 2.000426021188378, 0, 1, 0.3331913262705404, 0, 0.4998935173848306, 5.850552486530505, 0.6668086737294596, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315381517336, 2.16250641140462, 1, 0, 0.2523844287898463, 1.369803834135389, 0, -16.03163263605668, 1, 0.2523844287898463, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406965658913032, 2.059303434108697, 1, 0, 0.3135655219637677, 1.063042043799221, 0, -12.4414161343248, 1, 0.3135655219637676, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305745443502437, 2.269425455649758, 0, 1, 0.2435248481167478, 0, 0.4406401618129778, 5.157075066399633, 0.7564751518832522, 1, 0.08544381381685158],
[0.7324206503158607, 2.26757934968414, 1, 0, 0.2441402167719535, 1.365335616313855, 0, -15.97933841343325, 1, 0.2441402167719535, 0.08544381381685158],
[0.9403946932140614, 2.059605306785939, 1, 0, 0.3134648977380204, 1.063383287056013, 0, -12.44540990802881, 1, 0.3134648977380203, 0.08544381381685158],
[0.9982392368660997, 2.001760763133899, 0, 1, 0.3327464122887, 0, 0.4995601964114976, 5.846651432042846, 0.6672535877112999, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9315751370323221, 2.068424862967679, 3, 0, 0.3105250456774406, 3.220352154907191, 0, -37.68970521154405, 0.9999999999999998, 0.02994262718940321, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995740171136658, 2.000425982886333, 0, 1, 0.3331913390378887, 0, 0.499893526956264, 5.850552598550709, 0.6668086609621113, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9959523186267951, 2.004047681373204, 0, 1, 0.3319841062089318, 0, 0.4989901234858767, 5.839979528014278, 0.6680158937910682, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.3391980312999304, 2.660801968700069, 0, 1, 0.1130660104333102, 0, 0.3758265409313977, 4.398522539466463, 0.8869339895666898, 1, 0.08544381381685158],
[1.383418507783979, 1.350334935818472, 0, 3, 0.5060509428973797, 0, 2.221671024294151, 26.00154329553094, 0.1205164921432079, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406962280081308, 2.05930377199187, 1, 0, 0.3135654093360435, 1.063042425627071, 0, -12.44142060308424, 1, 0.3135654093360435, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9829794739726135, 2.017020526027386, 1, 0, 0.3276598246575379, 1.017315240529489, 0, -11.90624803698603, 1, 0.327659824657538, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9403514994532168, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3198092131597475, 1.06343213211386, 0, -12.44598157092241, 1, 0.3198092131597474, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3296508243167561, 2.670349175683243, 0, 1, 0.1098836081055854, 0, 0.3744828613075056, 4.382796654070334, 0.8901163918944146, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.025359333295111, 0, 0, 0.2356718421793983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995739022075313, 2.000426097792467, 0, 1, 0.3331913007358439, 0, 0.4998934982419651, 5.850552262490115, 0.6668086992641561, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[4.20159377106425, 8.15762407657845, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01647386242532789],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6249213121089952, 2.126734816857086, 0, 1, 0.2271073429308937, 0, 0.4702043677818807, 5.503082631467757, 0.7728926570691064, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999847138723, 0, 1, 0.3333503187851393, 0, 0.5000382182402946, 5.852246007090978, 0.6666496812148608, 1, 0.08544381381685158],
[1.001629635245379, 1.9972752285689, 0, 1, 0.3339984696851689, 0, 0.5006821221712775, 5.859781999484332, 0.666001530314831, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7299885201314618, 2.270011479868539, 1, 0, 0.2433295067104872, 1.369884556293998, 0, -16.03257737570492, 1, 0.2433295067104871, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.940999896380557, 2.059000103619444, 1, 0, 0.3136666321268523, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3136666321268522, 0.08544381381685158],
[0.9999601667713808, 2.000039833228618, 1, 1, 0.3333200555904604, 1.000039834815369, 0.4999900418911772, -5.852381472531712, 0.8888977405411727, 0.555537851722093, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989053393507277, 2.001094660649271, 1, 1, 0.3329684464502426, 1.001095860244359, 0.4997264845409871, -5.867825338157948, 0.8891320136685117, 0.5550689065689973, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989047585575265, 2.001095241442473, 0, 1, 0.3329682528525089, 0, 0.4997263395015414, 5.848595903884891, 0.6670317471474911, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9982395006427429, 2.001760499357256, 0, 1, 0.3327465002142477, 0, 0.4995602622397082, 5.846652202469723, 0.6672534997857522, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305740622637156, 2.269425937736286, 0, 1, 0.2435246874212385, 0, 0.4406400682092685, 5.157073970899502, 0.7564753125787615, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989048633790014, 2.001095136620997, 0, 1, 0.3329682877930006, 0, 0.4997263656782339, 5.848596210246362, 0.6670317122069994, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.025359333295111, 0, 0, 0.2356718421793983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.702266930724494, 2.296724199371233, 1, 0, 0.2341677251649884, 1.42395997340833, 0, -16.66545428859931, 1, 0.2341677251649884, 0.08544381381685158],
[0.9403665264891601, 2.05963347351084, 1, 0, 0.31345550882972, 1.063415138492307, 0, -12.44578268441683, 1, 0.31345550882972, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.004059894681566152, 1.751842669947907, 0, 1, 0.002312141210650183, 0, 0.5708275161660127, 6.680735452534678, 0.9976878587893498, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406961378863248, 2.059303862113675, 1, 0, 0.3135653792954416, 1.063042527470057, 0, -12.44142179501355, 1, 0.3135653792954416, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9406963036757031, 2.059303696324298, 1, 0, 0.3135654345585676, 1.063042340118242, 0, -12.44141960232333, 1, 0.3135654345585677, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989052619238021, 2.001094738076197, 0, 1, 0.3329684206412675, 0, 0.4997264652054282, 5.848597375072577, 0.6670315793587325, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9972753112745176, 2.002724688725481, 0, 1, 0.3324251037581726, 0, 0.4993197545471876, 5.84383739725707, 0.6675748962418273, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9839651453860491, 2.016034854613951, 1, 0, 0.3279883817953497, 1.016296161189388, 0, -11.89432114263783, 1, 0.3279883817953497, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.996174822743204, 2.003825177256795, 0, 1, 0.3320582742477348, 0, 0.4990455311919896, 5.840627997501275, 0.6679417257522653, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7020703929780645, 2.297929607021935, 0, 0, 0.2340234643260215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.2694243745586, 0, 1, 0.2432487225655387, 0, 0.4406403717217935, 5.15707752308791, 0.7567512774344614, 1, 0.08544381381685158],
[0.9912432529195494, 2.005272773632501, 0, 2, 0.3307985821321056, 0, 0.9973705454430771, 11.67282335478302, 0.4478305376764002, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.2694253818579, 0, 1, 0.2432486408609586, 0, 0.4406401761406823, 5.157075234085319, 0.7567513591390413, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.401962703688893, 1.329494151535637, 1, 0, 0.5132655494840863, 0.7132857367523155, 0, -8.348009117210525, 1, 0.5132655494840863, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406961351360231, 2.059303864863978, 1, 0, 0.3135653783786743, 1.063042530578061, 0, -12.44142183138838, 1, 0.3135653783786743, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003387263040797253, 2.996612736959203, 0, 1, 0.001129087680265751, 0, 0.3337101213200958, 3.905608919042424, 0.9988709123197342, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9411578097660873, 2.058842190233913, 1, 1, 0.313719269922029, 1.062521066736446, 0.4857098833234936, -6.750765885162198, 0.901580219679589, 0.5290187595236472, 0.08544381381685158],
[0.9986808674332055, 2.001319132566794, 0, 2, 0.3328936224777352, 0, 0.9993408684575449, 11.69588322215611, 0.4450309189308784, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.001629777508648, 1.939066299384862, 0, 1, 0.3406097574580874, 0, 0.5157121240863368, 6.035687091306146, 0.6593902425419126, 1, 0.08544381381685158],
[0.9398076205039092, 2.060192379496091, 2, 0, 0.3132692068346363, 2.128095108366575, 0, -24.90636844614798, 1, 0.09813759595080218, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9395332863831762, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3196198834472751, 2.128716490396197, 0, -24.91364085127439, 1, 0.1021568698948497, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.998237421636554, 2.001762578363445, 0, 1, 0.3327458072121848, 0, 0.4995597434025153, 5.846646130208084, 0.6672541927878153, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9984615523896304, 2.001538447610368, 0, 1, 0.3328205174632103, 0, 0.4996156837226371, 5.847300833195029, 0.6671794825367897, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995740043463175, 2.000425995653682, 0, 1, 0.3331913347821059, 0, 0.4998935237657861, 5.85055256121064, 0.6668086652178941, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989048201561614, 2.001095179843837, 0, 1, 0.3329682733853873, 0, 0.4997263548843481, 5.848596083919069, 0.6670317266146127, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.398748770908548, 1.332259512848656, 0, 1, 0.5121730238709529, 0, 0.7506045108747516, 8.784773026209585, 0.4878269761290471, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.269812768289892, 0, 1, 0.2432172230419793, 0, 0.440564972569704, 5.156195081765111, 0.7567827769580208, 1, 0.08544381381685158],
[0.8377684963571409, 2.162231503642859, 0, 1, 0.2792561654523804, 0, 0.4624851678995667, 5.412740223545048, 0.7207438345476196, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9992949678613131, 2.000705032138686, 0, 1, 0.3330983226204378, 0, 0.4998238040772227, 5.849736590042583, 0.6669016773795622, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9409998963805569, 2.059000103619444, 1, 0, 0.3136666321268522, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3136666321268522, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -5.851798716191999, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3286791633205281, 2.671320836679471, 0, 1, 0.1095597211068427, 0, 0.3743466476467981, 4.381202464220622, 0.8904402788931572, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9847728145707974, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3282576048569325, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9409999130029688, 2.059000086997032, 1, 0, 0.3136666376676562, 1.062699354358862, 0, -12.4374054350705, 1, 0.3136666376676562, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305749323900411, 2.26942506760996, 0, 1, 0.243524977463347, 0, 0.4406402371562538, 5.157075948187005, 0.756475022536653, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.000276137395354, 0, 2, 0.3200573869806835, 0, 0.9998619503626568, 11.70198175500284, 0.462321956999536, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.125888109941489, 0, 1, 0.2270578458092391, 0, 0.470391642590975, 5.505274420442623, 0.7729421541907608, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.938170034206959, 1.061209982348708, 1, 0, 0.6461902204818493, 0.5159506041012392, 0, -6.038478165396232, 1, 0.6461902204818493, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003388822768480536, 2.99661117723152, 0, 1, 0.001129607589493512, 0, 0.3337102950152747, 3.905610951900873, 0.9988703924105065, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.939373656762162, 1.059531703935564, 1, 0, 0.6466938510893678, 0.5156303925822772, 0, -6.034730538685089, 1, 0.6466938510893678, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7301837019852933, 2.269816298014708, 0, 1, 0.243394567328431, 0, 0.4405642874600243, 5.156187063517224, 0.756605432671569, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.938517296461798, 1.059958264647964, 2, 0, 0.6465009492171202, 1.031716355407517, 0, -12.07479288809599, 1, 0.4179634773386374, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989051569281653, 2.001094843071834, 0, 1, 0.3329683856427219, 0, 0.4997264389852324, 5.848597068201961, 0.6670316143572781, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6782060068456962, 1.384049513648778, 0, 1, 0.3288661371521412, 0, 0.7225175039899362, 8.456054004549108, 0.6711338628478587, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315381517336, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2674077306249636, 1.369803834135389, 0, -16.03163263605668, 1, 0.2674077306249636, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9984941137968252, 2.001505886203174, 0, 1, 0.3328313712656085, 0, 0.4996238116975937, 5.847395959741861, 0.6671686287343915, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.004688760960242427, 2.995311239039758, 0, 1, 0.001562920320080809, 0, 0.3338551222879201, 3.907305951997146, 0.9984370796799192, 1, 0.08544381381685158],
[0.7303377967273048, 2.269662203272696, 1, 0, 0.2434459322424349, 1.36922942298902, 0, -16.02490995923891, 1, 0.2434459322424348, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.940999896380557, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3199591735921621, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3199591735921621, 0.08544381381685158],
[0.7504502145726676, 2.001205908143735, 1, 0, 0.2727267438606507, 1.332533432040438, 0, -15.5954348537943, 1, 0.2727267438606507, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315050728807, 2.266672477302954, 1, 1, 0.243611484272831, 1.369803896203312, 0.4411753396281893, -10.86829479037106, 0.9406534447303883, 0.4278764132760502, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.002287194009434, 1.938062538639312, 0, 1, 0.3408734623913419, 0, 0.5159792215487984, 6.038813092482008, 0.6591265376086581, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989047589644465, 2.001095241035552, 0, 1, 0.332968252988149, 0, 0.4997263396031602, 5.848595905074196, 0.667031747011851, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999383469586208, 2.000061653041378, 1, 2, 0.3333127823195404, 1.000061656842711, 0.9999691744295559, -0.001082376933142359, 0.7407681416701033, 0.7036763015072827, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9841751001582505, 2.015824899841749, 1, 0, 0.3280583667194169, 1.016079354008453, 0, -11.89178371867172, 1, 0.3280583667194169, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158]
],
"RESOLVED": [
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6246233958726652, 2.126023438050172, 1, 0, 0.2270823677432475, 1.600964687854661, 0, -18.73704621011325, 1, 0.2270823677432475, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406965522461589, 2.059303447753842, 1, 0, 0.3135655174153862, 1.063042059219031, 0, -12.44141631479205, 1, 0.3135655174153862, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300340225407502, 2.269965977459251, 1, 0, 0.24334467418025, 1.369799172536757, 0, -16.03157807858291, 1, 0.24334467418025, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003388209572073159, 2.996611790427927, 0, 1, 0.001129403190691053, 0, 0.3337102267281663, 3.905610152696047, 0.9988705968093089, 1, 0.08544381381685158],
[0.9964613502833656, 2.003538649716634, 0, 1, 0.3321537834277886, 0, 0.4991169000615151, 5.841463270019406, 0.6678462165722114, 1, 0.08544381381685158],
[0.6733118998265036, 2.077334934096335, 0, 1, 0.2447831148378503, 0, 0.4813860218621951, 5.633948209451932, 0.7552168851621497, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9417912170455573, 2.058208782954443, 0, 1, 0.3139304056818524, 0, 0.4858593590124303, 5.686302346637611, 0.6860695943181476, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9841750427874307, 2.015824957212569, 1, 0, 0.3280583475958103, 1.016079413239081, 0, -11.89178441188314, 1, 0.3280583475958103, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406960750360942, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3198889144042362, 1.063042598494557, 0, -12.4414226262557, 1, 0.3198889144042362, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.730703020950951, 2.26929697904905, 1, 0, 0.2435676736503169, 1.368545046794224, 0, -16.01690029576271, 1, 0.243567673650317, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -5.851798716191999, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995739788116209, 2.000426021188378, 0, 1, 0.3331913262705404, 0, 0.4998935173848306, 5.850552486530505, 0.6668086737294596, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315381517336, 2.16250641140462, 1, 0, 0.2523844287898463, 1.369803834135389, 0, -16.03163263605668, 1, 0.2523844287898463, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406965658913032, 2.059303434108697, 1, 0, 0.3135655219637677, 1.063042043799221, 0, -12.4414161343248, 1, 0.3135655219637676, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305745443502437, 2.269425455649758, 0, 1, 0.2435248481167478, 0, 0.4406401618129778, 5.157075066399633, 0.7564751518832522, 1, 0.08544381381685158],
[0.7324206503158607, 2.26757934968414, 1, 0, 0.2441402167719535, 1.365335616313855, 0, -15.97933841343325, 1, 0.2441402167719535, 0.08544381381685158],
[0.9403946932140614, 2.059605306785939, 1, 0, 0.3134648977380204, 1.063383287056013, 0, -12.44540990802881, 1, 0.3134648977380203, 0.08544381381685158],
[0.9982392368660997, 2.001760763133899, 0, 1, 0.3327464122887, 0, 0.4995601964114976, 5.846651432042846, 0.6672535877112999, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9315751370323221, 2.068424862967679, 3, 0, 0.3105250456774406, 3.220352154907191, 0, -37.68970521154405, 0.9999999999999998, 0.02994262718940321, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995740171136658, 2.000425982886333, 0, 1, 0.3331913390378887, 0, 0.499893526956264, 5.850552598550709, 0.6668086609621113, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9959523186267951, 2.004047681373204, 0, 1, 0.3319841062089318, 0, 0.4989901234858767, 5.839979528014278, 0.6680158937910682, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.3391980312999304, 2.660801968700069, 0, 1, 0.1130660104333102, 0, 0.3758265409313977, 4.398522539466463, 0.8869339895666898, 1, 0.08544381381685158],
[1.383418507783979, 1.350334935818472, 0, 3, 0.5060509428973797, 0, 2.221671024294151, 26.00154329553094, 0.1205164921432079, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406962280081308, 2.05930377199187, 1, 0, 0.3135654093360435, 1.063042425627071, 0, -12.44142060308424, 1, 0.3135654093360435, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9829794739726135, 2.017020526027386, 1, 0, 0.3276598246575379, 1.017315240529489, 0, -11.90624803698603, 1, 0.327659824657538, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9403514994532168, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3198092131597475, 1.06343213211386, 0, -12.44598157092241, 1, 0.3198092131597474, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3296508243167561, 2.670349175683243, 0, 1, 0.1098836081055854, 0, 0.3744828613075056, 4.382796654070334, 0.8901163918944146, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.025359333295111, 0, 0, 0.2356718421793983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995739022075313, 2.000426097792467, 0, 1, 0.3331913007358439, 0, 0.4998934982419651, 5.850552262490115, 0.6668086992641561, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[4.20159377106425, 8.15762407657845, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.01647386242532789],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6249213121089952, 2.126734816857086, 0, 1, 0.2271073429308937, 0, 0.4702043677818807, 5.503082631467757, 0.7728926570691064, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999847138723, 0, 1, 0.3333503187851393, 0, 0.5000382182402946, 5.852246007090978, 0.6666496812148608, 1, 0.08544381381685158],
[1.001629635245379, 1.9972752285689, 0, 1, 0.3339984696851689, 0, 0.5006821221712775, 5.859781999484332, 0.666001530314831, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7299885201314618, 2.270011479868539, 1, 0, 0.2433295067104872, 1.369884556293998, 0, -16.03257737570492, 1, 0.2433295067104871, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.940999896380557, 2.059000103619444, 1, 0, 0.3136666321268523, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3136666321268522, 0.08544381381685158],
[0.9999601667713808, 2.000039833228618, 1, 1, 0.3333200555904604, 1.000039834815369, 0.4999900418911772, -5.852381472531712, 0.8888977405411727, 0.555537851722093, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989053393507277, 2.001094660649271, 1, 1, 0.3329684464502426, 1.001095860244359, 0.4997264845409871, -5.867825338157948, 0.8891320136685117, 0.5550689065689973, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989047585575265, 2.001095241442473, 0, 1, 0.3329682528525089, 0, 0.4997263395015414, 5.848595903884891, 0.6670317471474911, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9982395006427429, 2.001760499357256, 0, 1, 0.3327465002142477, 0, 0.4995602622397082, 5.846652202469723, 0.6672534997857522, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305740622637156, 2.269425937736286, 0, 1, 0.2435246874212385, 0, 0.4406400682092685, 5.157073970899502, 0.7564753125787615, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989048633790014, 2.001095136620997, 0, 1, 0.3329682877930006, 0, 0.4997263656782339, 5.848596210246362, 0.6670317122069994, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.025359333295111, 0, 0, 0.2356718421793983, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.702266930724494, 2.296724199371233, 1, 0, 0.2341677251649884, 1.42395997340833, 0, -16.66545428859931, 1, 0.2341677251649884, 0.08544381381685158],
[0.9403665264891601, 2.05963347351084, 1, 0, 0.31345550882972, 1.063415138492307, 0, -12.44578268441683, 1, 0.31345550882972, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.004059894681566152, 1.751842669947907, 0, 1, 0.002312141210650183, 0, 0.5708275161660127, 6.680735452534678, 0.9976878587893498, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406961378863248, 2.059303862113675, 1, 0, 0.3135653792954416, 1.063042527470057, 0, -12.44142179501355, 1, 0.3135653792954416, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9406963036757031, 2.059303696324298, 1, 0, 0.3135654345585676, 1.063042340118242, 0, -12.44141960232333, 1, 0.3135654345585677, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989052619238021, 2.001094738076197, 0, 1, 0.3329684206412675, 0, 0.4997264652054282, 5.848597375072577, 0.6670315793587325, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9972753112745176, 2.002724688725481, 0, 1, 0.3324251037581726, 0, 0.4993197545471876, 5.84383739725707, 0.6675748962418273, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3269271823759705, 2.673072817624029, 0, 0, 0.1089757274586569, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9839651453860491, 2.016034854613951, 1, 0, 0.3279883817953497, 1.016296161189388, 0, -11.89432114263783, 1, 0.3279883817953497, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.996174822743204, 2.003825177256795, 0, 1, 0.3320582742477348, 0, 0.4990455311919896, 5.840627997501275, 0.6679417257522653, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7020703929780645, 2.297929607021935, 0, 0, 0.2340234643260215, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.2694243745586, 0, 1, 0.2432487225655387, 0, 0.4406403717217935, 5.15707752308791, 0.7567512774344614, 1, 0.08544381381685158],
[0.9912432529195494, 2.005272773632501, 0, 2, 0.3307985821321056, 0, 0.9973705454430771, 11.67282335478302, 0.4478305376764002, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.2694253818579, 0, 1, 0.2432486408609586, 0, 0.4406401761406823, 5.157075234085319, 0.7567513591390413, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.401962703688893, 1.329494151535637, 1, 0, 0.5132655494840863, 0.7132857367523155, 0, -8.348009117210525, 1, 0.5132655494840863, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9406961351360231, 2.059303864863978, 1, 0, 0.3135653783786743, 1.063042530578061, 0, -12.44142183138838, 1, 0.3135653783786743, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003387263040797253, 2.996612736959203, 0, 1, 0.001129087680265751, 0, 0.3337101213200958, 3.905608919042424, 0.9988709123197342, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9411578097660873, 2.058842190233913, 1, 1, 0.313719269922029, 1.062521066736446, 0.4857098833234936, -6.750765885162198, 0.901580219679589, 0.5290187595236472, 0.08544381381685158],
[0.9986808674332055, 2.001319132566794, 0, 2, 0.3328936224777352, 0, 0.9993408684575449, 11.69588322215611, 0.4450309189308784, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.001629777508648, 1.939066299384862, 0, 1, 0.3406097574580874, 0, 0.5157121240863368, 6.035687091306146, 0.6593902425419126, 1, 0.08544381381685158],
[0.9398076205039092, 2.060192379496091, 2, 0, 0.3132692068346363, 2.128095108366575, 0, -24.90636844614798, 1, 0.09813759595080218, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9395332863831762, 1.999999999999999, 2, 0, 0.3196198834472751, 2.128716490396197, 0, -24.91364085127439, 1, 0.1021568698948497, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.998237421636554, 2.001762578363445, 0, 1, 0.3327458072121848, 0, 0.4995597434025153, 5.846646130208084, 0.6672541927878153, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9984615523896304, 2.001538447610368, 0, 1, 0.3328205174632103, 0, 0.4996156837226371, 5.847300833195029, 0.6671794825367897, 1, 0.08544381381685158],
[0.9995740043463175, 2.000425995653682, 0, 1, 0.3331913347821059, 0, 0.4998935237657861, 5.85055256121064, 0.6668086652178941, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989048201561614, 2.001095179843837, 0, 1, 0.3329682733853873, 0, 0.4997263548843481, 5.848596083919069, 0.6670317266146127, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.398748770908548, 1.332259512848656, 0, 1, 0.5121730238709529, 0, 0.7506045108747516, 8.784773026209585, 0.4878269761290471, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.269812768289892, 0, 1, 0.2432172230419793, 0, 0.440564972569704, 5.156195081765111, 0.7567827769580208, 1, 0.08544381381685158],
[0.8377684963571409, 2.162231503642859, 0, 1, 0.2792561654523804, 0, 0.4624851678995667, 5.412740223545048, 0.7207438345476196, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9992949678613131, 2.000705032138686, 0, 1, 0.3330983226204378, 0, 0.4998238040772227, 5.849736590042583, 0.6669016773795622, 1, 0.08544381381685158],
[0, 3, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9409998963805569, 2.059000103619444, 1, 0, 0.3136666321268522, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3136666321268522, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 1, 0.3333333333333333, 1, 0.5000000000000002, -5.851798716191999, 0.8888888888888891, 0.5555555555555555, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.3286791633205281, 2.671320836679471, 0, 1, 0.1095597211068427, 0, 0.3743466476467981, 4.381202464220622, 0.8904402788931572, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9847728145707974, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3282576048569325, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.8371092494224494, 2.16289075057755, 0, 0, 0.2790364164741498, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0, 1.751007246641488, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9409999130029688, 2.059000086997032, 1, 0, 0.3136666376676562, 1.062699354358862, 0, -12.4374054350705, 1, 0.3136666376676562, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7305749323900411, 2.26942506760996, 0, 1, 0.243524977463347, 0, 0.4406402371562538, 5.157075948187005, 0.756475022536653, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.000276137395354, 0, 2, 0.3200573869806835, 0, 0.9998619503626568, 11.70198175500284, 0.462321956999536, 1, 0.08544381381685158],
[1.941554686404666, 1.058445313595334, 0, 0, 0.6471848954682221, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.125888109941489, 0, 1, 0.2270578458092391, 0, 0.470391642590975, 5.505274420442623, 0.7729421541907608, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.938170034206959, 1.061209982348708, 1, 0, 0.6461902204818493, 0.5159506041012392, 0, -6.038478165396232, 1, 0.6461902204818493, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.015227185429203, 0, 0, 0.3184390080897955, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 2.077574016298809, 0, 0, 0.2446961962994449, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.003388822768480536, 2.99661117723152, 0, 1, 0.001129607589493512, 0, 0.3337102950152747, 3.905610951900873, 0.9988703924105065, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.939373656762162, 1.059531703935564, 1, 0, 0.6466938510893678, 0.5156303925822772, 0, -6.034730538685089, 1, 0.6466938510893678, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7301837019852933, 2.269816298014708, 0, 1, 0.243394567328431, 0, 0.4405642874600243, 5.156187063517224, 0.756605432671569, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.938517296461798, 1.059958264647964, 2, 0, 0.6465009492171202, 1.031716355407517, 0, -12.07479288809599, 1, 0.4179634773386374, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989051569281653, 2.001094843071834, 0, 1, 0.3329683856427219, 0, 0.4997264389852324, 5.848597068201961, 0.6670316143572781, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6782060068456962, 1.384049513648778, 0, 1, 0.3288661371521412, 0, 0.7225175039899362, 8.456054004549108, 0.6711338628478587, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315381517336, 1.999999999999999, 1, 0, 0.2674077306249636, 1.369803834135389, 0, -16.03163263605668, 1, 0.2674077306249636, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7506468339228375, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2728982960172688, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.402552365966497, 1.326927182375971, 0, 0, 0.5138534072615513, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9984941137968252, 2.001505886203174, 0, 1, 0.3328313712656085, 0, 0.4996238116975937, 5.847395959741861, 0.6671686287343915, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 1.999999999999999, 0, 0, 0.2672595765685289, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.649855709974366, 0, 0, 0.3773790385023166, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.004688760960242427, 2.995311239039758, 0, 1, 0.001562920320080809, 0, 0.3338551222879201, 3.907305951997146, 0.9984370796799192, 1, 0.08544381381685158],
[0.7303377967273048, 2.269662203272696, 1, 0, 0.2434459322424349, 1.36922942298902, 0, -16.02490995923891, 1, 0.2434459322424348, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.940999896380557, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3199591735921621, 1.062699373131049, 0, -12.43740565477262, 1, 0.3199591735921621, 0.08544381381685158],
[0.7504502145726676, 2.001205908143735, 1, 0, 0.2727267438606507, 1.332533432040438, 0, -15.5954348537943, 1, 0.2727267438606507, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.976782892350337, 0, 0, 0.2540035727570014, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.16289075057755, 0, 0, 0.252208214354451, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7300315050728807, 2.266672477302954, 1, 1, 0.243611484272831, 1.369803896203312, 0.4411753396281893, -10.86829479037106, 0.9406534447303883, 0.4278764132760502, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.5000000000000002, 5.851798716191999, 0.6666666666666667, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 2.126150457243581, 0, 0, 0.2270361898072645, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 2.058445313595334, 0, 0, 0.3138515621348886, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.002287194009434, 1.938062538639312, 0, 1, 0.3408734623913419, 0, 0.5159792215487984, 6.038813092482008, 0.6591265376086581, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9989047589644465, 2.001095241035552, 0, 1, 0.332968252988149, 0, 0.4997263396031602, 5.848595905074196, 0.667031747011851, 1, 0.08544381381685158],
[0.7294795483424672, 2.270520451657533, 0, 0, 0.243159849447489, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9415546864046659, 1.999999999999999, 0, 0, 0.32008743225355, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6730728176240296, 1.385372495971304, 0, 0, 0.3269811508610949, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999383469586208, 2.000061653041378, 1, 2, 0.3333127823195404, 1.000061656842711, 0.9999691744295559, -0.001082376933142359, 0.7407681416701033, 0.7036763015072827, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9841751001582505, 2.015824899841749, 1, 0, 0.3280583667194169, 1.016079354008453, 0, -11.89178371867172, 1, 0.3280583667194169, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 1, 0, 0.3333333333333333, 1, 0, -11.703597432384, 1, 0.3333333333333333, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.941554686404666, 0, 0, 0.3399562838732249, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.9999999999999997, 1.999999999999999, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[1.353975925021723, 1.538394373898294, 0, 0, 0.4681198411998921, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158],
[0.6244963766792564, 1.433948936916077, 0, 0, 0.3033825443671831, 0, 0, 0, 1, 1, 0.08544381381685158]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node1":{
"Global MG94xREV":0.0002465263601033493,
"Nucleotide GTR":0.0002377116967508821,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "S", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "TCA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1000":{
"Global MG94xREV":0.0003964697733690222,
"Nucleotide GTR":0.0003822938143348165,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1001":{
"Global MG94xREV":0.0002946949622572518,
"Nucleotide GTR":0.0002841580083879913,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1005":{
"Global MG94xREV":0.00039863024468484,
"Nucleotide GTR":0.0003843770370054036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1006":{
"Global MG94xREV":0.0002928701151481193,
"Nucleotide GTR":0.0002823984095262671,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1010":{
"Global MG94xREV":0.0004086804449107146,
"Nucleotide GTR":0.0003940678877013581,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1011":{
"Global MG94xREV":0.0002827894106846309,
"Nucleotide GTR":0.0002726781452857393,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1015":{
"Global MG94xREV":0.000412830556947812,
"Nucleotide GTR":0.0003980696105744467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1016":{
"Global MG94xREV":0.0002786917441288856,
"Nucleotide GTR":0.0002687269926817047,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1020":{
"Global MG94xREV":0.0004135111836451782,
"Nucleotide GTR":0.0003987259011513125,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1021":{
"Global MG94xREV":0.00027800128635672,
"Nucleotide GTR":0.0002680612225446391,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1030":{
"Global MG94xREV":0.0004264177328439733,
"Nucleotide GTR":0.0004111709707493793,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1031":{
"Global MG94xREV":0.0002650974248819681,
"Nucleotide GTR":0.0002556187445698062,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1040":{
"Global MG94xREV":0.000691612810657616,
"Nucleotide GTR":0.000666883876625391,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1043":{
"Global MG94xREV":0.0006915577998081132,
"Nucleotide GTR":0.0006668308327141036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1049":{
"Global MG94xREV":0.0006918104160669909,
"Nucleotide GTR":0.0006670744165624975,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1052":{
"Global MG94xREV":0.0006916519740037602,
"Nucleotide GTR":0.0006669216396680866,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTG", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1055":{
"Global MG94xREV":0.0003957103460437227,
"Nucleotide GTR":0.0003815615406826999,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1056":{
"Global MG94xREV":0.0002955183843661555,
"Nucleotide GTR":0.0002849519886608014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1057":{
"Global MG94xREV":0.0006915789633421774,
"Nucleotide GTR":0.0006668512395362777,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1064":{
"Global MG94xREV":0.0006917210610483454,
"Nucleotide GTR":0.0006669882564736275,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1067":{
"Global MG94xREV":0.0006915914767857008,
"Nucleotide GTR":0.0006668633055558734,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1070":{
"Global MG94xREV":0.0006914764657212051,
"Nucleotide GTR":0.0006667524067648682,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1078":{
"Global MG94xREV":0.0004256397650643481,
"Nucleotide GTR":0.0004104208195654055,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1079":{
"Global MG94xREV":0.0002658826920965638,
"Nucleotide GTR":0.0002563759341940968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1091":{
"Global MG94xREV":0.0004122559235261565,
"Nucleotide GTR":0.0003975155234349852,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1092":{
"Global MG94xREV":0.0002793407514462808,
"Nucleotide GTR":0.0002693527944440684,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1098":{
"Global MG94xREV":0.0004255724994164314,
"Nucleotide GTR":0.0004103559590316573,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1099":{
"Global MG94xREV":0.0002657959888646847,
"Nucleotide GTR":0.0002562923310761375,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1103":{
"Global MG94xREV":0.0004120048697803119,
"Nucleotide GTR":0.0003972734462312522,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1104":{
"Global MG94xREV":0.0002795880165261497,
"Nucleotide GTR":0.0002695912184473199,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1110":{
"Global MG94xREV":0.0004200626101026572,
"Nucleotide GTR":0.0004050430783436139,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1111":{
"Global MG94xREV":0.0002714623192369979,
"Nucleotide GTR":0.0002617560592007446,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1115":{
"Global MG94xREV":0.0003520109459528423,
"Nucleotide GTR":0.0003394246327340161,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1128":{
"Global MG94xREV":0.0006917355808256132,
"Nucleotide GTR":0.0006670022570895838,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1133":{
"Global MG94xREV":0.0006917759566959945,
"Nucleotide GTR":0.0006670411893021557,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1137":{
"Global MG94xREV":0.0003663265713588712,
"Nucleotide GTR":0.0003532283963716677,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1138":{
"Global MG94xREV":0.0003251141735211865,
"Nucleotide GTR":0.0003134895667671523,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1148":{
"Global MG94xREV":0.0006917576306957326,
"Nucleotide GTR":0.0006670235185564596,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1156":{
"Global MG94xREV":0.0006914676548584967,
"Nucleotide GTR":0.0006667439109386068,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1157":{
"Global MG94xREV":0.000691312721190861,
"Nucleotide GTR":0.0006665945169954925,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1161":{
"Global MG94xREV":0.0006912470856003753,
"Nucleotide GTR":0.0006665312282357229,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1164":{
"Global MG94xREV":0.0006915663558937998,
"Nucleotide GTR":0.0006668390828730122,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node118":{
"Global MG94xREV":0.000446619798785591,
"Nucleotide GTR":0.0004306507025348235,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node119":{
"Global MG94xREV":0.0002449176664418155,
"Nucleotide GTR":0.0002361605226708557,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1211":{
"Global MG94xREV":0.0004101234229928843,
"Nucleotide GTR":0.000395459271438753,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1214":{
"Global MG94xREV":0.0006916937861100982,
"Nucleotide GTR":0.0006669619567633378,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1253":{
"Global MG94xREV":0.0006915482961252559,
"Nucleotide GTR":0.0006668216688397966,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1343":{
"Global MG94xREV":0.0004115223129394976,
"Nucleotide GTR":0.0003968081434321489,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1353":{
"Global MG94xREV":0.0004475040844926495,
"Nucleotide GTR":0.0004315033701998532,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1356":{
"Global MG94xREV":0.0004448134873902279,
"Nucleotide GTR":0.0004289089766339011,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1359":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1362":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1365":{
"Global MG94xREV":0.0004448134873902279,
"Nucleotide GTR":0.0004289089766339011,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1368":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1371":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1374":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAT", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1377":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1380":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1383":{
"Global MG94xREV":0.0004470432127079598,
"Nucleotide GTR":0.0004310589770977228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1386":{
"Global MG94xREV":0.0004470298185658758,
"Nucleotide GTR":0.0004310460618693466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1389":{
"Global MG94xREV":0.0004448001601168215,
"Nucleotide GTR":0.0004288961258832822,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1392":{
"Global MG94xREV":0.0004470298185658758,
"Nucleotide GTR":0.0004310460618693466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1395":{
"Global MG94xREV":0.0004470298185658758,
"Nucleotide GTR":0.0004310460618693466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "S", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "TCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1398":{
"Global MG94xREV":0.0004470298185658758,
"Nucleotide GTR":0.0004310460618693466,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node140":{
"Global MG94xREV":0.0006915894123605519,
"Nucleotide GTR":0.0006668613149451947,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1401":{
"Global MG94xREV":0.0004447868328434093,
"Nucleotide GTR":0.0004288832751326593,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1407":{
"Global MG94xREV":0.0004447868328434093,
"Nucleotide GTR":0.0004288832751326593,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1410":{
"Global MG94xREV":0.0004470164244237898,
"Nucleotide GTR":0.0004310331466409699,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1413":{
"Global MG94xREV":0.0004447735055699942,
"Nucleotide GTR":0.0004288704243820322,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1416":{
"Global MG94xREV":0.000447003030281704,
"Nucleotide GTR":0.0004310202314125928,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1419":{
"Global MG94xREV":0.0004447601782965731,
"Nucleotide GTR":0.0004288575736314009,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1422":{
"Global MG94xREV":0.000445205355196348,
"Nucleotide GTR":0.0004292868330264419,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1425":{
"Global MG94xREV":0.0004469762419975305,
"Nucleotide GTR":0.0004309944009558365,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1431":{
"Global MG94xREV":0.0004469494537133544,
"Nucleotide GTR":0.000430968570499078,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1434":{
"Global MG94xREV":0.0004469360595712662,
"Nucleotide GTR":0.0004309556552706981,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "I", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ATT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1437":{
"Global MG94xREV":0.0004469092712870871,
"Nucleotide GTR":0.0004309298248139362,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1440":{
"Global MG94xREV":0.0004468958771449964,
"Nucleotide GTR":0.0004309169095855544,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "I", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ATT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1443":{
"Global MG94xREV":0.000446842300576629,
"Nucleotide GTR":0.0004308652486720217,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1446":{
"Global MG94xREV":0.0004467887240082508,
"Nucleotide GTR":0.0004308135877584798,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAC", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1452":{
"Global MG94xREV":0.000444656459732233,
"Nucleotide GTR":0.0004287575635720151,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node1455":{
"Global MG94xREV":0.0004551989592110454,
"Nucleotide GTR":0.0004389231111347718,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node147":{
"Global MG94xREV":0.0006915454693921627,
"Nucleotide GTR":0.0006668189431778448,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node154":{
"Global MG94xREV":0.0004460671878423803,
"Nucleotide GTR":0.0004301178504499654,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node155":{
"Global MG94xREV":0.0002454832785600188,
"Nucleotide GTR":0.0002367059110677173,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node165":{
"Global MG94xREV":0.0006916116740500615,
"Nucleotide GTR":0.0006668827806577616,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "T", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ACT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node174":{
"Global MG94xREV":0.0004109268130017956,
"Nucleotide GTR":0.0003962339358685163,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node177":{
"Global MG94xREV":0.000411155715801923,
"Nucleotide GTR":0.0003964546541437814,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node178":{
"Global MG94xREV":0.0002804026384466117,
"Nucleotide GTR":0.0002703767131864723,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node281":{
"Global MG94xREV":0.0006917367157447114,
"Nucleotide GTR":0.0006670033514291271,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACT", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node306":{
"Global MG94xREV":0.000691674608794433,
"Nucleotide GTR":0.0006669434651414115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node316":{
"Global MG94xREV":0.0006917367322987143,
"Nucleotide GTR":0.0006670033673912348,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACT", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node410":{
"Global MG94xREV":0.0005310314176406363,
"Nucleotide GTR":0.0005120441451472467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node411":{
"Global MG94xREV":0.0001604560409552111,
"Nucleotide GTR":0.0001547188614369764,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node415":{
"Global MG94xREV":0.0001650361855397933,
"Nucleotide GTR":0.000159135240846095,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node416":{
"Global MG94xREV":0.000526673651043678,
"Nucleotide GTR":0.0005078421924985608,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "R", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AGA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node426":{
"Global MG94xREV":0.0004263572612795774,
"Nucleotide GTR":0.0004111126613735716,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node429":{
"Global MG94xREV":0.0004453684327652974,
"Nucleotide GTR":0.0004294440796819341,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node521":{
"Global MG94xREV":0.0006917969549689993,
"Nucleotide GTR":0.0006670614367722541,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "TTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node531":{
"Global MG94xREV":0.0006916895030579089,
"Nucleotide GTR":0.0006669578268536487,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node542":{
"Global MG94xREV":0.0006918868873022592,
"Nucleotide GTR":0.0006671481535335895,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node547":{
"Global MG94xREV":0.0006951028598383389,
"Nucleotide GTR":0.0006702491374930137,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node551":{
"Global MG94xREV":0.0006917084046354484,
"Nucleotide GTR":0.0006669760525965921,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.0004112738591122947,
"Nucleotide GTR":0.0003965685731857714,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node555":{
"Global MG94xREV":0.000280281345317138,
"Nucleotide GTR":0.0002702597569486101,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node570":{
"Global MG94xREV":0.0006918081999064909,
"Nucleotide GTR":0.0006670722796418355,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node573":{
"Global MG94xREV":0.0006915101867098483,
"Nucleotide GTR":0.000666784922044059,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "V", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "GTA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node581":{
"Global MG94xREV":0.0006916986672840584,
"Nucleotide GTR":0.0006669666634086795,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "M", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "ATG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node595":{
"Global MG94xREV":0.0006918588438758912,
"Nucleotide GTR":0.0006671211128128248,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node617":{
"Global MG94xREV":0.0006912213180453545,
"Nucleotide GTR":0.0006665063820114787,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCC", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node624":{
"Global MG94xREV":0.0004467753298661552,
"Nucleotide GTR":0.000430800672530093,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node631":{
"Global MG94xREV":0.0004713390228243586,
"Nucleotide GTR":0.0004544860793527723,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node632":{
"Global MG94xREV":0.0002204526147093508,
"Nucleotide GTR":0.0002125702301115353,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.0006937857705755284,
"Nucleotide GTR":0.000668979141362362,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node654":{
"Global MG94xREV":0.0006917550189131605,
"Nucleotide GTR":0.0006670210001593727,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node663":{
"Global MG94xREV":0.0006919535291723063,
"Nucleotide GTR":0.0006672124125929325,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node672":{
"Global MG94xREV":0.0004484472250388518,
"Nucleotide GTR":0.000432412788322192,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node673":{
"Global MG94xREV":0.0002431248182049189,
"Nucleotide GTR":0.0002344317785469783,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node681":{
"Global MG94xREV":0.0004484407024497076,
"Nucleotide GTR":0.0004324064989512214,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node682":{
"Global MG94xREV":0.0002431340171959535,
"Nucleotide GTR":0.0002344406486238588,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node690":{
"Global MG94xREV":0.0004317258316770019,
"Nucleotide GTR":0.0004162892760680953,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "F", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "TTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node691":{
"Global MG94xREV":0.0002597708470989672,
"Nucleotide GTR":0.0002504826210244708,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "F", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "TTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node699":{
"Global MG94xREV":0.0006918982607206693,
"Nucleotide GTR":0.0006671591202901956,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node702":{
"Global MG94xREV":0.000411155715801923,
"Nucleotide GTR":0.0003964546541437814,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node703":{
"Global MG94xREV":0.0002804036235709487,
"Nucleotide GTR":0.0002703776630872353,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node711":{
"Global MG94xREV":0.0006912573017344254,
"Nucleotide GTR":0.0006665410790872025,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "A", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "GCA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node722":{
"Global MG94xREV":0.0006914965588438307,
"Nucleotide GTR":0.0006667717814486565,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node733":{
"Global MG94xREV":0.0004292344659512621,
"Nucleotide GTR":0.0004138869902693498,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node734":{
"Global MG94xREV":0.00026234532627772,
"Nucleotide GTR":0.0002529650485165025,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node748":{
"Global MG94xREV":0.0006916696907803384,
"Nucleotide GTR":0.0006669387229731719,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node757":{
"Global MG94xREV":0.0006919034398463235,
"Nucleotide GTR":0.00066716411423383,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node762":{
"Global MG94xREV":0.0006917948688014898,
"Nucleotide GTR":0.000667059425196624,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node777":{
"Global MG94xREV":0.000691402567795033,
"Nucleotide GTR":0.0006666811510930232,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node781":{
"Global MG94xREV":0.0006918245337794356,
"Nucleotide GTR":0.0006670880294896438,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "F", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "TTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node826":{
"Global MG94xREV":0.0006917297483337623,
"Nucleotide GTR":0.0006669966331411599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node868":{
"Global MG94xREV":0.0004530606686684615,
"Nucleotide GTR":0.0004368612761536726,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node892":{
"Global MG94xREV":0.0004538398360656075,
"Nucleotide GTR":0.0004376125840622915,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node895":{
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "S", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "TCA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node896":{
"Global MG94xREV":0.0006917863860882732,
"Nucleotide GTR":0.0006670512457867179,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node902":{
"Global MG94xREV":0.0006923913293533927,
"Nucleotide GTR":0.0006676345590272551,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node921":{
"Global MG94xREV":0.0006919951406821369,
"Nucleotide GTR":0.0006672525362640973,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node925":{
"Global MG94xREV":0.0006916117950809796,
"Nucleotide GTR":0.0006668828973611624,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node928":{
"Global MG94xREV":0.0006915341479249777,
"Nucleotide GTR":0.000666808026514924,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node931":{
"Global MG94xREV":0.0006914830739565844,
"Nucleotide GTR":0.0006667587787197534,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node934":{
"Global MG94xREV":0.0006918634456048612,
"Nucleotide GTR":0.000667125550004861,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node938":{
"Global MG94xREV":0.0006918636848144204,
"Nucleotide GTR":0.0006671257806613716,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node941":{
"Global MG94xREV":0.0006914038708280973,
"Nucleotide GTR":0.0006666824075355414,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node944":{
"Global MG94xREV":0.0006918631885536315,
"Nucleotide GTR":0.0006671253021446157,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node947":{
"Global MG94xREV":0.0006914633185779572,
"Nucleotide GTR":0.0006667397297037722,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node950":{
"Global MG94xREV":0.0006915635713151771,
"Nucleotide GTR":0.0006668363978582786,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node953":{
"Global MG94xREV":0.0006917972299339549,
"Nucleotide GTR":0.0006670617019057115,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node956":{
"Global MG94xREV":0.0006914611357165429,
"Nucleotide GTR":0.0006667376248915703,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node959":{
"Global MG94xREV":0.0006914024283087319,
"Nucleotide GTR":0.0006666810165941184,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node962":{
"Global MG94xREV":0.0006918573471924452,
"Nucleotide GTR":0.0006671196696439846,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node965":{
"Global MG94xREV":0.0006915913863457415,
"Nucleotide GTR":0.0006668632183496366,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node968":{
"Global MG94xREV":0.0006914743136731722,
"Nucleotide GTR":0.0006667503316643023,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node971":{
"Global MG94xREV":0.0006914977176805756,
"Nucleotide GTR":0.0006667728988506601,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node972":{
"Global MG94xREV":0.0006919469331275687,
"Nucleotide GTR":0.0006672060523928079,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node976":{
"Global MG94xREV":0.0006917874549708453,
"Nucleotide GTR":0.0006670522764509018,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node981":{
"Global MG94xREV":0.0006914687825403341,
"Nucleotide GTR":0.0006667449982996624,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node987":{
"Global MG94xREV":0.0006911687821502527,
"Nucleotide GTR":0.0006664557245614612,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "S", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TCA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node990":{
"Global MG94xREV":0.001037920033277123,
"Nucleotide GTR":0.001000808725276291,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "I", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "ATA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node991":{
"Global MG94xREV":0.001038773564899739,
"Nucleotide GTR":0.001001631738483307,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node995":{
"Global MG94xREV":0.0004178268753769257,
"Nucleotide GTR":0.0004028872833409382,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node996":{
"Global MG94xREV":0.0002739372427375767,
"Nucleotide GTR":0.0002641424906736488,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630067262707009,
"Nucleotide GTR":0.0006669976359509148,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAG", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004263554190784103,
"Nucleotide GTR":0.0004289218273843756,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGG", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005049133567102226,
"Nucleotide GTR":0.005079526374944435,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "E", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "S", "M", "L", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "N", "E", "T", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "-", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTA", "TTC", "TGT", "GAA", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TCG", "ATG", "CTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAT", "GAA", "ACG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "---", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633098586182777,
"Nucleotide GTR":0.0006673025929765413,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413559_California_20200227_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006773217434522714,
"Nucleotide GTR":0.0006813988210978753,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413695_China_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000669916029212836,
"Nucleotide GTR":0.0006739485288240454,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "-", "-", "-", "-", "IM", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "---", "---", "---", "---", "AT-", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413752_China_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006635535379597708,
"Nucleotide GTR":0.0006675477391240326,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCA", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627772943473458,
"Nucleotide GTR":0.0006667668229826197,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTC", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628725427798754,
"Nucleotide GTR":0.0006668626447545692,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629157186028516,
"Nucleotide GTR":0.0006669060804705505,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "A", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "GCT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414522_England_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326012522634443,
"Nucleotide GTR":0.001333994336397379,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCC", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGC", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663181876641104,
"Nucleotide GTR":0.0006671738406233048,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628956585729816,
"Nucleotide GTR":0.0006668858996911238,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "V", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "GTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001328135776844767,
"Nucleotide GTR":0.001336130371346487,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "K", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "C", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAA", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGT", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629900362995871,
"Nucleotide GTR":0.0006669808455160124,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "F", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "TTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632526091100658,
"Nucleotide GTR":0.0006672449988600362,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633528733293072,
"Nucleotide GTR":0.0006673458666107759,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628876807080977,
"Nucleotide GTR":0.0006668778738041966,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "D", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "GAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629827999830216,
"Nucleotide GTR":0.0006669735656410868,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "S", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "TCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627768576717152,
"Nucleotide GTR":0.0006667663836784599,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAC", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632272359728087,
"Nucleotide GTR":0.0006672194729914489,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "S", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "TCA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629935652879299,
"Nucleotide GTR":0.0006669843957467854,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "C", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TGC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633446772147971,
"Nucleotide GTR":0.0006673376211604882,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "M", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATG", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634627877746304,
"Nucleotide GTR":0.0006674564426762707,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "I", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ATC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630119917810077,
"Nucleotide GTR":0.0006670029331564901,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTG", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326767292465169,
"Nucleotide GTR":0.001334753649497584,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "L", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "CTT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769173864449,
"Nucleotide GTR":0.0006667664437526371,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAC", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000228154968443975,
"Nucleotide GTR":0.0002295283268671593,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625970718191878,
"Nucleotide GTR":0.0006665855156210758,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCC", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006638950290542431,
"Nucleotide GTR":0.0006678912857935999,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATA", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632605983996442,
"Nucleotide GTR":0.000667253036240428,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769048050623,
"Nucleotide GTR":0.0006667664310955216,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTC", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "IF", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "WTT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417242_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "TI", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "AYC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417288_England_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631651019590422,
"Nucleotide GTR":0.0006671569649675446,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "N", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "AAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627859652562082,
"Nucleotide GTR":0.0006667755460852434,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACC", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632410148336423,
"Nucleotide GTR":0.0006672333347929029,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769173850586,
"Nucleotide GTR":0.0006667664437512433,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGC", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631278304212425,
"Nucleotide GTR":0.0006671194690770577,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "L", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "MV", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "RTG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662990035962433,
"Nucleotide GTR":0.0006669808451768285,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "F", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTT", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627805159852344,
"Nucleotide GTR":0.0006667700640128703,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGC", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628186241953039,
"Nucleotide GTR":0.0006668084016119014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "PS", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "YCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "CF", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TKT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631278278962388,
"Nucleotide GTR":0.0006671194665368543,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "S", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "TCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627965942654052,
"Nucleotide GTR":0.0006667862390748106,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATC", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418750_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGY", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418769_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628060107000336,
"Nucleotide GTR":0.0006667957121908245,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "F", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTT", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630894016845698,
"Nucleotide GTR":0.0006670808090220424,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627857699584081,
"Nucleotide GTR":0.0006667753496118654,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "P", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "CCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632027493598968,
"Nucleotide GTR":0.0006671948389835608,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627722554728077,
"Nucleotide GTR":0.0006667617537770276,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632382256141844,
"Nucleotide GTR":0.0006672305287839873,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTG", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006640361249945044,
"Nucleotide GTR":0.000668033231048253,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Q", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "G", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAA", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "GGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001328160386716767,
"Nucleotide GTR":0.001336155129355411,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "L", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "CTC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631372331266086,
"Nucleotide GTR":0.0006671289283811672,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "V", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "GTG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769173850586,
"Nucleotide GTR":0.0006667664437512433,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "A", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GCG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "RM", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AKG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631304710472611,
"Nucleotide GTR":0.0006671221255980881,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAG", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633226785435505,
"Nucleotide GTR":0.0006673154900702082,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "L", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CTT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "TI", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "AYT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629017620928259,
"Nucleotide GTR":0.0006668920399505611,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "I", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "ATT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632569257456325,
"Nucleotide GTR":0.0006672493414792046,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630320448749561,
"Nucleotide GTR":0.000667023106958243,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTG", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCY", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629345734447538,
"Nucleotide GTR":0.0006669250488074866,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "I", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ATA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632272360037584,
"Nucleotide GTR":0.000667219473022585,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCT", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006636544272440761,
"Nucleotide GTR":0.0006676492357023602,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "I", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "ATT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420518_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATW", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630447812216125,
"Nucleotide GTR":0.0006670359199701994,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTY", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420676_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTM", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420742_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420756_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "YTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420775_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "TI", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "AYA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTY", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "RI", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AKA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00132739887634266,
"Nucleotide GTR":0.001335389035137727,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "G", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00066295040764693,
"Nucleotide GTR":0.0006669409783222261,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "D", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GAC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662927594805031,
"Nucleotide GTR":0.0006669180281604664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001994470423383915,
"Nucleotide GTR":0.002006475959684209,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "Y", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TAC", "AGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TAT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421662_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633442395056421,
"Nucleotide GTR":0.0006673371808165814,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421665_India_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631278323198635,
"Nucleotide GTR":0.0006671194709871077,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTT", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421807_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006625750274901649,
"Nucleotide GTR":0.0006665633385981862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "L", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "CTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421831_England_20200323_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633519642026443,
"Nucleotide GTR":0.0006673449520117061,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "I", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ATT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421834_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "YC", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TRC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421843_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663167090860593,
"Nucleotide GTR":0.0006671589658411097,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTT", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421847_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACY", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421851_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "TM", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "AYG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421917_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002362816303092923,
"Nucleotide GTR":0.0002377039064466131,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAC", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "AV", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GYT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630627397486077,
"Nucleotide GTR":0.0006670539865969405,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "I", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATT", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002343721547510456,
"Nucleotide GTR":0.0002357829369710536,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "S", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "TCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629679327667084,
"Nucleotide GTR":0.0006669586089328946,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "S", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "TCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663375169774725,
"Nucleotide GTR":0.0006673682972676525,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "YAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422436_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632633452619201,
"Nucleotide GTR":0.0006672557996371968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "E", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GAG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627908651365375,
"Nucleotide GTR":0.0006667804754599639,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "CTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629019101676708,
"Nucleotide GTR":0.0006668921889167289,
"amino-acid": [
["K", "I", "I", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "ATT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629876846074752,
"Nucleotide GTR":0.0006669784796681004,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002363496008487817,
"Nucleotide GTR":0.0002377722861286848,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "A", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "GCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423202_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "TA", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "RCG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423203_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006638002611374635,
"Nucleotide GTR":0.0006677959474298221,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "N", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AAC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423210_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "SF", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TYT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423436_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006629022409975531,
"Nucleotide GTR":0.0006668925217380123,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "H", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CAC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423509_England_20200331_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "GC", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "KGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423558_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "AS", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "KCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423687_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PL", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CYT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423701_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "AV", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GYT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423719_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "NS", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "ART", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423757_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "KN", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAW", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423770_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "SI", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "AKT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423784_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "TI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AYT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423814_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACW", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423833_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "PA", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "SCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423855_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629071807270821,
"Nucleotide GTR":0.0006668974912018007,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTA", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423863_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "TI", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "AYT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423868_England_20200318_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "SF", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TYC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423906_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000234294677764922,
"Nucleotide GTR":0.0002357049936191428,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "I", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ATT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423952_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTY", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002362515181065904,
"Nucleotide GTR":0.0002376736129862007,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAC", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424000_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAY", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424001_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "SC", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TSC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424070_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "GC", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "KGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424125_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "AV", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GYA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424131_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632547681138058,
"Nucleotide GTR":0.0006672471708597059,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662969449795739,
"Nucleotide GTR":0.0006669601350935463,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "S", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "AGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006629734313456661,
"Nucleotide GTR":0.0006669641406100578,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTC", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627693388468721,
"Nucleotide GTR":0.0006667588195947233,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCA", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627855935406121,
"Nucleotide GTR":0.000666775172132139,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAC", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663333248947808,
"Nucleotide GTR":0.0006673261241020683,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628559512397854,
"Nucleotide GTR":0.0006668459533431873,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "R", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CGA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632966109412572,
"Nucleotide GTR":0.0006672892655563144,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633101356996704,
"Nucleotide GTR":0.0006673028717258015,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "H", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CAC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626394690077343,
"Nucleotide GTR":0.0006666281680157063,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "CTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632633452619201,
"Nucleotide GTR":0.0006672557996371968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACA", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000662790861847515,
"Nucleotide GTR":0.000666780472151143,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATC", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425615_England_20200329_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002359499911368583,
"Nucleotide GTR":0.0002373702710018471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "C", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TGC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629936407849258,
"Nucleotide GTR":0.0006669844716982291,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "A", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "GCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629275801074454,
"Nucleotide GTR":0.0006669180133744099,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "F", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TTT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "IL", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "WTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAY", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628559513631322,
"Nucleotide GTR":0.0006668459534672776,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCG", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "RC", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "YGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006636626005322599,
"Nucleotide GTR":0.0006676574581889214,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "N", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "AAT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629678605608218,
"Nucleotide GTR":0.0006669585362923721,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "F", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "TTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006633245136396952,
"Nucleotide GTR":0.000667317336212549,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663261125527162,
"Nucleotide GTR":0.0006672535665409435,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629756315179937,
"Nucleotide GTR":0.0006669663540261248,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "GV", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GKT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627769173864449,
"Nucleotide GTR":0.0006667664437526371,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAC", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GV", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GKC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "V", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GTT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326154309340438,
"Nucleotide GTR":0.001334136976575767,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "V", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "GTC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCC", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "SF", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TYT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630067259689336,
"Nucleotide GTR":0.0006669976356473308,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "M", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATG", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628964545899865,
"Nucleotide GTR":0.0006668867004996827,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "S", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "AGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630048148331589,
"Nucleotide GTR":0.0006669957130076457,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "L", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "TTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912015252985,
"Nucleotide GTR":0.0006667808138735872,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "A", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GCA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628730788327003,
"Nucleotide GTR":0.0006668631840341167,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634704276888936,
"Nucleotide GTR":0.0006674641285783151,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "Y", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "TAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631305549612255,
"Nucleotide GTR":0.0006671222100171648,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTG", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629275948404749,
"Nucleotide GTR":0.0006669180281961236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAT", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631398920690048,
"Nucleotide GTR":0.0006671316033288293,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCT", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627859655131831,
"Nucleotide GTR":0.000666775546343765,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "P", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CCT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000663395963973937,
"Nucleotide GTR":0.000667389216635686,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628857707275996,
"Nucleotide GTR":0.0006668759523267421,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTG", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTY", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429004_California_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624649230466744,
"Nucleotide GTR":0.0006664525713908479,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "N", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAT", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429026_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAY", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429060_California_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662869342223137,
"Nucleotide GTR":0.0006668594249323664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912015013119,
"Nucleotide GTR":0.0006667808138494562,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "T", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ACC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGG", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATY", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001327284118770166,
"Nucleotide GTR":0.001335273586792291,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "T", "K", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ACA", "AAA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629732330911674,
"Nucleotide GTR":0.0006669639411621834,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAT", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632633199489428,
"Nucleotide GTR":0.0006672557741718491,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCA", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630120631574895,
"Nucleotide GTR":0.0006670030049626161,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631606545390252,
"Nucleotide GTR":0.0006671524907766804,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "V", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GTT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663391704291902,
"Nucleotide GTR":0.0006673849313128769,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "H", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CAT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006641017495865256,
"Nucleotide GTR":0.0006680992506616347,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGA", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "AV", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GYT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629021717556656,
"Nucleotide GTR":0.0006668924520793285,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "S", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "AGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTY", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629652165804431,
"Nucleotide GTR":0.00066695587639679,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "V", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GTA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006628613712884635,
"Nucleotide GTR":0.0006668514060173648,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTG", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "SI", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AKT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "ML", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "MTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "YTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632637936490341,
"Nucleotide GTR":0.0006672562507233362,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAT", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "PL", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CYA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629899608140607,
"Nucleotide GTR":0.0006669807695761082,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "C", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGT", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630561884902489,
"Nucleotide GTR":0.000667047395903868,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000234256869326338,
"Nucleotide GTR":0.0002356669575960448,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAC", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632601786850838,
"Nucleotide GTR":0.0006672526139994335,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002362515180742082,
"Nucleotide GTR":0.0002376736129536236,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGC", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629625501212866,
"Nucleotide GTR":0.000666953193887121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "I", "TPAS", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ATA", "-CA", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630405151677996,
"Nucleotide GTR":0.0006670316282372564,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTT", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAY", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTY", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAY", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGA", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629945035570552,
"Nucleotide GTR":0.0006669853396637374,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "I", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ATT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCS", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006628098367862079,
"Nucleotide GTR":0.000666799561307782,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTC", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "SC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "WGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629275801410584,
"Nucleotide GTR":0.0006669180134082245,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "S", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "TCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006640820559482497,
"Nucleotide GTR":0.0006680794384792651,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "EAGV", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GNA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432680_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663451521425274,
"Nucleotide GTR":0.0006674451085101319,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "I", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ATA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432713_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630825202121857,
"Nucleotide GTR":0.0006670738861272495,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "E", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAG", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432999_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433033_England_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001327896660680923,
"Nucleotide GTR":0.001335889815844286,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "ILVF", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "NTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629523378484411,
"Nucleotide GTR":0.0006669429201424124,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACC", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629019114317486,
"Nucleotide GTR":0.0006668921901884157,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "T", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "ACA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006635694161690272,
"Nucleotide GTR":0.0006675637129107482,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGA", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630584680144771,
"Nucleotide GTR":0.0006670496891494892,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCG", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002342636684212106,
"Nucleotide GTR":0.0002356737976174609,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "L", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CTA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002342791722384259,
"Nucleotide GTR":0.0002356893947585169,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "S", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "TCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629625528669075,
"Nucleotide GTR":0.000666953196649269,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCC", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006631000391990804,
"Nucleotide GTR":0.0006670915105681191,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "M", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATG", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433733_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632530558325759,
"Nucleotide GTR":0.0006672454482715527,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "V", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GTA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631002163419287,
"Nucleotide GTR":0.000667091688777264,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "T", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "ACA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629572440177874,
"Nucleotide GTR":0.0006669478558440063,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAC", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632962938015044,
"Nucleotide GTR":0.0006672889465075668,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632479309241373,
"Nucleotide GTR":0.0006672402925141857,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":{
"Global MG94xREV":0.0006632137175887801,
"Nucleotide GTR":0.0006672058732347167,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00132689995784139,
"Nucleotide GTR":0.00133488711344117,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAT", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAT", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006634143290354418,
"Nucleotide GTR":0.0006674076922440352,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628181013404347,
"Nucleotide GTR":0.0006668078756097537,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCG", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629275119228993,
"Nucleotide GTR":0.0006669179447794327,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTT", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912052858859,
"Nucleotide GTR":0.0006667808176568104,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "A", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GCG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006629899607821307,
"Nucleotide GTR":0.0006669807695439862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "L", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "TTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630061678622317,
"Nucleotide GTR":0.0006669970741811558,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "I", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "ATT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629900359217274,
"Nucleotide GTR":0.0006669808451358786,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "L", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "TTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00066346516401783,
"Nucleotide GTR":0.0006674588332230538,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAG", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006634212177396666,
"Nucleotide GTR":0.0006674146224142002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630259129664376,
"Nucleotide GTR":0.0006670169381392507,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "Q", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAG", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002342791723957478,
"Nucleotide GTR":0.0002356893949167857,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACT", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "TI", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "AYT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "IV", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "RTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "TR", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "ASA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "PL", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CYT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "DA", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GMT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629022452107752,
"Nucleotide GTR":0.0006668925259765944,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "G", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GGT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628613725216543,
"Nucleotide GTR":0.000666851407257978,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCG", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629275753552429,
"Nucleotide GTR":0.0006669180085936024,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "TTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002357976535432917,
"Nucleotide GTR":0.000237217016425763,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "F", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "TTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435596_California_20200304_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001331795359000436,
"Nucleotide GTR":0.001339811982029579,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "G", "V", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GGT", "GTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435626_California_20200307_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326454894570844,
"Nucleotide GTR":0.001334439371152078,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGC", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAA", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435636_California_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "DG", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GRT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "IV", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "RTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "AV", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GYA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629294608534804,
"Nucleotide GTR":0.0006669199054414272,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAG", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTY", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAR", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632727617403781,
"Nucleotide GTR":0.0006672652727973045,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTA", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "KR", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "ARG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006636266854649619,
"Nucleotide GTR":0.000667621326934087,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662927594805031,
"Nucleotide GTR":0.0006669180281604664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "TTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912051033464,
"Nucleotide GTR":0.000666780817473172,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "P", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "CCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912005020181,
"Nucleotide GTR":0.0006667808128441467,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "T", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ACT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634817013584877,
"Nucleotide GTR":0.0006674754701087543,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "F", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TTC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627912004267632,
"Nucleotide GTR":0.0006667808127684396,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "L", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "CTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "YS", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TMT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "YS", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TMT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "AV", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GYT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "YF", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TWC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGR", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TMA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629381229246788,
"Nucleotide GTR":0.0006669286196531868,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "I", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ATA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "TTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0002343411505562298,
"Nucleotide GTR":0.0002357517461492606,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "I", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ATA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002363044337833076,
"Nucleotide GTR":0.0002377268471841004,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "V", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "GTA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTT", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "AS", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "KCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627911481094899,
"Nucleotide GTR":0.000666780760136247,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGC", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "AG", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GST", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATY", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCK", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627859617716431,
"Nucleotide GTR":0.0006667755425797035,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAC", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628965519004496,
"Nucleotide GTR":0.0006668867983958974,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "S", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "AGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628754554764529,
"Nucleotide GTR":0.0006668655749838641,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "A", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006627861513305134,
"Nucleotide GTR":0.0006667757332796061,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAC", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632713661269672,
"Nucleotide GTR":0.0006672638687831228,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629784280985782,
"Nucleotide GTR":0.0006669691674404766,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAT", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "ACT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632272107479549,
"Nucleotide GTR":0.0006672194476147552,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "D", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAT", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596370352899,
"Nucleotide GTR":0.0006665478555018449,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "T", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ACC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006637526719215155,
"Nucleotide GTR":0.0006677480717548468,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATA", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006626364313244713,
"Nucleotide GTR":0.0006666251120473805,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTG", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628701896324536,
"Nucleotide GTR":0.0006668602774425874,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "V", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006628701837771508,
"Nucleotide GTR":0.0006668602715520396,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "V", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "GTT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437572_California_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000663096403607527,
"Nucleotide GTR":0.0006670878530924471,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627254057314753,
"Nucleotide GTR":0.0006667146220278682,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631812053613795,
"Nucleotide GTR":0.0006671731653028725,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "S", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "I", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "AGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ATC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631482291143278,
"Nucleotide GTR":0.0006671399905582513,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002684270169745678,
"Nucleotide GTR":0.0002700427893913883,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "V", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GTT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "PS", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "YCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002287240510842531,
"Nucleotide GTR":0.000230100835049484,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "V", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "LF", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "GTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTN", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "VF", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "KTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629899572757349,
"Nucleotide GTR":0.0006669807660164837,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "F", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTT", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACT", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662952413438938,
"Nucleotide GTR":0.0006669429961879204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "V", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GTT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628404556779577,
"Nucleotide GTR":0.0006668303645072119,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "RG", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "RGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438335_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629329127004089,
"Nucleotide GTR":0.0006669233780664394,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTT", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438337_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCR", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438428_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627857699209186,
"Nucleotide GTR":0.0006667753495741509,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTC", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438432_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630845784153808,
"Nucleotide GTR":0.0006670759567196154,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "N", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "AAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438451_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627857699584081,
"Nucleotide GTR":0.0006667753496118654,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAC", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438652_England_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006626228457750639,
"Nucleotide GTR":0.0006666114447209735,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "V", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "GTA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438654_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006631398920930322,
"Nucleotide GTR":0.0006671316033530007,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTT", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438727_England_20200426_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628857672878219,
"Nucleotide GTR":0.0006668759488662588,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGG", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438729_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "SC", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "WGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629899572757349,
"Nucleotide GTR":0.0006669807660164837,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "L", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "TTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "PS", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "YCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630115472156438,
"Nucleotide GTR":0.000667002485915105,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "C", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGT", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629572411818524,
"Nucleotide GTR":0.0006669478529910006,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGT", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438965_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326004906083332,
"Nucleotide GTR":0.001333986673999119,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "A", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAC", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "GCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438965_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "SI", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AKT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631452725864078,
"Nucleotide GTR":0.0006671370162337755,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "T", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "ACT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627910789045437,
"Nucleotide GTR":0.0006667806905147272,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCC", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632306205135149,
"Nucleotide GTR":0.0006672228779050948,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAT", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631651019590422,
"Nucleotide GTR":0.0006671569649675446,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "T", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "ACA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "A", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "GCA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629900324253401,
"Nucleotide GTR":0.0006669808416184458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTT", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006628718872893974,
"Nucleotide GTR":0.0006668619853184253,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTA", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439427_England_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629274419261253,
"Nucleotide GTR":0.000666917874361319,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "F", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "TTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439444_England_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTR", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439513_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
]
},
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629269129998865,
"Nucleotide GTR":0.0006669173422512566,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTT", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439562_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006627912051098417,
"Nucleotide GTR":0.0006667808174797067,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "L", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "CTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439648_England_20200322_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "LF", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "YTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439651_England_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629017594617856,
"Nucleotide GTR":0.0006668920373036832,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "I", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATA", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439654_England_20200328_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACY", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439661_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006637668241894582,
"Nucleotide GTR":0.0006677623092111002,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTA", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439664_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632379284733722,
"Nucleotide GTR":0.0006672302298545631,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTT", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439810_England_20200413_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "F", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "TTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439825_England_20200415_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "EG", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GRA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439877_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "RI", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AKA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439878_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630549920990086,
"Nucleotide GTR":0.0006670461923110575,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "T", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "ACA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439888_England_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596368508902,
"Nucleotide GTR":0.000666547855316336,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAC", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439903_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGY", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439910_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCY", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439976_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "LF", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "YTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439985_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630419381212178,
"Nucleotide GTR":0.0006670330597560159,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "F", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "TTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440024_England_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAY", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440043_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625595699304112,
"Nucleotide GTR":0.0006665477879930354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "H", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "CAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440056_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002344342126405254,
"Nucleotide GTR":0.0002358453684124483,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "I", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ATT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440071_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006628701941120926,
"Nucleotide GTR":0.0006668602819491914,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "V", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "GTT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440088_England_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006639585926574385,
"Nucleotide GTR":0.0006679552320122194,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440140_England_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "VF", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "KTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440193_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "SL", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TYA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440223_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAY", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440274_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAY", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440287_England_20200321_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633260335993495,
"Nucleotide GTR":0.0006673188653214651,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCC", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440298_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "SG", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "RGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440360_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "SI", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AKT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440384_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "YTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440411_England_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "PA", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "SCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440415_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628698628737072,
"Nucleotide GTR":0.0006668599487169463,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "A", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "GCA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440422_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002342636705115078,
"Nucleotide GTR":0.0002356737997203406,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "Y", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "TAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440437_England_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "V", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GTA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440485_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002344187088958557,
"Nucleotide GTR":0.0002358297713443741,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "I", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ATT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440558_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGT", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440561_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "RC", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "YGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440580_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTY", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440623_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006631278279742176,
"Nucleotide GTR":0.0006671194666153032,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAT", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440728_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0003256723543698615,
"Nucleotide GTR":0.0003276327099743113,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTG", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440742_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "TI", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "AYA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440785_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "F", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "TTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440907_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634948818284389,
"Nucleotide GTR":0.0006674887299173647,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "L", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTA", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACN", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441056_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "TR", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "-", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ASA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "---", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441078_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACY", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628701790494105,
"Nucleotide GTR":0.0006668602667958407,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "R", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AGG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441269_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628876818106771,
"Nucleotide GTR":0.0006668778749134127,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "D", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "GAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441277_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002344663290020331,
"Nucleotide GTR":0.0002358776780955207,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAA", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441294_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "SG", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "RGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441295_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAY", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441311_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006633498860179552,
"Nucleotide GTR":0.000667342861317572,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTA", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441321_England_20200401_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627701392708552,
"Nucleotide GTR":0.0006667596248367869,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441352_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002538515562175398,
"Nucleotide GTR":0.0002553795929521664,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTC", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "I", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATT", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441525_England_20200423_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "V", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GTA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441554_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "A", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "GCC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441555_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "DG", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GRT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441603_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006628701823520335,
"Nucleotide GTR":0.0006668602701183432,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTG", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "TI", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "AYA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441700_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006638002608864482,
"Nucleotide GTR":0.0006677959471772963,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTA", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441740_England_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTY", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441756_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "TI", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "AYT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "HY", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "YAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441832_England_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002653924760966261,
"Nucleotide GTR":0.002669899823660836,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "N", "T", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTK", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442086_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625970708480244,
"Nucleotide GTR":0.0006665855146440668,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "A", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GCA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442090_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "LF", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTK", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_442153_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAY", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442205_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAT", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442210_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625593325438072,
"Nucleotide GTR":0.0006665475491775036,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCC", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442239_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629900324253401,
"Nucleotide GTR":0.0006669808416184458,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "I", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATT", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442247_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628701897037507,
"Nucleotide GTR":0.0006668602775143133,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "G", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "GGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442261_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "GC", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "KGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442271_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTY", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442298_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTY", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442311_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006625970716618508,
"Nucleotide GTR":0.0006665855154627922,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "T", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ACC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442366_England_20200409_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002342636691674105,
"Nucleotide GTR":0.0002356737983681523,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "S", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "TCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442476_England_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629573749246777,
"Nucleotide GTR":0.0006669479875388789,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "I", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ATT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442484_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "HY", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "YAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442553_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "AV", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GYT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442559_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628719019391149,
"Nucleotide GTR":0.0006668620000563259,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "S", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "AGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442571_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "KN", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAW", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442609_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "AV", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GYC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442635_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631304820277239,
"Nucleotide GTR":0.0006671221366446478,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "G", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "GGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442637_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627932433025726,
"Nucleotide GTR":0.0006667828679411572,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442650_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "AV", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GYA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442677_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596370352899,
"Nucleotide GTR":0.0006665478555018449,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCC", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442721_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596370352899,
"Nucleotide GTR":0.0006665478555018449,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "CTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442806_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "TI", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "AYA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442827_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACK", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442847_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TI", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "AYC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442884_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "VF", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "KTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442891_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628698621807725,
"Nucleotide GTR":0.0006668599480198399,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "R", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CGT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442916_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "DY", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "KAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442933_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGY", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442941_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "AG", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GSC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442946_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627533639696056,
"Nucleotide GTR":0.0006667427485581118,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAG", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442962_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000662952410963634,
"Nucleotide GTR":0.0006669429936977156,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "V", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GTT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442982_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443008_England_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630825202121857,
"Nucleotide GTR":0.0006670738861272495,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "N", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAC", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443035_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630549920158081,
"Nucleotide GTR":0.0006670461922273574,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "N", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "AAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443070_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "LF", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTW", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443073_England_20200411_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "IF", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "WTT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCW", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "TS", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "WCA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006629524110493922,
"Nucleotide GTR":0.0006669429937839908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGT", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":{
"Global MG94xREV":0.00066295186204608,
"Nucleotide GTR":0.0006669424414760014,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "I", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ATA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628701204775394,
"Nucleotide GTR":0.0006668602078714016,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCG", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662951861157825,
"Nucleotide GTR":0.0006669424405823997,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAT", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAY", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443322_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625593337565107,
"Nucleotide GTR":0.0006665475503975063,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "H", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "CAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443344_England_20200416_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443365_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625749557365893,
"Nucleotide GTR":0.0006665632664126974,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTC", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443378_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0002689697542562646,
"Nucleotide GTR":0.0002705887936316023,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "V", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GTT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443384_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625596485932635,
"Nucleotide GTR":0.0006665478671293908,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "A", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GCT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443488_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "AV", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GYA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443492_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "HY", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "YAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443508_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006625595699304112,
"Nucleotide GTR":0.0006665477879930354,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTC", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443513_England_20200415_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628612330521381,
"Nucleotide GTR":0.0006668512669489374,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAG", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443592_England_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632272359728087,
"Nucleotide GTR":0.0006672194729914489,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "N", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAT", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443658_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "TI", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "AYA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443659_England_20200416_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "PS", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "YCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443666_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629936411167012,
"Nucleotide GTR":0.0006669844720320011,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "A", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "GCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443754_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "NI", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "AWT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443766_England_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630149774877153,
"Nucleotide GTR":0.0006670059368353924,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "L", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "TTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443780_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634715560080158,
"Nucleotide GTR":0.0006674652636892518,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "S", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAY", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443794_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "PA", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "SCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443823_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006638002611373916,
"Nucleotide GTR":0.0006677959474297506,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "K", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAA", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443875_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630584679838993,
"Nucleotide GTR":0.000667049689118727,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "S", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "AGC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443932_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACR", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443939_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "AV", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GYT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443953_England_20200330_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006630549874318027,
"Nucleotide GTR":0.0006670461876157592,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAA", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444077_California_20200430_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627815066692373,
"Nucleotide GTR":0.0006667710606602063,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "T", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTT", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ACT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444080_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006630709688905915,
"Nucleotide GTR":0.0006670622652735088,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444128_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGT", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444134_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "G", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GGC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444215_England_20200415_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630549920158081,
"Nucleotide GTR":0.0006670461922273574,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "N", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "AAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444218_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629936411167012,
"Nucleotide GTR":0.0006669844720320011,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "L", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTG", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444240_England_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627769047742963,
"Nucleotide GTR":0.0006667664310645708,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAC", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444243_England_20200419_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630584671955568,
"Nucleotide GTR":0.0006670496883256396,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "C", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TGC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444244_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006630868233373443,
"Nucleotide GTR":0.0006670782151546862,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACT", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444247_England_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630549874318027,
"Nucleotide GTR":0.0006670461876157592,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTA", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628718267164098,
"Nucleotide GTR":0.0006668619243808238,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "I", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "ATC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444293_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006631865715572169,
"Nucleotide GTR":0.0006671785638000451,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTA", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444369_England_20200428_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAT", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444398_England_20200419_null_28",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629760763683003,
"Nucleotide GTR":0.0006669668015541687,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634189855839063,
"Nucleotide GTR":0.0006674123768221783,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0006633925896724534,
"Nucleotide GTR":0.0006673858220228979,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "S", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "TCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAT", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629059917530985,
"Nucleotide GTR":0.0006668962950708947,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006629518611419618,
"Nucleotide GTR":0.0006669424405664413,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "Y", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006634097496153028,
"Nucleotide GTR":0.0006674030852584873,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTA", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596333911836,
"Nucleotide GTR":0.0006665478518358031,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAC", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596369088669,
"Nucleotide GTR":0.0006665478553746606,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATC", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769171466132,
"Nucleotide GTR":0.0006667664435113618,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAC", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006643466398053993,
"Nucleotide GTR":0.0006683456149752757,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTA", "---", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625970718191878,
"Nucleotide GTR":0.0006665855156210758,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "S", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TCC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002343877020974361,
"Nucleotide GTR":0.0002357985779033051,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "I", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ATT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625593325772021,
"Nucleotide GTR":0.0006665475492110987,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "L", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "CTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006635048838636932,
"Nucleotide GTR":0.0006674987921589757,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACA", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006627494376039226,
"Nucleotide GTR":0.0006667387985580223,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAC", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629899572757349,
"Nucleotide GTR":0.0006669807660164837,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "F", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTT", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627814747271927,
"Nucleotide GTR":0.0006667710285258895,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "C", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "TGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACT", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006627769047742963,
"Nucleotide GTR":0.0006667664310645708,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGC", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006635219976358649,
"Nucleotide GTR":0.0006675160089459679,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "L", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTA", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630970784234596,
"Nucleotide GTR":0.0006670885319703741,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "I", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ATA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "IM", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATR", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "GC", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "KGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_12":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "F", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "TTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628877182251786,
"Nucleotide GTR":0.0006668779115471082,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTG", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006640445719681081,
"Nucleotide GTR":0.0006680417288676576,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "-", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "---", "CTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628008012754123,
"Nucleotide GTR":0.0006667904714085372,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "M", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ATG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "KE", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "RAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629572406488118,
"Nucleotide GTR":0.0006669478524547515,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "M", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ATG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628753895026651,
"Nucleotide GTR":0.0006668655086129518,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTG", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTY", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "TTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006625700279557788,
"Nucleotide GTR":0.0006665583089695504,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGC", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "IV", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "RTT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACY", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "I", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ATT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628856774307797,
"Nucleotide GTR":0.0006668758584683296,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "S", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AGC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629936300960754,
"Nucleotide GTR":0.0006669844609450376,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "R", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CGT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630584680144771,
"Nucleotide GTR":0.0006670496891494892,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "G", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GGA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTK", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "F", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "TTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628698581598518,
"Nucleotide GTR":0.0006668599439747157,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "M", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATG", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0002342791351130106,
"Nucleotide GTR":0.0002356893574096288,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTT", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "TI", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "AYT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "F", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TTT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11":{
"Global MG94xREV":0.0006629572406480769,
"Nucleotide GTR":0.0006669478524540124,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "I", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ATT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATT", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662855939759437,
"Nucleotide GTR":0.0006668459417937341,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "A", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "GCA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAY", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "TI", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "AYC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "GV", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GKT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTK", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627965951303325,
"Nucleotide GTR":0.0006667862399449431,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATC", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625644931316419,
"Nucleotide GTR":0.0006665527408290346,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGC", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006629575183916956,
"Nucleotide GTR":0.0006669481318694839,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "L", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TTA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629598939878817,
"Nucleotide GTR":0.0006669505217653589,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "M", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "ATG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAT", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATY", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006630549920158081,
"Nucleotide GTR":0.0006670461922273574,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "H", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CAT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629936407366319,
"Nucleotide GTR":0.0006669844716496447,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "C", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TGC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006632633452619201,
"Nucleotide GTR":0.0006672557996371968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATA", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "L", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "TTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630258248583602,
"Nucleotide GTR":0.0006670168495008141,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGG", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTY", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "PS", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "YCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002343101796826004,
"Nucleotide GTR":0.0002357205888492278,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "V", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GTT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATT", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006630405151670631,
"Nucleotide GTR":0.0006670316282365157,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCT", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "TI", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "AYT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "MI", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATK", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "TI", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "AYA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002342636676728547,
"Nucleotide GTR":0.0002356737968646003,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "I", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ATA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631448132701475,
"Nucleotide GTR":0.0006671365541527031,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "T", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "ACT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "TPAS", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "S", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "NCT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TCG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000662791205052069,
"Nucleotide GTR":0.000666780817421586,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGC", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "F", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "TTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447489_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627693388468721,
"Nucleotide GTR":0.0006667588195947233,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTA", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447489_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "RL", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CKT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633314394914638,
"Nucleotide GTR":0.0006673243037538628,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "I", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "ATA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447530_Comunitat_Valenciana_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAY", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447530_Comunitat_Valenciana_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631278323317192,
"Nucleotide GTR":0.0006671194709990334,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "I", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ATA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447605_Kinshasa_20200423_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006628718875376477,
"Nucleotide GTR":0.00066686198556817,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "I", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "ATA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447605_Kinshasa_20200423_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447616_Taipei_20200321_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629731462708246,
"Nucleotide GTR":0.0006669638538192323,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "I", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ATT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447616_Taipei_20200321_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447680_France_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002363044321553471,
"Nucleotide GTR":0.0002377268455463407,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "G", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "GGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447680_France_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447713_France_20200301_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629573749246777,
"Nucleotide GTR":0.0006669479875388789,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAT", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447713_France_20200301_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447765_Antioquia_20200331_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTT", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447765_Antioquia_20200331_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447795_Valle_del_Cauca_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628718159789186,
"Nucleotide GTR":0.0006668619135786999,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTA", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447795_Valle_del_Cauca_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447808_Tolima_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "M", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "ATG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447808_Tolima_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAY", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447852_Telangana_20200401_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006630599429676218,
"Nucleotide GTR":0.0006670511729809819,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "I", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATT", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447852_Telangana_20200401_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001325930718461406,
"Nucleotide GTR":0.001333912039811439,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "I", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "S", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "ATA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "TCA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629900359305887,
"Nucleotide GTR":0.0006669808451447929,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "L", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TTG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447895_California_20200408_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "L", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TTA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447895_California_20200408_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447918_Bangkok_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629572991128811,
"Nucleotide GTR":0.0006669479112707392,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "L", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "CTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447918_Bangkok_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447921_Bangkok_20200313_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006632633452619201,
"Nucleotide GTR":0.0006672557996371968,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "I", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "ATT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447921_Bangkok_20200313_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448014_England_20200101_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006628880685395981,
"Nucleotide GTR":0.000666878263970214,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "V", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "GTG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448014_England_20200101_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448032_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "I", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATT", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448032_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448049_England_20200506_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006631278323317192,
"Nucleotide GTR":0.0006671194709990334,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCT", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448049_England_20200506_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448062_England_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627769046522198,
"Nucleotide GTR":0.0006667664309417596,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAC", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448062_England_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448103_England_20200508_null_21":{
"Global MG94xREV":0.0006627506125195,
"Nucleotide GTR":0.0006667399805458985,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "F", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "TTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448103_England_20200508_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448108_England_20200507_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006629731464286535,
"Nucleotide GTR":0.000666963853978012,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "I", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ATA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448108_England_20200507_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663388682533908,
"Nucleotide GTR":0.0006673818913656803,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTT", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448187_Scotland_20200414_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0002265177221675885,
"Nucleotide GTR":0.0002278812253332705,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "V", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GTA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448187_Scotland_20200414_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448230_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTK", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448230_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448275_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "F", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TTT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448275_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448291_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629626478370281,
"Nucleotide GTR":0.0006669532921910535,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "V", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GTT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448291_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448364_England_20200503_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "G", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GGT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448364_England_20200503_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448369_England_20200503_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTT", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448369_England_20200503_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448410_England_20200429_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628876818110227,
"Nucleotide GTR":0.0006668778749137605,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCG", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448410_England_20200429_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448411_England_20200429_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAC", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448411_England_20200429_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448485_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "VF", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "KTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448485_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448502_England_20200407_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "V", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GTT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448502_England_20200407_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448531_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAT", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448531_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448532_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "F", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "TTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448532_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628506459320227,
"Nucleotide GTR":0.0006668406161005988,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "S", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AGT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448539_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448551_England_20200406_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006629571707588007,
"Nucleotide GTR":0.0006669477821440433,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAT", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448551_England_20200406_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448701_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630639698581397,
"Nucleotide GTR":0.0006670552241110081,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "F", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "TTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448701_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448822_England_20200324_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0006627600202940646,
"Nucleotide GTR":0.0006667494449497204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTC", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448822_England_20200324_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448826_England_20200416_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "F", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTT", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448826_England_20200416_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448888_England_20200417_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628701789497237,
"Nucleotide GTR":0.0006668602666955531,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCG", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448888_England_20200417_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448896_England_20200413_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0006628701790093628,
"Nucleotide GTR":0.000666860266755551,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "G", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "GGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448896_England_20200413_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448913_England_20200415_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006625697261924496,
"Nucleotide GTR":0.0006665580053897834,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGC", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448913_England_20200415_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448979_England_20200419_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001327561347519839,
"Nucleotide GTR":0.001335552484295624,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "C", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "C", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "TGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "TGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448979_England_20200419_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449009_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629625530081193,
"Nucleotide GTR":0.0006669531967913308,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "I", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ATC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449009_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449017_England_20200421_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAY", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449017_England_20200421_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006630705090343338,
"Nucleotide GTR":0.0006670618026491876,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "I", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "ATA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449029_England_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449037_England_20200504_null_12":{
"Global MG94xREV":0.000234279173018769,
"Nucleotide GTR":0.000235689395543557,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "I", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ATC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449037_England_20200504_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449042_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTC", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449042_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449047_England_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006632272294090899,
"Nucleotide GTR":0.0006672194663882208,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "F", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "TTT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449047_England_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449071_England_20200506_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002363195244158127,
"Nucleotide GTR":0.0002377420286533182,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "E", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "GAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449071_England_20200506_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449096_England_20200506_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACT", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449096_England_20200506_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449112_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002342636698699378,
"Nucleotide GTR":0.0002356737990749085,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAT", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449112_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449120_England_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0.000663127110930984,
"Nucleotide GTR":0.0006671187452558918,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAT", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449120_England_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449174_England_20200416_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625596370227502,
"Nucleotide GTR":0.0006665478554892299,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAC", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449174_England_20200416_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449175_England_20200418_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006637668428714705,
"Nucleotide GTR":0.0006677623280055663,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "I", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "ATC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449175_England_20200418_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449181_Scotland_20200423_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTT", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449181_Scotland_20200423_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629519306047177,
"Nucleotide GTR":0.0006669425104473217,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGT", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449237_Scotland_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628506462215711,
"Nucleotide GTR":0.0006668406163918917,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCG", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449237_Scotland_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449317_Scotland_20200508_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449317_Scotland_20200508_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449324_Scotland_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629571707596936,
"Nucleotide GTR":0.0006669477821449421,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAT", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449324_Scotland_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449486_Wuhan_20200122_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006628797181633364,
"Nucleotide GTR":0.0006668698633296091,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "S", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TCA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449486_Wuhan_20200122_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449511_England_20200331_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "S", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TCA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449511_England_20200331_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449539_England_20200330_null_39":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "V", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GTT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449539_England_20200330_null_39",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449581_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAY", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449581_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449607_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625648619127477,
"Nucleotide GTR":0.0006665531118299851,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCC", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449607_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449627_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627859607282594,
"Nucleotide GTR":0.000666775541530039,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "A", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GCC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449627_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449632_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631809579110172,
"Nucleotide GTR":0.0006671729163630044,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "Y", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "TAT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449632_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449640_England_20200404_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTA", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449640_England_20200404_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449669_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631503835707392,
"Nucleotide GTR":0.0006671421579832198,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "V", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "GTC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449669_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449672_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "T", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ACT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449672_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449695_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "F", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TTT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449695_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449709_England_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0006628700558691946,
"Nucleotide GTR":0.0006668601428741531,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "G", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GGA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449709_England_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449715_England_20200416_null_68":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449715_England_20200416_null_68",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449717_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628718872250067,
"Nucleotide GTR":0.0006668619852536469,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "I", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "ATA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449717_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449718_England_20200417_null_16":{
"Global MG94xREV":0.0006631053161408086,
"Nucleotide GTR":0.0006670968192739261,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTT", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449718_England_20200417_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449719_England_20200417_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "H", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "CAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449719_England_20200417_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449724_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006627768357547358,
"Nucleotide GTR":0.0006667663616295524,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCC", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449724_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449788_Norway_20200411_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006629518611419618,
"Nucleotide GTR":0.0006669424405664413,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAT", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449788_Norway_20200411_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449865_Washington_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629523378484411,
"Nucleotide GTR":0.0006669429201424124,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "I", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ATT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449865_Washington_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450049_New_Jersey_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628247363799732,
"Nucleotide GTR":0.0006668145505883198,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "I", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "ATT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450049_New_Jersey_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450071_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006635048838636932,
"Nucleotide GTR":0.0006674987921589757,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACA", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450071_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_16":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_6":{
"Global MG94xREV":0.000269609072137212,
"Nucleotide GTR":0.0002712319598293446,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAC", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450120_New_York_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006628876139394788,
"Nucleotide GTR":0.0006668778066336701,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "S", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AGT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450120_New_York_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAR", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450271_Saint_Petersburg_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629625540136161,
"Nucleotide GTR":0.0006669531978028799,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATT", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450271_Saint_Petersburg_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450295_Wielkopolskie_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006629017631109194,
"Nucleotide GTR":0.0006668920409747826,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "S", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "AGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450295_Wielkopolskie_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450405_Hong_Kong_20200308_null_30":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "Y", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "TAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450405_Hong_Kong_20200308_null_30",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450454_California_20200325_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTC", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450454_California_20200325_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450463_California_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006628807356033253,
"Nucleotide GTR":0.0006668708868939877,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "V", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "GTA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450463_California_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450509_Beirut_20200315_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0006629519351963781,
"Nucleotide GTR":0.0006669425150666204,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAT", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450509_Beirut_20200315_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "MLV", "F", "R", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "-TG", "TTT", "AGA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326951756057665,
"Nucleotide GTR":0.001334939223452173,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "F", "R", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "Y", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TTT", "AGA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "TAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450529_Pomorskie_20200331_null_150":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450529_Pomorskie_20200331_null_150",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450591_Michigan_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTR", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450591_Michigan_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450615_Michigan_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATY", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450615_Michigan_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450635_Michigan_20200330_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0002342636691674105,
"Nucleotide GTR":0.0002356737983681523,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "V", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GTT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450635_Michigan_20200330_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450648_Quebec_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCC", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450648_Quebec_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450650_Quebec_20200408_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006625210599827962,
"Nucleotide GTR":0.0006665090462382349,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "N", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AAT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCC", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450650_Quebec_20200408_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450701_Wisconsin_20200418_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "V", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "GTA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450701_Wisconsin_20200418_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450712_Illinois_20200415_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "V", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GTA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450712_Illinois_20200415_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_33":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAT", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_33",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450807_Skane_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006629628186785365,
"Nucleotide GTR":0.0006669534640609264,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "F", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "TTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450807_Skane_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450824_Uppsala_20200426_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0002344682306541756,
"Nucleotide GTR":0.000235879591194488,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTT", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450824_Uppsala_20200426_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450849_Florida_20200409_null_68":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450849_Florida_20200409_null_68",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451165_Ghent_20200331_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0002342636242585925,
"Nucleotide GTR":0.0002356737531890099,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "V", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GTT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451165_Ghent_20200331_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_62":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "I", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATT", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_62",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451194_Uganda_20200322_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006634041452980114,
"Nucleotide GTR":0.0006673974472065097,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAT", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451194_Uganda_20200322_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451236_Louisiana_20200504_null_6":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "I", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATT", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451236_Louisiana_20200504_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451248_Louisiana_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001326763121156948,
"Nucleotide GTR":0.001334749453080547,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "S", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "F", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGT", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TTC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451248_Louisiana_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451268_Louisiana_20200507_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0002342636700291923,
"Nucleotide GTR":0.0002356737992351219,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAT", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451268_Louisiana_20200507_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451278_Louisiana_20200506_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631650253526425,
"Nucleotide GTR":0.0006671568879000201,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "K", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "AAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451278_Louisiana_20200506_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451351_Sichuan_20200127_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006636333522268925,
"Nucleotide GTR":0.0006676280338259961,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "L", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTA", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451351_Sichuan_20200127_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451422_New_York_20200320_null_10":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "L", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TTA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451422_New_York_20200320_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451488_New_South_Wales_20200325_null_21":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "Y", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "TAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451488_New_South_Wales_20200325_null_21",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451506_New_South_Wales_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0006633552833562009,
"Nucleotide GTR":0.0006673482911446111,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCG", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451506_New_South_Wales_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451519_New_South_Wales_20200312_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006633423666400117,
"Nucleotide GTR":0.0006673352966774051,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "F", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "I", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TTT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ATA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451519_New_South_Wales_20200312_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451521_New_South_Wales_20200314_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0002339541606340703,
"Nucleotide GTR":0.0002353624267758825,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "I", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ATA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451521_New_South_Wales_20200314_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451539_New_South_Wales_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006631305441108819,
"Nucleotide GTR":0.000667122199101509,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "C", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TGC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451539_New_South_Wales_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451591_New_South_Wales_20200331_null_26":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATT", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451591_New_South_Wales_20200331_null_26",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451595_New_South_Wales_20200323_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTT", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451595_New_South_Wales_20200323_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0006628783743741376,
"Nucleotide GTR":0.0006668685114515915,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "G", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GGA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_43":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTT", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_43",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAY", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "LF", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "YTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451711_Ticino_20200316_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATT", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451711_Ticino_20200316_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "PL", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CYT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_324":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "Y", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TAT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_324",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "AV", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GYA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451732_Basel_Stadt_20200316_null_10":{
"Global MG94xREV":0.0006629625501212866,
"Nucleotide GTR":0.000666953193887121,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAT", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451732_Basel_Stadt_20200316_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451740_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "EA", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GMA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451740_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "IF", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "WTT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "GC", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "KGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451786_Graubunden_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTY", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451786_Graubunden_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_5":{
"Global MG94xREV":0.000236689772270202,
"Nucleotide GTR":0.0002381145051815468,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTT", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451822_Basel_Land_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "AV", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GYT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451822_Basel_Land_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "AV", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GYT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451834_Zurich_20200331_null_18":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTT", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451834_Zurich_20200331_null_18",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451835_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCK", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451835_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "AS", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "KCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACY", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "RI", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AKA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "EV", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GWA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "MV", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "RTG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451862_Zurich_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTY", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451862_Zurich_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451866_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGY", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451866_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "TP", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "MCC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "KT", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "AMA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "ND", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "RAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451910_Graubunden_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "KR", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "ARA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451910_Graubunden_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451936_Bavaria_20200312_null_13":{
"Global MG94xREV":0.0006633151152908577,
"Nucleotide GTR":0.0006673078812911918,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "L", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "CTG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451936_Bavaria_20200312_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451960_Virginia_20200401_null_57":{
"Global MG94xREV":0.0006630518067409615,
"Nucleotide GTR":0.0006670429877790342,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTT", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451960_Virginia_20200401_null_57",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452039_Denmark_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTG", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452039_Denmark_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006635195959420922,
"Nucleotide GTR":0.0006675135927954146,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "L", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTG", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTA", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452049_Denmark_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006624866704682326,
"Nucleotide GTR":0.0006664744497190651,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "S", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "TCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452049_Denmark_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452068_Denmark_20200427_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "C", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "TGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452068_Denmark_20200427_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_72":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGC", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_72",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452112_Texas_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006625700291762165,
"Nucleotide GTR":0.0006665583101973341,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "T", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ACT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452112_Texas_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452130_Colorado_20200307_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "TTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452130_Colorado_20200307_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452133_Minnesota_20200310_null_1896":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGT", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452133_Minnesota_20200310_null_1896",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452134_Illinois_20200305_null_13":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGY", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452134_Illinois_20200305_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452155_Utah_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006627858271032881,
"Nucleotide GTR":0.0006667754071007242,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGC", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452155_Utah_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_25507":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["K", "I", "V", "N", "N", "W", "L", "K", "Q", "L", "I", "K", "V", "T", "L", "V", "F", "L", "F", "V", "A", "A", "I", "F", "Y", "L", "I", "T", "P", "V", "H", "V", "M", "S", "K", "H", "T", "D", "F", "S", "S", "E", "I", "I", "G", "Y", "K", "A", "I", "D", "G", "G", "V", "T", "R", "D", "I", "A", "S", "T", "D", "T", "C", "F", "A", "N", "K", "H", "A", "D", "F", "D", "T", "W", "F", "S", "Q", "R", "G", "G", "S", "Y", "T", "N", "D", "K", "A", "C", "P", "L", "I", "A", "A", "V", "I", "T", "R", "E", "V", "G", "F", "V", "V", "P", "G", "L", "P", "G", "T", "I", "L", "R", "T", "T", "N", "G", "D", "F", "L", "H", "F", "L", "P", "R", "V", "F", "S", "A", "V", "G", "N", "I", "C", "Y", "T", "P", "S", "K", "L", "I", "E", "Y", "T", "D", "F", "A", "T", "S", "A", "C", "V", "L", "A", "A", "E", "C", "T", "-", "I", "F", "K", "D", "A", "S", "G", "K", "P", "V", "P", "Y", "C", "Y", "D", "T", "N", "V", "L", "E", "G", "S", "V", "A", "Y", "E", "S", "L", "R", "P", "D", "T", "R", "Y", "V", "L", "M", "D", "G", "S", "I", "I", "Q", "F", "P", "N", "T", "Y", "L", "E", "G", "S", "V", "R", "V", "V", "T", "T", "F", "D", "S", "E", "Y", "C", "R", "H", "G", "T", "C", "E", "R", "S", "E", "A", "G", "V", "C", "V", "S", "T", "S", "G", "R", "W", "V", "L", "N", "N", "D", "Y", "Y", "R", "S", "L", "P", "G", "V", "F", "C", "G", "V", "D", "A", "V", "N", "L", "L", "T", "N", "M", "F", "T", "P", "L", "I", "Q", "P", "I", "G", "A", "L", "D", "I", "S", "A", "S", "I", "V", "A", "G", "G", "I", "V", "A", "I", "V", "V", "T", "C", "L", "A", "Y", "Y", "F", "M", "R", "F", "R", "R", "A", "F", "G", "E", "Y", "S", "H", "V", "V", "A", "F", "N", "T", "L", "L", "F", "L", "M", "S", "F", "T", "V", "L", "C", "L", "T", "P", "V", "Y", "S", "F", "L", "P", "G", "V", "Y", "S", "V", "I", "Y", "L", "Y", "L", "T", "F", "Y", "L", "T", "N", "D", "V", "S", "F", "L", "A", "H", "I", "Q", "W", "M", "V", "M", "F", "T", "P", "L", "V", "P", "F", "W", "I", "T", "I", "A", "Y", "I", "I", "C", "I", "S", "T", "K", "H", "F", "Y", "W", "F", "F", "S", "N", "Y", "L", "K", "R", "R", "V", "V", "F", "N", "G", "V", "S", "F", "S", "T", "F", "E", "E", "A", "A", "L", "C", "T", "F", "L", "L", "N", "K", "E", "M", "Y", "L", "K", "L", "R", "S", "D", "V", "L", "L", "P", "L", "T", "Q", "Y", "N", "R", "Y", "L", "A", "L", "Y", "N", "K", "Y", "K", "Y", "F", "S", "G", "A", "M", "D", "T", "T", "S", "Y", "R", "E", "A", "A", "C", "C", "H", "L", "A", "K", "A", "L", "N", "D", "F", "S", "N", "S", "G", "S", "D", "V", "L", "Y", "Q", "P", "P", "Q", "T", "S", "I", "T", "S", "A", "V", "L", "Q"]
],
"codon": [
["AAA", "ATT", "GTT", "AAT", "AAT", "TGG", "TTG", "AAG", "CAG", "TTA", "ATT", "AAA", "GTT", "ACA", "CTT", "GTG", "TTC", "CTT", "TTT", "GTT", "GCT", "GCT", "ATT", "TTC", "TAT", "TTA", "ATA", "ACA", "CCT", "GTT", "CAT", "GTC", "ATG", "TCT", "AAA", "CAT", "ACT", "GAC", "TTT", "TCA", "AGT", "GAA", "ATC", "ATA", "GGA", "TAC", "AAG", "GCT", "ATT", "GAT", "GGT", "GGT", "GTC", "ACT", "CGT", "GAC", "ATA", "GCA", "TCT", "ACA", "GAT", "ACT", "TGT", "TTT", "GCT", "AAC", "AAA", "CAT", "GCT", "GAT", "TTT", "GAC", "ACA", "TGG", "TTT", "AGC", "CAG", "CGT", "GGT", "GGT", "AGT", "TAT", "ACT", "AAT", "GAC", "AAA", "GCT", "TGC", "CCA", "TTG", "ATT", "GCT", "GCA", "GTC", "ATA", "ACA", "AGA", "GAA", "GTG", "GGT", "TTT", "GTC", "GTG", "CCT", "GGT", "TTG", "CCT", "GGC", "ACG", "ATA", "TTA", "CGC", "ACA", "ACT", "AAT", "GGT", "GAC", "TTT", "TTG", "CAT", "TTC", "TTA", "CCT", "AGA", "GTT", "TTT", "AGT", "GCA", "GTT", "GGT", "AAC", "ATC", "TGT", "TAC", "ACA", "CCA", "TCA", "AAA", "CTT", "ATA", "GAG", "TAC", "ACT", "GAC", "TTT", "GCA", "ACA", "TCA", "GCT", "TGT", "GTT", "TTG", "GCT", "GCT", "GAA", "TGT", "ACA", "---", "ATT", "TTT", "AAA", "GAT", "GCT", "TCT", "GGT", "AAG", "CCA", "GTA", "CCA", "TAT", "TGT", "TAT", "GAT", "ACC", "AAT", "GTA", "CTA", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "GCT", "TAT", "GAA", "AGT", "TTA", "CGC", "CCT", "GAC", "ACA", "CGT", "TAT", "GTG", "CTC", "ATG", "GAT", "GGC", "TCT", "ATT", "ATT", "CAA", "TTT", "CCT", "AAC", "ACC", "TAC", "CTT", "GAA", "GGT", "TCT", "GTT", "AGA", "GTG", "GTA", "ACA", "ACT", "TTT", "GAT", "TCT", "GAG", "TAC", "TGT", "AGG", "CAC", "GGC", "ACT", "TGT", "GAA", "AGA", "TCA", "GAA", "GCT", "GGT", "GTT", "TGT", "GTA", "TCT", "ACT", "AGT", "GGT", "AGA", "TGG", "GTA", "CTT", "AAC", "AAT", "GAT", "TAT", "TAC", "AGA", "TCT", "TTA", "CCA", "GGA", "GTT", "TTC", "TGT", "GGT", "GTA", "GAT", "GCT", "GTA", "AAT", "TTA", "CTT", "ACT", "AAT", "ATG", "TTT", "ACA", "CCA", "CTA", "ATT", "CAA", "CCT", "ATT", "GGT", "GCT", "TTG", "GAC", "ATA", "TCA", "GCA", "TCT", "ATA", "GTA", "GCT", "GGT", "GGT", "ATT", "GTA", "GCT", "ATC", "GTA", "GTA", "ACA", "TGC", "CTT", "GCC", "TAC", "TAT", "TTT", "ATG", "AGG", "TTT", "AGA", "AGA", "GCT", "TTT", "GGT", "GAA", "TAC", "AGT", "CAT", "GTA", "GTT", "GCC", "TTT", "AAT", "ACT", "TTA", "CTA", "TTC", "CTT", "ATG", "TCA", "TTC", "ACT", "GTA", "CTC", "TGT", "TTA", "ACA", "CCA", "GTT", "TAC", "TCA", "TTC", "TTA", "CCT", "GGT", "GTT", "TAT", "TCT", "GTT", "ATT", "TAC", "TTG", "TAC", "TTG", "ACA", "TTT", "TAT", "CTT", "ACT", "AAT", "GAT", "GTT", "TCT", "TTT", "TTA", "GCA", "CAT", "ATT", "CAG", "TGG", "ATG", "GTT", "ATG", "TTC", "ACA", "CCT", "TTA", "GTA", "CCT", "TTC", "TGG", "ATA", "ACA", "ATT", "GCT", "TAT", "ATC", "ATT", "TGT", "ATT", "TCC", "ACA", "AAG", "CAT", "TTC", "TAT", "TGG", "TTC", "TTT", "AGT", "AAT", "TAC", "CTA", "AAG", "AGA", "CGT", "GTA", "GTC", "TTT", "AAT", "GGT", "GTT", "TCC", "TTT", "AGT", "ACT", "TTT", "GAA", "GAA", "GCT", "GCG", "CTG", "TGC", "ACC", "TTT", "TTG", "TTA", "AAT", "AAA", "GAA", "ATG", "TAT", "CTA", "AAG", "TTG", "CGT", "AGT", "GAT", "GTG", "CTA", "TTA", "CCT", "CTT", "ACG", "CAA", "TAT", "AAT", "AGA", "TAC", "TTA", "GCT", "CTT", "TAT", "AAT", "AAG", "TAC", "AAG", "TAT", "TTT", "AGT", "GGA", "GCA", "ATG", "GAT", "ACA", "ACT", "AGC", "TAC", "AGA", "GAA", "GCT", "GCT", "TGT", "TGT", "CAT", "CTC", "GCA", "AAG", "GCT", "CTC", "AAT", "GAC", "TTC", "AGT", "AAC", "TCA", "GGT", "TCT", "GAT", "GTT", "CTT", "TAC", "CAA", "CCA", "CCA", "CAA", "ACC", "TCT", "ATC", "ACC", "TCA", "GCT", "GTT", "TTG", "CAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_25507",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146, 147, 148, 149, 150, 151, 152, 153, 154, 155, 156, 157, 158, 159, 160, 161, 162, 163, 164, 165, 166, 167, 168, 169, 170, 171, 172, 173, 174, 175, 176, 177, 178, 179, 180, 181, 182, 183, 184, 185, 186, 187, 188, 189, 190, 191, 192, 193, 194, 195, 196, 197, 198, 199, 200, 201, 202, 203, 204, 205, 206, 207, 208, 209, 210, 211, 212, 213, 214, 215, 216, 217, 218, 219, 220, 221, 222, 223, 224, 225, 226, 227, 228, 229, 230, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 241, 242, 243, 244, 245, 246, 247, 248, 249, 250, 251, 252, 253, 254, 255, 256, 257, 258, 259, 260, 261, 262, 263, 264, 265, 266, 267, 268, 269, 270, 271, 272, 273, 274, 275, 276, 277, 278, 279, 280, 281, 282, 283, 284, 285, 286, 287, 288, 289, 290, 291, 292, 293, 294, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 301, 302, 303, 304, 305, 306, 307, 308, 309, 310, 311, 312, 313, 314, 315, 316, 317, 318, 319, 320, 321, 322, 323, 324, 325, 326, 327, 328, 329, 330, 331, 332, 333, 334, 335, 336, 337, 338, 339, 340, 341, 342, 343, 344, 345, 346, 347, 348, 349, 350, 351, 352, 353, 354, 355, 356, 357, 358, 359, 360, 361, 362, 363, 364, 365, 366, 367, 368, 369, 370, 371, 372, 373, 374, 375, 376, 377, 378, 379, 380, 381, 382, 383, 384, 385, 386, 387, 388, 389, 390, 391, 392, 393, 394, 395, 396, 397, 398, 399, 400, 401, 402, 403, 404, 405, 406, 407, 408, 409, 410, 411, 412, 413, 414, 415, 416, 417, 418, 419, 420, 421, 422, 423, 424, 425, 426, 427, 428, 429, 430, 431, 432, 433, 434, 435, 436, 437, 438, 439, 440, 441, 442, 443, 444, 445, 446, 447, 448, 449, 450, 451, 452, 453, 454, 455, 456, 457, 458, 459, 460, 461, 462, 463, 464, 465, 466, 467, 468, 469, 470, 471, 472, 473, 474, 475, 476, 477, 478, 479, 480, 481, 482, 483, 484, 485, 486, 487, 488, 489, 490, 491, 492, 493, 494, 495, 496, 497, 498, 499, 500]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":15327.0386407289,
"Equilibrium frequencies": [
[0.0225388073773276],
[0.01128268157276251],
[0.008621627456782235],
[0.03587160786628842],
[0.01917767952407518],
[0.009600137565055284],
[0.00733591647393286],
[0.03052220945660973],
[0.01421443661990456],
[0.007115592206530206],
[0.005437358551994106],
[0.02262296704227322],
[0.02691381651724733],
[0.01347276351353521],
[0.01029517203671189],
[0.04283464764258543],
[0.01064688992397379],
[0.005329717173646348],
[0.00407268747459141],
[0.01694504300757768],
[0.009059159141466705],
[0.004534916430980586],
[0.003465342858735142],
[0.01441809226551572],
[0.006714620675788843],
[0.003361266002167482],
[0.002568501385680809],
[0.01068664529672772],
[0.0127135583128239],
[0.006364268867421666],
[0.004863237064331357],
[0.02023424623796064],
[0.02285753713917425],
[0.0114422342212445],
[0.008743549137021403],
[0.03637888178015929],
[0.01944887831135567],
[0.009735896725182058],
[0.007439656431044149],
[0.03095383551331603],
[0.01441544832042621],
[0.007216216475215631],
[0.005514250286651514],
[0.0229428869376312],
[0.02729441493070002],
[0.01366328693539138],
[0.01044075994100945],
[0.04344038852378396],
[0.01322547650587592],
[0.04204843538338311],
[0.02247993514194101],
[0.01125321077272311],
[0.008599107432871752],
[0.03577790984107153],
[0.008340844944170258],
[0.006373631775359444],
[0.02651847587661135],
[0.03154817812917837],
[0.01579267447799247],
[0.01206792507768579],
[0.05021045948882349]
],
"Log Likelihood":-6750.245055954442,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[0.4761046688259948, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.5152920264153389, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":911
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":16697.83156120188,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2659909188838144],
[0.1771221271483963],
[0.1873128433580428],
[0.3695741106097464]
],
"Log Likelihood":-6879.953050987596,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.1218846353975549,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.1877668199838235,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.06098203308009026,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":1.911145834111408,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":0.4035361022858029
},
"display order":0,
"estimated parameters":1467
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-27/sequences.nsp4.compressed.fas",
"number of sequences":731,
"number of sites":501,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(((epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1,epi_isl_448187_Scotland_20200414_null_3)Node1455,(epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3,epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_5)Node1452,epi_isl_438451_England_20200330_null_1,epi_isl_442933_England_20200407_null_1,(epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1,epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1)Node1446,(epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1,epi_isl_441294_England_20200402_null_1)Node1443,(epi_isl_440071_England_20200319_null_1,epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1)Node1440,(epi_isl_440558_England_20200402_null_1,epi_isl_441798_England_20200403_null_1)Node1437,(epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1,epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1)Node1434,(epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1,epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1)Node1431,(epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1,epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8)Node1425,(epi_isl_421843_England_20200324_null_1,epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2)Node1422,(epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1,epi_isl_440274_England_20200314_null_1)Node1419,(epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1,epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6)Node1416,epi_isl_420742_England_20200328_null_1,epi_isl_438727_England_20200426_null_2,(epi_isl_423202_England_20200324_null_1,epi_isl_423203_England_20200324_null_1)Node1413,(epi_isl_423868_England_20200318_null_3,epi_isl_423952_England_20200319_null_1)Node1410,(epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1,epi_isl_439910_England_20200324_null_1)Node1407,epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1,epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1,(epi_isl_424000_England_20200321_null_3,epi_isl_424001_England_20200319_null_1)Node1401,(epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1,epi_isl_439661_England_20200327_null_2)Node1398,(epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1)Node1395,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2,epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9)Node1392,(epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2,epi_isl_449071_England_20200506_null_6)Node1389,(epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3,epi_isl_449037_England_20200504_null_12)Node1386,(epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6)Node1383,(epi_isl_449017_England_20200421_null_3,epi_isl_449112_England_20200408_null_4)Node1380,(epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1,epi_isl_442476_England_20200411_null_2)Node1377,(epi_isl_449581_England_20200323_null_1,epi_isl_451268_Louisiana_20200507_null_4)Node1374,(epi_isl_450635_Michigan_20200330_null_6,epi_isl_451826_Bern_20200331_null_5)Node1371,(epi_isl_451165_Ghent_20200331_null_14,epi_isl_451822_Basel_Land_20200331_null_3)Node1368,(epi_isl_441295_England_20200402_null_1,epi_isl_447680_France_20200301_null_3)Node1365,(epi_isl_440437_England_20200316_null_1,epi_isl_442553_England_20200407_null_1)Node1362,(epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4,epi_isl_442298_England_20200405_null_1)Node1359,(epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1)Node1356,(epi_isl_441700_England_20200406_null_3,epi_isl_451521_New_South_Wales_20200314_null_7)Node1353,epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1,epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1,epi_isl_435636_California_20200311_null_1,epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_25507,(epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1,epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1)Node1343,epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4,epi_isl_439877_England_20200323_null_1,epi_isl_451740_Graubunden_20200325_null_1,epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_5,epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_423719_England_20200323_null_1,epi_isl_442609_England_20200408_null_1,epi_isl_442559_England_20200412_null_1,epi_isl_442311_England_20200407_null_1,epi_isl_440623_England_20200402_null_1,epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1,epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1,epi_isl_441311_England_20200402_null_1,epi_isl_417242_England_20200303_null_1,epi_isl_451910_Graubunden_20200407_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1,epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1,epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_2,epi_isl_451866_Zurich_20200407_null_1,epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1,epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_451835_Zurich_20200331_null_1,epi_isl_450615_Michigan_20200324_null_1,epi_isl_450591_Michigan_20200324_null_2,epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1,epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1,epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1,epi_isl_443939_England_20200326_null_1,epi_isl_443823_England_20200326_null_1,epi_isl_443766_England_20200328_null_1,epi_isl_443322_England_20200412_null_1,epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1,epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_442946_England_20200408_null_1,epi_isl_442941_England_20200407_null_1,epi_isl_442847_England_20200408_null_1,epi_isl_442827_England_20200407_null_1,epi_isl_442677_England_20200405_null_1,epi_isl_442635_England_20200406_null_1,epi_isl_442271_England_20200406_null_1,epi_isl_442205_England_20200407_null_1,epi_isl_441756_England_20200405_null_1,epi_isl_441109_England_20200402_null_2,epi_isl_440785_England_20200402_null_1,epi_isl_440580_England_20200403_null_1,epi_isl_440415_England_20200313_null_1,epi_isl_440384_England_20200316_null_1,epi_isl_439976_England_20200320_null_1,epi_isl_439878_England_20200323_null_1,epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1,epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_438428_England_20200330_null_1,epi_isl_438335_England_20200328_null_1,epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1,epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1,epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1,epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1,epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1,epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1,epi_isl_447852_Telangana_20200401_null_2,epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1,epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1,epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1,epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1,epi_isl_424131_England_20200321_null_2,epi_isl_424125_England_20200311_null_1,epi_isl_424070_England_20200321_null_1,epi_isl_423906_England_20200319_null_1,epi_isl_423855_England_20200317_null_1,epi_isl_423833_England_20200323_null_1,epi_isl_423814_England_20200323_null_1,epi_isl_423770_England_20200322_null_1,epi_isl_423757_England_20200324_null_1,epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1,((epi_isl_451539_New_South_Wales_20200405_null_1,epi_isl_451834_Zurich_20200331_null_18)Node119,epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2)Node118,epi_isl_421917_England_20200327_null_1,epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1,epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1,epi_isl_448979_England_20200419_null_1,epi_isl_418769_England_20200318_null_1,epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1,epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1,epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1,epi_isl_441078_England_20200403_null_1,epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2,(epi_isl_442153_England_20200406_null_1,epi_isl_444215_England_20200415_null_5)Node140,epi_isl_439513_England_20200331_null_1,epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2,(epi_isl_443508_England_20200413_null_1,epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11)Node147,epi_isl_423701_England_20200323_null_1,((epi_isl_449317_Scotland_20200508_null_10,epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1,epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1)Node155,epi_isl_447530_Comunitat_Valenciana_20200331_null_2)Node154,epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1,epi_isl_422436_England_20200327_null_1,epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1,(epi_isl_444080_England_20200404_null_1,epi_isl_449672_England_20200415_null_1)Node165,epi_isl_423784_England_20200322_null_1,epi_isl_423558_England_20200331_null_1,(epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_443384_England_20200414_null_2)Node174,((epi_isl_413559_California_20200227_null_1,epi_isl_450712_Illinois_20200415_null_18)Node178,epi_isl_443492_England_20200414_null_2)Node177,epi_isl_442239_England_20200406_null_1,epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4,(epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1,epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1,epi_isl_444134_England_20200408_null_1)Node1253,epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1,epi_isl_439888_England_20200323_null_2,epi_isl_443488_England_20200415_null_2,epi_isl_439903_England_20200401_null_1,epi_isl_442721_England_20200405_null_1,epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3,epi_isl_443070_England_20200411_null_1,epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11,epi_isl_423687_England_20200323_null_1,epi_isl_441056_England_20200403_null_1,epi_isl_440088_England_20200321_null_3,epi_isl_444077_California_20200430_null_5,epi_isl_448888_England_20200417_null_1,epi_isl_448896_England_20200413_null_7,epi_isl_449865_Washington_20200408_null_1,epi_isl_450509_Beirut_20200315_null_6,epi_isl_449324_Scotland_20200427_null_3,(epi_isl_443794_England_20200330_null_1,epi_isl_450111_New_York_20200313_null_6)Node1211,(epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1,epi_isl_429026_California_20200331_null_1)Node1214,epi_isl_440056_England_20200321_null_2,epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1,epi_isl_449174_England_20200416_null_1,epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1,epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1,epi_isl_443513_England_20200415_null_7,epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4,epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1,epi_isl_438965_Kanto_20200414_null_1,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1,epi_isl_441269_England_20200402_null_1,epi_isl_442806_England_20200404_null_1,epi_isl_437572_California_20200421_null_2,epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1,epi_isl_442916_England_20200408_null_1,epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4,epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1,epi_isl_442982_England_20200407_null_6,epi_isl_449709_England_20200416_null_4,epi_isl_449788_Norway_20200411_null_2,epi_isl_444218_England_20200415_null_1,epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1,epi_isl_442484_England_20200331_null_1,epi_isl_451248_Louisiana_20200507_null_1,epi_isl_440422_England_20200317_null_1,epi_isl_443344_England_20200416_null_2,epi_isl_442261_England_20200407_null_1,epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1,epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5,epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2,epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1,epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3,epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1,epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4,epi_isl_436959_LA_20200405_null_1,epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1,epi_isl_447489_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,(epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2,epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1)Node281,epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1,epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1,epi_isl_442090_England_20200406_null_1,epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1,epi_isl_438652_England_20200423_null_2,epi_isl_442366_England_20200409_null_5,epi_isl_443932_England_20200326_null_1,epi_isl_438432_England_20200329_null_1,epi_isl_444244_England_20200419_null_1,epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2,epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2,epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1,epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2,(epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2,epi_isl_451595_New_South_Wales_20200323_null_8)Node306,epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2,epi_isl_452155_Utah_20200410_null_1,epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1,epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1,(epi_isl_449096_England_20200506_null_3,epi_isl_450071_New_York_20200319_null_1)Node316,epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1,epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1,epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1,epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2,epi_isl_423509_England_20200331_null_6,epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1,epi_isl_444293_England_20200413_null_1,epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1,epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1,epi_isl_421807_England_20200325_null_1,epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1,epi_isl_441277_England_20200402_null_1,epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1,epi_isl_448062_England_20200505_null_1,epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_443754_England_20200326_null_1,epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1,epi_isl_439444_England_20200401_null_2,epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3,epi_isl_448410_England_20200429_null_1,epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1,epi_isl_444240_England_20200418_null_1,epi_isl_447605_Kinshasa_20200423_null_2,epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1,epi_isl_449047_England_20200504_null_1,epi_isl_449717_England_20200415_null_1,epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1,epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1,epi_isl_444243_England_20200419_null_2,epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1,epi_isl_447921_Bangkok_20200313_null_2,epi_isl_449120_England_20200409_null_1,epi_isl_439562_England_20200323_null_1,epi_isl_449175_England_20200418_null_8,epi_isl_449724_England_20200417_null_2,epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1,epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1,epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1,epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1,epi_isl_414482_USA_20200218_null_1,epi_isl_443658_England_20200417_null_2,epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1,epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1,epi_isl_448822_England_20200324_null_14,epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1,epi_isl_450120_New_York_20200304_null_1,epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1,epi_isl_420210_England_20200327_null_1,epi_isl_440024_England_20200322_null_1,epi_isl_441321_England_20200401_null_3,epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1,epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1,epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1,(epi_isl_435596_California_20200304_null_2,epi_isl_440193_England_20200321_null_1)Node429,(epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1)Node426,((((epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_1,epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_1)Node416,epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1)Node415,epi_isl_450076_New_York_20200319_null_16,epi_isl_451519_New_South_Wales_20200312_null_1)Node411,epi_isl_423436_England_20200330_null_1)Node410,epi_isl_451936_Bavaria_20200312_null_13,epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1,epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_442962_England_20200407_null_1,epi_isl_443035_England_20200410_null_1,epi_isl_443592_England_20200412_null_1,epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1,epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3,epi_isl_449627_England_20200404_null_1,epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_448014_England_20200101_null_5,epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1,epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2,epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_450295_Wielkopolskie_20200411_null_3,epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1,epi_isl_442571_England_20200410_null_1,epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2,epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1,epi_isl_439427_England_20200330_null_2,epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1,epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1,epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4,epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1,epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1,epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1,epi_isl_442247_England_20200405_null_2,epi_isl_448049_England_20200506_null_5,epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1,epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1,epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7,epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1,epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1,epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1,epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1,epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5,epi_isl_439654_England_20200328_null_2,epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1,epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1,epi_isl_439648_England_20200322_null_4,epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1,epi_isl_440728_England_20200405_null_2,epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1,epi_isl_440298_England_20200314_null_1,epi_isl_447795_Valle_del_Cauca_20200404_null_1,epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1,epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2,epi_isl_439664_England_20200330_null_1,epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1,(epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1,epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3,epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1)Node521,epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1,epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1,epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2,(epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1,epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1)Node531,epi_isl_449718_England_20200417_null_16,epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1,epi_isl_421847_England_20200326_null_1,epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1,((epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1,epi_isl_440907_England_20200420_null_1)Node555,epi_isl_439985_England_20200322_null_1)Node554,(epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1,(epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1)Node547,epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1,epi_isl_450405_Hong_Kong_20200308_null_30)Node542,(epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1,epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1)Node551,epi_isl_449029_England_20200420_null_1,epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1,epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1,epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1,epi_isl_443875_England_20200330_null_1,(epi_isl_444369_England_20200428_null_2,epi_isl_444398_England_20200419_null_28)Node570,(epi_isl_438654_England_20200423_null_1,epi_isl_450701_Wisconsin_20200418_null_1)Node573,epi_isl_438729_England_20200426_null_1,(epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1,epi_isl_447808_Tolima_20200404_null_1)Node581,epi_isl_443780_England_20200327_null_2,epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1,epi_isl_425615_England_20200329_null_3,epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2,epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1,epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1,(epi_isl_421834_England_20200326_null_1,epi_isl_448531_England_20200406_null_2)Node595,epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2,epi_isl_443378_England_20200416_null_1,epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1,epi_isl_423210_England_20200327_null_1,epi_isl_442884_England_20200407_null_1,epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1,epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_441740_England_20200406_null_3,epi_isl_451786_Graubunden_20200325_null_1,epi_isl_421831_England_20200323_null_3,(epi_isl_450648_Quebec_20200413_null_1,epi_isl_450650_Quebec_20200408_null_2)Node617,epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1,epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1,(epi_isl_442086_England_20200405_null_1,epi_isl_450824_Uppsala_20200426_null_7)Node624,epi_isl_438337_England_20200330_null_1,epi_isl_448291_England_20200414_null_2,((epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6,epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1,epi_isl_447765_Antioquia_20200331_null_7)Node632,epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2)Node631,epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1,epi_isl_449009_England_20200420_null_1,epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1,(epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2,epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1)Node643,epi_isl_423863_England_20200317_null_1,epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3,epi_isl_449237_Scotland_20200426_null_1,epi_isl_450049_New_Jersey_20200315_null_1,epi_isl_441832_England_20200403_null_4,(epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_451488_New_South_Wales_20200325_null_21,epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1,epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1,epi_isl_451278_Louisiana_20200506_null_1)Node654,(epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2,epi_isl_441918_England_20200410_null_1)Node663,epi_isl_452112_Texas_20200310_null_1,((epi_isl_433733_England_20200405_null_2,epi_isl_451591_New_South_Wales_20200331_null_26)Node673,epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4)Node672,epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_448913_England_20200415_null_6,((epi_isl_432999_England_20200402_null_1,epi_isl_442210_England_20200403_null_2)Node682,epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1)Node681,epi_isl_447616_Taipei_20200321_null_3,epi_isl_450807_Skane_20200320_null_1,((epi_isl_420518_England_20200323_null_1,epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1)Node691,epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1)Node690,epi_isl_448108_England_20200507_null_4,epi_isl_450463_California_20200325_null_3,(epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14,epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2)Node699,((epi_isl_443008_England_20200407_null_2,epi_isl_444247_England_20200418_null_3)Node703,epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1)Node702,epi_isl_450271_Saint_Petersburg_20200421_null_1,epi_isl_448539_England_20200406_null_1,(epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1,epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_1)Node711,epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1,epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2,epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1,(epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1,epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_12)Node722,epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1,epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1,epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1,((epi_isl_451351_Sichuan_20200127_null_1,epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1,epi_isl_448369_England_20200503_null_7)Node734,epi_isl_451862_Zurich_20200407_null_2)Node733,epi_isl_448551_England_20200406_null_6,epi_isl_447713_France_20200301_null_3,epi_isl_451732_Basel_Stadt_20200316_null_10,epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1,epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1,(epi_isl_417288_England_20200305_null_1,epi_isl_441525_England_20200423_null_4)Node762,(epi_isl_418750_England_20200318_null_1,epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1,epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1,epi_isl_421662_India_20200310_null_1,epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_62)Node748,(epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1,epi_isl_433033_England_20200403_null_3,epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1)Node757,epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1,epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1,epi_isl_449607_England_20200427_null_1,epi_isl_429004_California_20200328_null_1,(epi_isl_448701_England_20200101_null_1,epi_isl_448532_England_20200406_null_2,epi_isl_449632_England_20200404_null_1)Node781,(epi_isl_442650_England_20200406_null_1,epi_isl_449719_England_20200417_null_3)Node777,epi_isl_451960_Virginia_20200401_null_57,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6,epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1,(epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1,(epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5,epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17,(epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1,epi_isl_414522_England_20200228_null_1)Node1164,epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1)Node1161,((epi_isl_452049_Denmark_20200414_null_1,epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_72)Node1157,epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1)Node1156,epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8,epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1,epi_isl_452068_Denmark_20200427_null_9)Node1148,epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3,epi_isl_448103_England_20200508_null_21,epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2,((epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1,epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8)Node1138,epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4)Node1137,epi_isl_443365_England_20200415_null_2,(epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_442891_England_20200407_null_1,epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_43)Node1128,(epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1,epi_isl_432713_England_20200325_null_1)Node1133,((epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1,epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11)Node1111,epi_isl_440411_England_20200312_null_1)Node1110,(epi_isl_440742_England_20200403_null_2,epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7)Node1115,epi_isl_444128_England_20200408_null_4,epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1,epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1,epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2,((epi_isl_451194_Uganda_20200322_null_3,epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4,epi_isl_450529_Pomorskie_20200331_null_150,epi_isl_440360_England_20200321_null_1,epi_isl_439810_England_20200413_null_2,epi_isl_443666_England_20200413_null_1)Node1079,epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9)Node1078,((epi_isl_432680_England_20200406_null_1,epi_isl_451422_New_York_20200320_null_10)Node1092,epi_isl_440223_England_20200321_null_1)Node1091,((epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1,epi_isl_448032_England_20200501_null_3)Node1099,epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1)Node1098,((epi_isl_449669_England_20200415_null_1,epi_isl_449715_England_20200416_null_68)Node1104,epi_isl_443659_England_20200416_null_7)Node1103,(epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1,epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1,epi_isl_451236_Louisiana_20200504_null_6)Node1070,(epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2,epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2)Node1064,(epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1,epi_isl_450454_California_20200325_null_11)Node1067,(((epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14,epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1)Node1057,epi_isl_449042_England_20200504_null_1)Node1056,epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1)Node1055,(epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2)Node1049,(epi_isl_452039_Denmark_20200414_null_2,epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1)Node1052,epi_isl_448230_England_20200413_null_1,(epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15,epi_isl_449640_England_20200404_null_3)Node1040,(epi_isl_441352_England_20200420_null_1,epi_isl_441555_England_20200405_null_1)Node1043,((epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3,epi_isl_449539_England_20200330_null_39)Node1031,epi_isl_443953_England_20200330_null_7)Node1030,epi_isl_435626_California_20200307_null_1,epi_isl_448485_England_20200405_null_1,((epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1,epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3,epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1,epi_isl_441603_England_20200406_null_1)Node1021,epi_isl_440287_England_20200321_null_2)Node1020,((epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1,epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2)Node1016,epi_isl_421851_England_20200327_null_1)Node1015,((epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1,epi_isl_440485_England_20200311_null_1)Node1011,epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1)Node1010,((epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1,epi_isl_452130_Colorado_20200307_null_7)Node1006,epi_isl_420775_England_20200330_null_1)Node1005,((epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1,epi_isl_448411_England_20200429_null_2)Node1001,epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2)Node1000,((epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1,epi_isl_448826_England_20200416_null_26)Node996,epi_isl_443073_England_20200411_null_7)Node995,(epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1,epi_isl_421665_India_20200310_null_1,epi_isl_440561_England_20200402_null_1)Node981,(epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1,epi_isl_442637_England_20200407_null_1,epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3)Node976,((epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1,epi_isl_450849_Florida_20200409_null_68)Node972,epi_isl_451711_Ticino_20200316_null_7)Node971,(epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1,epi_isl_449181_Scotland_20200423_null_11)Node968,(epi_isl_420676_England_20200328_null_1,epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1)Node965,(epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5,epi_isl_447895_California_20200408_null_9)Node962,(epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1,epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1)Node959,(epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1)Node956,(epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1,epi_isl_449695_England_20200415_null_3)Node953,(epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2,epi_isl_441554_England_20200406_null_2)Node950,(epi_isl_420756_England_20200327_null_2,epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1)Node947,(epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1,epi_isl_448275_England_20200101_null_1)Node944,(epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1,epi_isl_448364_England_20200503_null_3)Node941,(epi_isl_414619_USA_20200307_null_1,epi_isl_448502_England_20200407_null_6)Node938,epi_isl_452134_Illinois_20200305_null_13,(epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2,epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6)Node934,(epi_isl_415600_USA_20200309_null_1,epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1)Node931,(epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1,epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1)Node928,((epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1,epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1)Node892,epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1,epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1,epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1,epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1,epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1,epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1,epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2,epi_isl_447918_Bangkok_20200201_null_1,epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1,epi_isl_429060_California_20200331_null_1,(epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1,epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4)Node868,epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2,epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1,epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1,epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1,epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1,epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15,epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2,epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1,epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1,epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1,epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1,epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9,epi_isl_452133_Minnesota_20200310_null_1896,epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1,epi_isl_413752_China_20200201_null_1,epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_413695_China_20200101_null_1,epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1,(epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1,epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_33)Node896,epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1,epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2,(epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1,epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2,epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1,epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_324,epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1,epi_isl_439651_England_20200325_null_1,epi_isl_440043_England_20200313_null_1,epi_isl_451506_New_South_Wales_20200325_null_2)Node902,(epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1,epi_isl_440140_England_20200315_null_1)Node921)Node826,(epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2,epi_isl_439825_England_20200415_null_16)Node925,(epi_isl_449486_Wuhan_20200122_null_5,epi_isl_449511_England_20200331_null_2)Node987,((epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1,epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4)Node991,epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1)Node990)Node1,epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1,epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node1":"test",
"Node1000":"test",
"Node1001":"test",
"Node1005":"test",
"Node1006":"test",
"Node1010":"test",
"Node1011":"test",
"Node1015":"test",
"Node1016":"test",
"Node1020":"test",
"Node1021":"test",
"Node1030":"test",
"Node1031":"test",
"Node1040":"test",
"Node1043":"test",
"Node1049":"test",
"Node1052":"test",
"Node1055":"test",
"Node1056":"test",
"Node1057":"test",
"Node1064":"test",
"Node1067":"test",
"Node1070":"test",
"Node1078":"test",
"Node1079":"test",
"Node1091":"test",
"Node1092":"test",
"Node1098":"test",
"Node1099":"test",
"Node1103":"test",
"Node1104":"test",
"Node1110":"test",
"Node1111":"test",
"Node1115":"test",
"Node1128":"test",
"Node1133":"test",
"Node1137":"test",
"Node1138":"test",
"Node1148":"test",
"Node1156":"test",
"Node1157":"test",
"Node1161":"test",
"Node1164":"test",
"Node118":"test",
"Node119":"test",
"Node1211":"test",
"Node1214":"test",
"Node1253":"test",
"Node1343":"test",
"Node1353":"test",
"Node1356":"test",
"Node1359":"test",
"Node1362":"test",
"Node1365":"test",
"Node1368":"test",
"Node1371":"test",
"Node1374":"test",
"Node1377":"test",
"Node1380":"test",
"Node1383":"test",
"Node1386":"test",
"Node1389":"test",
"Node1392":"test",
"Node1395":"test",
"Node1398":"test",
"Node140":"test",
"Node1401":"test",
"Node1407":"test",
"Node1410":"test",
"Node1413":"test",
"Node1416":"test",
"Node1419":"test",
"Node1422":"test",
"Node1425":"test",
"Node1431":"test",
"Node1434":"test",
"Node1437":"test",
"Node1440":"test",
"Node1443":"test",
"Node1446":"test",
"Node1452":"test",
"Node1455":"test",
"Node147":"test",
"Node154":"test",
"Node155":"test",
"Node165":"test",
"Node174":"test",
"Node177":"test",
"Node178":"test",
"Node281":"test",
"Node306":"test",
"Node316":"test",
"Node410":"test",
"Node411":"test",
"Node415":"test",
"Node416":"test",
"Node426":"test",
"Node429":"test",
"Node521":"test",
"Node531":"test",
"Node542":"test",
"Node547":"test",
"Node551":"test",
"Node554":"test",
"Node555":"test",
"Node570":"test",
"Node573":"test",
"Node581":"test",
"Node595":"test",
"Node617":"test",
"Node624":"test",
"Node631":"test",
"Node632":"test",
"Node643":"test",
"Node654":"test",
"Node663":"test",
"Node672":"test",
"Node673":"test",
"Node681":"test",
"Node682":"test",
"Node690":"test",
"Node691":"test",
"Node699":"test",
"Node702":"test",
"Node703":"test",
"Node711":"test",
"Node722":"test",
"Node733":"test",
"Node734":"test",
"Node748":"test",
"Node757":"test",
"Node762":"test",
"Node777":"test",
"Node781":"test",
"Node826":"test",
"Node868":"test",
"Node892":"test",
"Node896":"test",
"Node902":"test",
"Node921":"test",
"Node925":"test",
"Node928":"test",
"Node931":"test",
"Node934":"test",
"Node938":"test",
"Node941":"test",
"Node944":"test",
"Node947":"test",
"Node950":"test",
"Node953":"test",
"Node956":"test",
"Node959":"test",
"Node962":"test",
"Node965":"test",
"Node968":"test",
"Node971":"test",
"Node972":"test",
"Node976":"test",
"Node981":"test",
"Node987":"test",
"Node990":"test",
"Node991":"test",
"Node995":"test",
"Node996":"test",
"epi_isl_410218_Taipei_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_411951_Sweden_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_412900_Hubei_20191230_null_1":"background",
"epi_isl_413559_California_20200227_null_1":"background",
"epi_isl_413695_China_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_413752_China_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_413856_Guangdong_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_414448_Limburg_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414482_USA_20200218_null_1":"background",
"epi_isl_414520_Munich_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_414522_England_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_414567_Hong_Kong_20200210_null_1":"background",
"epi_isl_414619_USA_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_414634_Hauts_de_France_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_414935_Shandong_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_415479_Netherlands_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_415600_USA_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_415644_Tbilisi_20200228_null_1":"background",
"epi_isl_415787_Lima_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_416339_Shanghai_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_416365_Shanghai_20200130_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416399_Shanghai_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_416403_Shanghai_20200202_null_1":"background",
"epi_isl_416415_Victoria_20200208_null_1":"background",
"epi_isl_416429_Vinhphuc_20200211_null_1":"background",
"epi_isl_416455_Washington_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_416478_Tbilisi_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_416680_Washington_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_416758_ARA_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417115_Washington_20200303_null_2":"background",
"epi_isl_417131_Washington_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417182_Hong_Kong_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_417242_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417288_England_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_417354_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_417359_Washington_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_417367_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_417393_New_South_Wales_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_417444_Gilgit_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_417484_Oslo_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_417690_Reykjavik_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_417925_Minas_Gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_417979_Madrid_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_418087_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418109_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418356_Ontario_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_418750_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418769_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_418805_Deinze_20200306_null_1":"background",
"epi_isl_418952_Washington_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419225_Hong_Kong_20200213_null_1":"background",
"epi_isl_419238_Basque_Country_20200305_null_1":"background",
"epi_isl_419243_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419244_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419245_Hong_Kong_20200222_null_1":"background",
"epi_isl_419246_Hong_Kong_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_419252_Hong_Kong_20200226_null_1":"background",
"epi_isl_419400_Wales_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419444_Wales_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419699_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419709_BasqueCountry_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_419737_Victoria_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_419811_Victoria_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_419856_Victoria_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_419917_Victoria_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_420111_Singapore_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_420210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_420298_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_420518_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_420567_Abruzzo_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_420628_Virginia_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420676_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420742_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_420756_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_420775_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_420796_Texas_20200229_null_1":"background",
"epi_isl_420915_Wales_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_420916_Wales_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_421243_Jiangxi_20200121_null_1":"background",
"epi_isl_421511_Hauts_de_France_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_421589_New_York_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_421662_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421665_India_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_421807_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421831_England_20200323_null_3":"background",
"epi_isl_421834_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421843_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_421847_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421851_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421917_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422125_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422291_Wales_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_422304_Wales_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_422311_Wales_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422369_Wales_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_422406_Greater_Accra_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_422436_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422633_Zuid_Holland_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422899_Utrecht_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_422952_Zuid_Holland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_422991_Washington_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423202_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423203_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423210_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_423436_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_423509_England_20200331_null_6":"background",
"epi_isl_423558_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423687_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423701_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423719_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423757_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423770_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423784_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_423814_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423833_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_423855_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423863_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_423868_England_20200318_null_3":"background",
"epi_isl_423906_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423952_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424000_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_424001_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424070_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424125_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_424131_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_424297_Washington_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_424328_Washington_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_424462_Reykjavik_20200320_null_15":"background",
"epi_isl_424579_Reykjavik_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_424613_Reykjavik_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_424888_South_Carolina_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_424943_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_424982_Michigan_20200310_null_2":"background",
"epi_isl_425148_Wisconsin_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_425167_Wisconsin_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_425199_Comunitat_Valenciana_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_425615_England_20200329_null_3":"background",
"epi_isl_425922_Scotland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_426053_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_426057_Idaho_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_426109_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426167_South_Korea_20200223_null_14":"background",
"epi_isl_426291_New_York_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_426322_New_York_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_426421_Hawaii_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_426569_Arizona_20200402_null_14":"background",
"epi_isl_426628_Louisiana_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_426673_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426699_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_426770_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426773_Victoria_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_426786_Victoria_20200323_null_4":"background",
"epi_isl_426810_Victoria_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_426815_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_426830_Victoria_20200325_null_8":"background",
"epi_isl_427219_Washington_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_427416_Doha_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_427450_Illinois_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_427570_New_York_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_427621_Alaska_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_427743_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427777_New_South_Wales_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_427807_New_South_Wales_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428312_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428365_Ile_De_France_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_428367_Normandie_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_428480_Karnataka_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428940_Luxembourg_20200402_null_4":"background",
"epi_isl_428952_Luxembourg_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_429004_California_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_429026_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429060_California_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429217_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429221_Switzerland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_429223_Switzerland_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_429235_Abruzzo_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_429598_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_429607_Washington_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_429679_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429688_Minas_gerais_20200317_null_2":"background",
"epi_isl_430151_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430227_Washington_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_430330_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_430404_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430471_Victoria_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_430527_Victoria_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_430538_Victoria_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_430569_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430600_Victoria_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_430654_Victoria_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_430683_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430684_Victoria_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_430693_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430704_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430711_Victoria_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430729_Beijing_20200207_null_1":"background",
"epi_isl_430737_Beijing_20200225_null_1":"background",
"epi_isl_430858_Norrbotten_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_430895_Washington_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_430980_Washington_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_431084_Connecticut_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_431781_Fujian_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_431905_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432075_Wales_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_432133_Wales_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_432180_Wales_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432194_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432217_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_432228_Wales_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_432294_Wales_20200403_null_6":"background",
"epi_isl_432409_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_432445_Wales_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_432680_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_432713_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_432999_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433033_England_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_433109_Scotland_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_433127_Scotland_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_433140_Scotland_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_433202_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433250_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433447_Scotland_20200412_null_4":"background",
"epi_isl_433586_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433660_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_433733_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_434067_Washington_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_434082_Washington_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_434091_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434103_Washington_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_434137_Washington_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_434270_Washington_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434305_Washington_20200331_null_15":"background",
"epi_isl_434365_Ghent_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_434456_Athens_20200322_null_2":"background",
"epi_isl_434547_Puerto_Rico_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434548_Puerto_Rico_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_434553_Puerto_Rico_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_434628_Occitanie_20200407_null_7":"background",
"epi_isl_434688_District_of_Columbia_20200314_null_2":"background",
"epi_isl_434728_Texas_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_434891_Texas_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_434983_Texas_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_434997_Texas_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_435067_Delhi_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_435073_Delhi_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_435079_Tamil_Nadu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435090_Jammu_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_435091_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435099_Uttar_Pradesh_20200329_null_4":"background",
"epi_isl_435316_Hanoi_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435411_Baranya_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_435482_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_435491_New_York_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_435596_California_20200304_null_2":"background",
"epi_isl_435626_California_20200307_null_1":"background",
"epi_isl_435636_California_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435674_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435675_Brunei_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_435682_Singapore_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_435685_Singapore_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_435690_Singapore_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_435696_Singapore_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_436105_Taipei_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436121_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_436196_Comunitat_Valenciana_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_436205_Comunitat_Valenciana_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436230_Comunitat_Valenciana_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436378_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436395_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436411_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_436414_West_Bengal_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436418_Tamil_Nadu_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436421_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436422_Assam_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_436436_Delhi_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_436441_Bihar_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_436454_Delhi_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_436491_Pennsylvania_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_436624_Wisconsin_20200426_null_8":"background",
"epi_isl_436625_Wisconsin_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_436638_Wisconsin_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_436720_Abruzzo_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_436808_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_436809_Michigan_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_436834_Michigan_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_436881_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_436899_Wisconsin_20200503_null_2":"background",
"epi_isl_436959_LA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_437009_Unknown_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_437093_Latvia_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_437137_Michigan_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437224_Bavaria_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437243_Bavaria_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_437245_Bavaria_20200311_null_2":"background",
"epi_isl_437294_Bavaria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_437306_Kocaeli_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_437329_Ankara_20200319_null_17":"background",
"epi_isl_437334_Ankara_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_437524_Oregon_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_437572_California_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_437633_Unknown_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_437727_Makkah_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_437786_Virginia_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_437801_Virginia_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_437809_Washington_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_437880_Athens_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_438039_Vienna_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_438092_Vienna_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_438106_Vienna_20200325_null_4":"background",
"epi_isl_438110_Vienna_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_438198_Washington_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_438222_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438247_Maryland_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_438335_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_438337_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438428_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438432_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438451_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_438652_England_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_438654_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_438727_England_20200426_null_2":"background",
"epi_isl_438729_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_438809_Scotland_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_438841_Scotland_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_438847_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438848_Scotland_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_438899_Scotland_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438910_Scotland_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_438965_Kanto_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438968_Kanto_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_438986_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439115_Scotland_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_439137_Scotland_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_439223_Scotland_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_439341_Scotland_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_439357_Scotland_20200501_null_1":"background",
"epi_isl_439427_England_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_439444_England_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_439513_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_439562_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439648_England_20200322_null_4":"background",
"epi_isl_439651_England_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_439654_England_20200328_null_2":"background",
"epi_isl_439661_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_439664_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_439810_England_20200413_null_2":"background",
"epi_isl_439825_England_20200415_null_16":"background",
"epi_isl_439877_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439878_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_439888_England_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_439903_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_439910_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439976_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_439985_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440024_England_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_440043_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440056_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440071_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_440088_England_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_440140_England_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_440193_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440223_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440274_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440287_England_20200321_null_2":"background",
"epi_isl_440298_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440360_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_440384_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440411_England_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_440415_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_440422_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_440437_England_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_440485_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440558_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440561_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440580_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440623_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440728_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_440742_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440785_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_440907_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441056_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441078_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441269_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441277_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441294_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441295_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441311_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441321_England_20200401_null_3":"background",
"epi_isl_441352_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_441393_Northern_Ireland_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_441525_England_20200423_null_4":"background",
"epi_isl_441554_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_441555_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441603_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441699_Northern_Ireland_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441700_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441740_England_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_441756_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441832_England_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442086_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442090_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442153_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442205_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442210_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_442239_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442247_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442261_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442271_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442298_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442311_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442366_England_20200409_null_5":"background",
"epi_isl_442476_England_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_442484_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_442553_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442559_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_442571_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442609_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442635_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442637_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442650_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_442677_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442721_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442806_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_442827_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442847_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442884_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442891_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442916_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442933_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442941_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442946_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442962_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_442982_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_443008_England_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_443035_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_443070_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443073_England_20200411_null_7":"background",
"epi_isl_443231_Singapore_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_443246_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443249_Singapore_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_443256_Minnesota_20200403_null_4":"background",
"epi_isl_443296_Ile_de_France_20200319_null_4":"background",
"epi_isl_443302_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443317_Ile_de_France_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_443322_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443344_England_20200416_null_2":"background",
"epi_isl_443365_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443378_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_443384_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443488_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_443492_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_443508_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443513_England_20200415_null_7":"background",
"epi_isl_443592_England_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_443658_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_443659_England_20200416_null_7":"background",
"epi_isl_443666_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443754_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443766_England_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_443780_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_443794_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443823_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443875_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_443932_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443939_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_443953_England_20200330_null_7":"background",
"epi_isl_444077_California_20200430_null_5":"background",
"epi_isl_444080_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_444128_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_444134_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_444215_England_20200415_null_5":"background",
"epi_isl_444218_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_444240_England_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_444243_England_20200419_null_2":"background",
"epi_isl_444244_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_444247_England_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_444277_Taoyuan_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444293_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_444369_England_20200428_null_2":"background",
"epi_isl_444398_England_20200419_null_28":"background",
"epi_isl_444555_Illinois_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_444596_Illinois_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_444604_Illinois_20200321_null_9":"background",
"epi_isl_444630_New_York_20200330_null_3":"background",
"epi_isl_444637_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444641_New_York_20200330_null_5":"background",
"epi_isl_444759_New_York_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444844_Unknown_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444886_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444906_Unknown_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444918_Unknown_20200330_null_2":"background",
"epi_isl_444976_Catalonia_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_444998_Guam_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_445009_Florida_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_445029_Florida_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_445040_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445042_Florida_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445083_Texas_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_445088_Iran_20200326_null_4":"background",
"epi_isl_445132_Louisiana_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_445153_Louisiana_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_445263_Santiago_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_445344_Temuco_20200326_null_8":"background",
"epi_isl_445351_Santiago_20200402_null_12":"background",
"epi_isl_445490_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_445564_Wales_20200406_null_7":"background",
"epi_isl_445602_Wales_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_445619_Wales_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_445666_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445675_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_2":"background",
"epi_isl_445763_Wales_20200412_null_11":"background",
"epi_isl_445903_Wales_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_445930_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445944_Wales_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_445954_Wales_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_446024_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446164_Wales_20200406_null_3":"background",
"epi_isl_446177_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_446185_Wales_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_446206_Wales_20200406_null_11":"background",
"epi_isl_446316_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_9":"background",
"epi_isl_446497_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446555_Wales_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_446621_Wales_20200409_null_11":"background",
"epi_isl_446625_Wales_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_446644_Wales_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_446659_Wales_20200415_null_9":"background",
"epi_isl_446661_Wales_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_446756_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446768_Wales_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_446778_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446797_Wales_20200421_null_2":"background",
"epi_isl_446847_Wales_20200416_null_6":"background",
"epi_isl_446862_Wales_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_446881_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446909_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_446914_Wales_20200416_null_3":"background",
"epi_isl_446933_Wales_20200416_null_5":"background",
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_3":"background",
"epi_isl_446952_Wales_20200420_null_2":"background",
"epi_isl_447005_Bangkok_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447006_Bangkok_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447009_Bangkok_20200329_null_6":"background",
"epi_isl_447030_Gujarat_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_447037_Gujarat_20200503_null_4":"background",
"epi_isl_447095_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_447111_Michigan_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_447118_Michigan_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_447242_Kinshasa_20200424_null_6":"background",
"epi_isl_447272_South_Coast_District_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_447300_South_Coast_District_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_447329_South_District_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_447332_Jerusalem_District_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_447435_South_Coast_District_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447489_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447490_Comunitat_Valenciana_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_447517_Comunitat_Valenciana_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447530_Comunitat_Valenciana_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_447563_Telangana_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_447605_Kinshasa_20200423_null_2":"background",
"epi_isl_447616_Taipei_20200321_null_3":"background",
"epi_isl_447680_France_20200301_null_3":"background",
"epi_isl_447713_France_20200301_null_3":"background",
"epi_isl_447765_Antioquia_20200331_null_7":"background",
"epi_isl_447795_Valle_del_Cauca_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_447808_Tolima_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_447845_Puerto_Rico_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_447852_Telangana_20200401_null_2":"background",
"epi_isl_447865_Telangana_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_447866_Telangana_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_447895_California_20200408_null_9":"background",
"epi_isl_447918_Bangkok_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_447921_Bangkok_20200313_null_2":"background",
"epi_isl_448014_England_20200101_null_5":"background",
"epi_isl_448032_England_20200501_null_3":"background",
"epi_isl_448049_England_20200506_null_5":"background",
"epi_isl_448062_England_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_448103_England_20200508_null_21":"background",
"epi_isl_448108_England_20200507_null_4":"background",
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_448187_Scotland_20200414_null_3":"background",
"epi_isl_448230_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_448275_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448291_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_448364_England_20200503_null_3":"background",
"epi_isl_448369_England_20200503_null_7":"background",
"epi_isl_448410_England_20200429_null_1":"background",
"epi_isl_448411_England_20200429_null_2":"background",
"epi_isl_448485_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448502_England_20200407_null_6":"background",
"epi_isl_448531_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_448532_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_448539_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448551_England_20200406_null_6":"background",
"epi_isl_448701_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448822_England_20200324_null_14":"background",
"epi_isl_448826_England_20200416_null_26":"background",
"epi_isl_448888_England_20200417_null_1":"background",
"epi_isl_448896_England_20200413_null_7":"background",
"epi_isl_448913_England_20200415_null_6":"background",
"epi_isl_448979_England_20200419_null_1":"background",
"epi_isl_449009_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449017_England_20200421_null_3":"background",
"epi_isl_449029_England_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_449037_England_20200504_null_12":"background",
"epi_isl_449042_England_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_449047_England_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_449071_England_20200506_null_6":"background",
"epi_isl_449096_England_20200506_null_3":"background",
"epi_isl_449112_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449120_England_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_449174_England_20200416_null_1":"background",
"epi_isl_449175_England_20200418_null_8":"background",
"epi_isl_449181_Scotland_20200423_null_11":"background",
"epi_isl_449186_Scotland_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_449237_Scotland_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_449317_Scotland_20200508_null_10":"background",
"epi_isl_449324_Scotland_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_449486_Wuhan_20200122_null_5":"background",
"epi_isl_449511_England_20200331_null_2":"background",
"epi_isl_449539_England_20200330_null_39":"background",
"epi_isl_449581_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_449607_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_449627_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_449632_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_449640_England_20200404_null_3":"background",
"epi_isl_449669_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449672_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449695_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_449709_England_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_449715_England_20200416_null_68":"background",
"epi_isl_449717_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_449718_England_20200417_null_16":"background",
"epi_isl_449719_England_20200417_null_3":"background",
"epi_isl_449724_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_449788_Norway_20200411_null_2":"background",
"epi_isl_449865_Washington_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_450049_New_Jersey_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_450071_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450076_New_York_20200319_null_16":"background",
"epi_isl_450111_New_York_20200313_null_6":"background",
"epi_isl_450120_New_York_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_450211_Bavaria_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_450271_Saint_Petersburg_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_450295_Wielkopolskie_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_450405_Hong_Kong_20200308_null_30":"background",
"epi_isl_450454_California_20200325_null_11":"background",
"epi_isl_450463_California_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_450509_Beirut_20200315_null_6":"background",
"epi_isl_450514_Beirut_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_450529_Pomorskie_20200331_null_150":"background",
"epi_isl_450591_Michigan_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_450615_Michigan_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_450635_Michigan_20200330_null_6":"background",
"epi_isl_450648_Quebec_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_450650_Quebec_20200408_null_2":"background",
"epi_isl_450701_Wisconsin_20200418_null_1":"background",
"epi_isl_450712_Illinois_20200415_null_18":"background",
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_33":"background",
"epi_isl_450807_Skane_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_450824_Uppsala_20200426_null_7":"background",
"epi_isl_450849_Florida_20200409_null_68":"background",
"epi_isl_451165_Ghent_20200331_null_14":"background",
"epi_isl_451193_Uganda_20200330_null_62":"background",
"epi_isl_451194_Uganda_20200322_null_3":"background",
"epi_isl_451236_Louisiana_20200504_null_6":"background",
"epi_isl_451248_Louisiana_20200507_null_1":"background",
"epi_isl_451268_Louisiana_20200507_null_4":"background",
"epi_isl_451278_Louisiana_20200506_null_1":"background",
"epi_isl_451351_Sichuan_20200127_null_1":"background",
"epi_isl_451422_New_York_20200320_null_10":"background",
"epi_isl_451488_New_South_Wales_20200325_null_21":"background",
"epi_isl_451506_New_South_Wales_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451519_New_South_Wales_20200312_null_1":"background",
"epi_isl_451521_New_South_Wales_20200314_null_7":"background",
"epi_isl_451539_New_South_Wales_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_451591_New_South_Wales_20200331_null_26":"background",
"epi_isl_451595_New_South_Wales_20200323_null_8":"background",
"epi_isl_451636_New_South_Wales_20200310_null_5":"background",
"epi_isl_451654_Pomorze_20200504_null_43":"background",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451707_Schwyz_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451711_Ticino_20200316_null_7":"background",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451727_Graubunden_20200316_null_324":"background",
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451732_Basel_Stadt_20200316_null_10":"background",
"epi_isl_451740_Graubunden_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451758_Schaffhausen_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451786_Graubunden_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451787_Vaud_20200325_null_5":"background",
"epi_isl_451822_Basel_Land_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_451826_Bern_20200331_null_5":"background",
"epi_isl_451834_Zurich_20200331_null_18":"background",
"epi_isl_451835_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451838_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451846_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451858_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451860_Valais_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451862_Zurich_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_451866_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_451903_Valais_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451910_Graubunden_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451936_Bavaria_20200312_null_13":"background",
"epi_isl_451960_Virginia_20200401_null_57":"background",
"epi_isl_452039_Denmark_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_452045_Denmark_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_452049_Denmark_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_452068_Denmark_20200427_null_9":"background",
"epi_isl_452090_Denmark_20200426_null_72":"background",
"epi_isl_452112_Texas_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_452130_Colorado_20200307_null_7":"background",
"epi_isl_452133_Minnesota_20200310_null_1896":"background",
"epi_isl_452134_Illinois_20200305_null_13":"background",
"epi_isl_452155_Utah_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_25507":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":48
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":15
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":65
}
}
}