{
"MLE":{
"content":{
"0":{
"by-branch":{
"AVERAGED": [
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002639182388796861],
[122.0141440765653, 299.1691199711, 0, 1, 0.2896937140948624, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7103062859051376, 1, 0.002577838849488685],
[100.5092612466771, 245.8972727321261, 0, 1, 0.2901482835564162, 0, 0.004066738882010185, 0.0176922168932183, 0.7098517164435838, 1, 0.001342394656832012],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006641816333255362],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002058085021130684],
[121.8128985215564, 299.4493682046133, 0, 1, 0.2891616651741031, 0, 0.003339462714500374, 0.01452822528466636, 0.7108383348258969, 1, 0.002637167100946327],
[121.9428431968135, 299.370365526109, 1, 0, 0.2894351296662277, 0.00820056326213436, 0, -0.03567628709137159, 1, 0.2894351296662276, 0.002656898648338785],
[100.3080156916682, 246.0908164883825, 0, 1, 0.2895737698085836, 0, 0.004063540502118689, 0.0176783024442239, 0.7104262301914164, 1, 0.001331430716984381],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001221356122857211],
[121.9428431968135, 299.2404208508518, 1, 0, 0.2895244270271224, 0.00820056326213436, 0, -0.03567628709137159, 1, 0.2895244270271224, 0.002644036589020645],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002697774889538726],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002234719129269387],
[121.8128985215564, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2892648729454045, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7107351270545954, 1, 0.002124465084197333],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.001989240090378757],
[121.8841994013082, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2893851912110034, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7106148087889965, 1, 0.002016383256138158],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 1, 0.2900885746059592, 0, 0.004065560023850582, 0.01768708830865678, 0.7099114253940408, 1, 0.00133444482370787],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001221089167449251],
[121.7845261707648, 299.3987378769006, 1, 0, 0.2891485407097809, 0.008211223801928761, 0, -0.03572266542735861, 1, 0.2891485407097809, 0.002595863486357033],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002698144146562089],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002698927219043256],
[121.3841994013082, 299.7990646463572, 0, 1, 0.2881980595211189, 0, 0.003335567444747032, 0.01451127903871027, 0.7118019404788811, 1, 0.002201132018161146],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002608245042165513],
[121.4147849179978, 299.5672335746586, 1, 0, 0.2884084820361889, 0.008236229225916668, 0, -0.03583145072130949, 1, 0.2884084820361889, 0.002583046732258624],
[100.5092612466771, 245.8259718523743, 0, 0, 0.290208017091728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004592798826677153],
[121.8128985215564, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2892648729454045, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7107351270545954, 1, 0.001438004742954272],
[100.6315041231817, 245.8463307353733, 0, 1, 0.2904413904695035, 0, 0.004067581553927647, 0.01769588291033081, 0.7095586095304964, 1, 0.002730408065862703],
[100.7537469996863, 245.7240878588687, 0, 0, 0.2907942063330479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006462019159083873],
[100.7537469996863, 245.7240878588687, 0, 0, 0.2907942063330479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006465726051039891],
[121.935141398061, 299.2481226496044, 0, 1, 0.2895061409283859, 0, 0.003341708516483894, 0.0145379955740664, 0.7104938590716141, 1, 0.001401620100822147],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002583046732258624],
[121.843484038246, 299.2098353341622, 0, 1, 0.2893778018894547, 0, 0.00334213612625128, 0.01453985587662571, 0.7106221981105453, 1, 0.002583046732258624],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002698920435983229],
[121.7415976418046, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2890466170755234, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7109533829244765, 1, 0.002698760792552046],
[121.7415976418046, 299.3957049234027, 0, 1, 0.2890781626330871, 0, 0.003340061275280618, 0.01453082930411661, 0.7109218373669129, 1, 0.002627152758573037],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002644916609400668],
[99.84435354827103, 246.633481310284, 0, 1, 0.2881695263104815, 0, 0.004054599540530033, 0.01763940507799265, 0.7118304736895185, 1, 0.002434714546887687],
[100.04559910328, 246.4322357552751, 0, 0, 0.2887503587181046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005573484048796833],
[100.2774301749785, 246.2004046835765, 0, 1, 0.2894194666620318, 0, 0.004061731747700526, 0.01767043351622013, 0.7105805333379682, 1, 0.001194717076597192],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009427495433898351],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002282528109922869],
[100.3080156916682, 246.1698191668868, 0, 1, 0.289507742198336, 0, 0.004062236399995347, 0.01767262898982064, 0.7104922578016639, 1, 0.001361438340853261],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001055802553724414],
[121.8128985215564, 299.6294767303096, 0, 1, 0.2890380884189861, 0, 0.003337455349561885, 0.01451949230797275, 0.7109619115810139, 1, 0.002697483154864828],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002060825290686465],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002583046732258624],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002583046732258624],
[121.8128985215564, 299.4493682046133, 0, 1, 0.2891616651741031, 0, 0.003339462714500374, 0.01452822528466636, 0.7108383348258969, 1, 0.002125094024569695],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002068933749215893],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002644916609400668],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002638855009333243],
[121.5810674498578, 299.6021965978075, 0, 1, 0.2886654761194369, 0, 0.003337759239937822, 0.0145208143732931, 0.7113345238805631, 1, 0.002641125827043459],
[121.6829538462992, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002696735485693984],
[121.7159950423456, 299.4672690053198, 1, 0, 0.2889858297612009, 0.008215847059805865, 0, -0.03574277876226605, 1, 0.2889858297612009, 0.002644725584645655],
[121.8128985215564, 299.1691199711, 0, 1, 0.2893541604406585, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7106458395593415, 1, 0.002697573216647736],
[100.3123931981275, 246.1654416604275, 0, 1, 0.2895203765028107, 0, 0.004062308637860908, 0.01767294325833467, 0.7104796234971893, 1, 0.001896794165810944],
[99.6518630061807, 246.8259718523743, 0, 0, 0.2876139625118076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008034899940358135],
[121.3841994013082, 299.7990646463571, 1, 0, 0.2881980595211189, 0.00823830453166232, 0, -0.03584047927230258, 1, 0.2881980595211189, 0.002697499759817193],
[121.8128985215564, 299.3957049234027, 1, 0, 0.2891985052662253, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2891985052662253, 0.00269590925947514],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 0, 0.2900885746059592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006705108496526151],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002026016633582485],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002697598666053609],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002696681564401403],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 0, 0.2900885746059592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006172887624945367],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 1, 0, 0.2900885746059592, 0.009949331908287808, 0, -0.04328424892060837, 1, 0.2900885746059592, 0.001449020398728833],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006278631447346433],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.001985442120588321],
[121.8128985215564, 299.6082552398356, 0, 1, 0.2890526435000144, 0, 0.003337691744172746, 0.01452052073513492, 0.7109473564999855, 1, 0.00263855558238923],
[121.8128985215564, 299.1324758123823, 0, 1, 0.2893793493141498, 0, 0.003343000445819885, 0.01454361607114925, 0.7106206506858502, 1, 0.002594088738573644],
[100.5704322800564, 245.6475132279843, 0, 0, 0.2904830139075524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005131132587662295],
[100.5398467633668, 245.8080434199311, 0, 1, 0.2902857202628202, 0, 0.004068215124643541, 0.01769863923938168, 0.7097142797371798, 1, 0.001339567539191766],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008421377175023702],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002626923736377602],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002569025834537865],
[100.7105068016861, 245.7673280568689, 0, 1, 0.2906694070135823, 0, 0.004068889090776975, 0.01770157130739917, 0.7093305929864178, 1, 0.004033735926571818],
[122.0141440765653, 299.1691199711, 0, 1, 0.2896937140948624, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7103062859051376, 1, 0.002697772401431982],
[121.8128985215564, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2891669519178859, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7108330480821141, 1, 0.002703662873900794],
[97.59069197280144, 237.74454112625, 0, 0, 0.291024271654673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004834581603062274],
[120.2433756195737, 294.9190610679312, 2, 2, 0.2896297087447763, 0.01663293291372329, 0.00678152165803662, -0.04285824826642119, 0.9239274859634263, 0.3300569160644573, 0.0108683910768753],
[120.941218397543, 296.9958945222446, 0.5, 2.5, 0.2893765943699634, 0.004134239811909799, 0.008417624775660841, 0.01863472871372902, 0.5780511347597294, 0.6411453956317643, 0.006293159481081206],
[121.6906556450518, 299.4926084026135, 0, 1, 0.288925667358141, 0, 0.003338980568948404, 0.01452612772592776, 0.711074332641859, 1, 0.002697377113175329],
[122.509766570106, 299.1021965978076, 0, 1, 0.2905746925433295, 0, 0.003343338870040683, 0.01454508837485254, 0.7094253074566705, 1, 0.002699529552139022],
[121.3841994013082, 299.7990646463572, 1, 0, 0.2881980595211189, 0.00823830453166232, 0, -0.03584047927230258, 1, 0.2881980595211189, 0.002698474415775132],
[122.1094398006494, 299.3329354512165, 0, 1, 0.2897417226439874, 0, 0.00334076167893985, 0.01453387638774097, 0.7102582773560127, 1, 0.002696505049524964],
[122.2415976418046, 298.9416664058608, 0, 1, 0.2902337487654079, 0, 0.003345134226429116, 0.01455289901515829, 0.7097662512345921, 1, 0.002698017009326021],
[121.8128985215564, 299.1324758123823, 0, 1, 0.2893793493141498, 0, 0.003343000445819885, 0.01454361607114925, 0.7106206506858502, 1, 0.001850570414254723],
[122.044729593255, 298.9372888994014, 0, 1, 0.2899048515901966, 0, 0.003345183211106596, 0.01455311212142441, 0.7100951484098034, 1, 0.002628208027778852],
[100.3080156916682, 246.1698191668868, 0, 1, 0.289507742198336, 0, 0.004062236399995347, 0.01767262898982064, 0.7104922578016639, 1, 0.001315263483396792],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007739586492781675],
[100.547812269178, 246.1891337935777, 0, 1, 0.2899829781940224, 0, 0.004061917699578367, 0.01767124249389239, 0.7100170218059776, 1, 0.001653228861037703],
[121.7845261707648, 299.3987378769006, 1, 0, 0.289148540709781, 0.008211223801928761, 0, -0.03572266542735861, 1, 0.2891485407097809, 0.002696653118383208],
[121.6906556450518, 299.4926084026135, 0, 1, 0.288925667358141, 0, 0.003338980568948404, 0.01452612772592776, 0.711074332641859, 1, 0.002643665186960565],
[121.9081942456405, 299.5341810062255, 0, 1, 0.2892642064595063, 0, 0.003338517148996815, 0.0145241116323122, 0.7107357935404937, 1, 0.002623924774570899],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002696079829341929],
[122.2415976418046, 298.9416664058608, 0, 1, 0.290233748765408, 0, 0.003345134226429116, 0.01455289901515829, 0.709766251234592, 1, 0.002548090665749236],
[121.6829538462993, 299.4672690053198, 1, 0, 0.288930047388746, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889300473887459, 0.002643579436285612],
[100.2774301749785, 246.2004046835765, 0, 1, 0.2894194666620318, 0, 0.004061731747700527, 0.01767043351622013, 0.7105805333379682, 1, 0.001342742138595268],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00121703868161955],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002634280967347204],
[122.044729593255, 299.1385344544104, 0, 1, 0.28976633216709, 0, 0.003342932737916462, 0.01454332151009001, 0.71023366783291, 1, 0.002629516345067345],
[121.7415976418046, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2890466170755234, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7109533829244765, 1, 0.002048173441909903],
[100.5525014446774, 245.9966342936294, 0, 2, 0.2901536638677657, 0, 0.00813019253593826, 0.03537014150717828, 0.5038818209203569, 1, 0.00557117677435947],
[121.7338958430521, 299.4493682046133, 1, 1, 0.2890283309767869, 0.008214638930879783, 0.003339462714500374, -0.0212092975515087, 0.9164626238927729, 0.4945192858463467, 0.003940934109028164]
],
"NAMES": [
["Node610"],
["Node619"],
["Node639"],
["Node638"],
["Node643"],
["Node653"],
["Node662"],
["Node671"],
["Node670"],
["Node679"],
["Node23"],
["Node28"],
["Node46"],
["Node40"],
["Node43"],
["Node509"],
["Node508"],
["Node505"],
["Node529"],
["Node519"],
["Node526"],
["Node502"],
["Node499"],
["Node548"],
["Node547"],
["Node557"],
["Node554"],
["Node553"],
["Node552"],
["Node67"],
["Node64"],
["Node566"],
["Node571"],
["Node58"],
["Node61"],
["Node578"],
["Node577"],
["Node576"],
["Node575"],
["Node584"],
["Node598"],
["Node597"],
["Node589"],
["Node594"],
["Node496"],
["Node80"],
["Node74"],
["Node77"],
["Node493"],
["Node490"],
["Node487"],
["Node483"],
["Node478"],
["Node471"],
["Node170"],
["Node169"],
["Node168"],
["Node234"],
["Node215"],
["Node214"],
["Node279"],
["Node275"],
["Node291"],
["Node290"],
["Node289"],
["Node298"],
["Node304"],
["Node310"],
["Node321"],
["Node320"],
["Node319"],
["Node384"],
["Node381"],
["Node341"],
["Node338"],
["Node356"],
["Node365"],
["Node364"],
["Node363"],
["Node362"],
["Node388"],
["Node391"],
["Node399"],
["Node406"],
["Node414"],
["Node440"],
["Node424"],
["Node423"],
["Node429"],
["Node428"],
["Node468"],
["Node465"],
["Node454"],
["Node140"],
["Node137"],
["Node11"],
["Node10"],
["Node127"],
["Node124"],
["Node115"],
["Node101"],
["Node100"]
],
"RESOLVED": [
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002639182388796861],
[122.0141440765653, 299.1691199711, 0, 1, 0.2896937140948624, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7103062859051376, 1, 0.002577838849488685],
[100.5092612466771, 245.8972727321261, 0, 1, 0.2901482835564162, 0, 0.004066738882010185, 0.0176922168932183, 0.7098517164435838, 1, 0.001342394656832012],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006641816333255362],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002058085021130684],
[121.8128985215564, 299.4493682046133, 0, 1, 0.2891616651741031, 0, 0.003339462714500374, 0.01452822528466636, 0.7108383348258969, 1, 0.002637167100946327],
[121.9428431968135, 299.370365526109, 1, 0, 0.2894351296662277, 0.00820056326213436, 0, -0.03567628709137159, 1, 0.2894351296662276, 0.002656898648338785],
[100.3080156916682, 246.0908164883825, 0, 1, 0.2895737698085836, 0, 0.004063540502118689, 0.0176783024442239, 0.7104262301914164, 1, 0.001331430716984381],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001221356122857211],
[121.9428431968135, 299.2404208508518, 1, 0, 0.2895244270271224, 0.00820056326213436, 0, -0.03567628709137159, 1, 0.2895244270271224, 0.002644036589020645],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002697774889538726],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002234719129269387],
[121.8128985215564, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2892648729454045, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7107351270545954, 1, 0.002124465084197333],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.001989240090378757],
[121.8841994013082, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2893851912110034, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7106148087889965, 1, 0.002016383256138158],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 1, 0.2900885746059592, 0, 0.004065560023850582, 0.01768708830865678, 0.7099114253940408, 1, 0.00133444482370787],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001221089167449251],
[121.7845261707648, 299.3987378769006, 1, 0, 0.2891485407097809, 0.008211223801928761, 0, -0.03572266542735861, 1, 0.2891485407097809, 0.002595863486357033],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002698144146562089],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002698927219043256],
[121.3841994013082, 299.7990646463572, 0, 1, 0.2881980595211189, 0, 0.003335567444747032, 0.01451127903871027, 0.7118019404788811, 1, 0.002201132018161146],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002608245042165513],
[121.4147849179978, 299.5672335746586, 1, 0, 0.2884084820361889, 0.008236229225916668, 0, -0.03583145072130949, 1, 0.2884084820361889, 0.002583046732258624],
[100.5092612466771, 245.8259718523743, 0, 0, 0.290208017091728, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004592798826677153],
[121.8128985215564, 299.2990646463572, 0, 1, 0.2892648729454045, 0, 0.003341139743224958, 0.0145355211442709, 0.7107351270545954, 1, 0.001438004742954272],
[100.6315041231817, 245.8463307353733, 0, 1, 0.2904413904695035, 0, 0.004067581553927647, 0.01769588291033081, 0.7095586095304964, 1, 0.002730408065862703],
[100.7537469996863, 245.7240878588687, 0, 0, 0.2907942063330479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006462019159083873],
[100.7537469996863, 245.7240878588687, 0, 0, 0.2907942063330479, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006465726051039891],
[121.935141398061, 299.2481226496044, 0, 1, 0.2895061409283859, 0, 0.003341708516483894, 0.0145379955740664, 0.7104938590716141, 1, 0.001401620100822147],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002583046732258624],
[121.843484038246, 299.2098353341622, 0, 1, 0.2893778018894547, 0, 0.00334213612625128, 0.01453985587662571, 0.7106221981105453, 1, 0.002583046732258624],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002698920435983229],
[121.7415976418046, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2890466170755234, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7109533829244765, 1, 0.002698760792552046],
[121.7415976418046, 299.3957049234027, 0, 1, 0.2890781626330871, 0, 0.003340061275280618, 0.01453082930411661, 0.7109218373669129, 1, 0.002627152758573037],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002644916609400668],
[99.84435354827103, 246.633481310284, 0, 1, 0.2881695263104815, 0, 0.004054599540530033, 0.01763940507799265, 0.7118304736895185, 1, 0.002434714546887687],
[100.04559910328, 246.4322357552751, 0, 0, 0.2887503587181046, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005573484048796833],
[100.2774301749785, 246.2004046835765, 0, 1, 0.2894194666620318, 0, 0.004061731747700526, 0.01767043351622013, 0.7105805333379682, 1, 0.001194717076597192],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0009427495433898351],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002282528109922869],
[100.3080156916682, 246.1698191668868, 0, 1, 0.289507742198336, 0, 0.004062236399995347, 0.01767262898982064, 0.7104922578016639, 1, 0.001361438340853261],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.001055802553724414],
[121.8128985215564, 299.6294767303096, 0, 1, 0.2890380884189861, 0, 0.003337455349561885, 0.01451949230797275, 0.7109619115810139, 1, 0.002697483154864828],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002060825290686465],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002583046732258624],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002583046732258624],
[121.8128985215564, 299.4493682046133, 0, 1, 0.2891616651741031, 0, 0.003339462714500374, 0.01452822528466636, 0.7108383348258969, 1, 0.002125094024569695],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002068933749215893],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002644916609400668],
[121.6116529665475, 299.5716110811179, 0, 1, 0.2887380941916644, 0, 0.003338100016857807, 0.01452229691233864, 0.7112619058083356, 1, 0.002638855009333243],
[121.5810674498578, 299.6021965978075, 0, 1, 0.2886654761194369, 0, 0.003337759239937822, 0.0145208143732931, 0.7113345238805631, 1, 0.002641125827043459],
[121.6829538462992, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002696735485693984],
[121.7159950423456, 299.4672690053198, 1, 0, 0.2889858297612009, 0.008215847059805865, 0, -0.03574277876226605, 1, 0.2889858297612009, 0.002644725584645655],
[121.8128985215564, 299.1691199711, 0, 1, 0.2893541604406585, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7106458395593415, 1, 0.002697573216647736],
[100.3123931981275, 246.1654416604275, 0, 1, 0.2895203765028107, 0, 0.004062308637860908, 0.01767294325833467, 0.7104796234971893, 1, 0.001896794165810944],
[99.6518630061807, 246.8259718523743, 0, 0, 0.2876139625118076, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008034899940358135],
[121.3841994013082, 299.7990646463571, 1, 0, 0.2881980595211189, 0.00823830453166232, 0, -0.03584047927230258, 1, 0.2881980595211189, 0.002697499759817193],
[121.8128985215564, 299.3957049234027, 1, 0, 0.2891985052662253, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2891985052662253, 0.00269590925947514],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 0, 0.2900885746059592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006705108496526151],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002026016633582485],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002697598666053609],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002696681564401403],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 0, 0, 0.2900885746059592, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006172887624945367],
[100.5092612466771, 245.9685736118779, 1, 0, 0.2900885746059592, 0.009949331908287808, 0, -0.04328424892060837, 1, 0.2900885746059592, 0.001449020398728833],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0006278631447346433],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.001985442120588321],
[121.8128985215564, 299.6082552398356, 0, 1, 0.2890526435000144, 0, 0.003337691744172746, 0.01452052073513492, 0.7109473564999855, 1, 0.00263855558238923],
[121.8128985215564, 299.1324758123823, 0, 1, 0.2893793493141498, 0, 0.003343000445819885, 0.01454361607114925, 0.7106206506858502, 1, 0.002594088738573644],
[100.5704322800564, 245.6475132279843, 0, 0, 0.2904830139075524, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0005131132587662295],
[100.5398467633668, 245.8080434199311, 0, 1, 0.2902857202628202, 0, 0.004068215124643541, 0.01769863923938168, 0.7097142797371798, 1, 0.001339567539191766],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0008421377175023702],
[121.6829538462993, 299.5003102013661, 1, 0, 0.2889073812594044, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889073812594044, 0.002626923736377602],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002569025834537865],
[100.7105068016861, 245.7673280568689, 0, 1, 0.2906694070135823, 0, 0.004068889090776975, 0.01770157130739917, 0.7093305929864178, 1, 0.004033735926571818],
[122.0141440765653, 299.1691199711, 0, 1, 0.2896937140948624, 0, 0.003342590973615862, 0.01454183467547683, 0.7103062859051376, 1, 0.002697772401431982],
[121.8128985215564, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2891669519178859, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7108330480821141, 1, 0.002703662873900794],
[97.59069197280144, 237.74454112625, 0, 0, 0.291024271654673, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0004834581603062274],
[120.2433756195737, 294.9190610679312, 2, 2, 0.2896297087447763, 0.01663293291372329, 0.00678152165803662, -0.04285824826642119, 0.9239274859634263, 0.3300569160644573, 0.0108683910768753],
[120.941218397543, 296.9958945222446, 0.5, 2.5, 0.2893765943699634, 0.004134239811909799, 0.008417624775660841, 0.01863472871372902, 0.5780511347597294, 0.6411453956317643, 0.006293159481081206],
[121.6906556450518, 299.4926084026135, 0, 1, 0.288925667358141, 0, 0.003338980568948404, 0.01452612772592776, 0.711074332641859, 1, 0.002697377113175329],
[122.509766570106, 299.1021965978076, 0, 1, 0.2905746925433295, 0, 0.003343338870040683, 0.01454508837485254, 0.7094253074566705, 1, 0.002699529552139022],
[121.3841994013082, 299.7990646463572, 1, 0, 0.2881980595211189, 0.00823830453166232, 0, -0.03584047927230258, 1, 0.2881980595211189, 0.002698474415775132],
[122.1094398006494, 299.3329354512165, 0, 1, 0.2897417226439874, 0, 0.00334076167893985, 0.01453387638774097, 0.7102582773560127, 1, 0.002696505049524964],
[122.2415976418046, 298.9416664058608, 0, 1, 0.2902337487654079, 0, 0.003345134226429116, 0.01455289901515829, 0.7097662512345921, 1, 0.002698017009326021],
[121.8128985215564, 299.1324758123823, 0, 1, 0.2893793493141498, 0, 0.003343000445819885, 0.01454361607114925, 0.7106206506858502, 1, 0.001850570414254723],
[122.044729593255, 298.9372888994014, 0, 1, 0.2899048515901966, 0, 0.003345183211106596, 0.01455311212142441, 0.7100951484098034, 1, 0.002628208027778852],
[100.3080156916682, 246.1698191668868, 0, 1, 0.289507742198336, 0, 0.004062236399995347, 0.01767262898982064, 0.7104922578016639, 1, 0.001315263483396792],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0007739586492781675],
[100.547812269178, 246.1891337935777, 0, 1, 0.2899829781940224, 0, 0.004061917699578367, 0.01767124249389239, 0.7100170218059776, 1, 0.001653228861037703],
[121.7845261707648, 299.3987378769006, 1, 0, 0.289148540709781, 0.008211223801928761, 0, -0.03572266542735861, 1, 0.2891485407097809, 0.002696653118383208],
[121.6906556450518, 299.4926084026135, 0, 1, 0.288925667358141, 0, 0.003338980568948404, 0.01452612772592776, 0.711074332641859, 1, 0.002643665186960565],
[121.9081942456405, 299.5341810062255, 0, 1, 0.2892642064595063, 0, 0.003338517148996815, 0.0145241116323122, 0.7107357935404937, 1, 0.002623924774570899],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 1, 0, 0.2892159041432634, 0.008209311264545905, 0, -0.03571434499490016, 1, 0.2892159041432634, 0.002696079829341929],
[122.2415976418046, 298.9416664058608, 0, 1, 0.290233748765408, 0, 0.003345134226429116, 0.01455289901515829, 0.709766251234592, 1, 0.002548090665749236],
[121.6829538462993, 299.4672690053198, 1, 0, 0.288930047388746, 0.008218077950861751, 0, -0.03575248418215433, 1, 0.2889300473887459, 0.002643579436285612],
[100.2774301749785, 246.2004046835765, 0, 1, 0.2894194666620318, 0, 0.004061731747700527, 0.01767043351622013, 0.7105805333379682, 1, 0.001342742138595268],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 0, 0.2892159041432634, 0, 0, 0, 1, 1, 0.00121703868161955],
[121.8128985215564, 299.370365526109, 0, 1, 0.2892159041432634, 0, 0.003340343985760298, 0.01453205922697854, 0.7107840958567366, 1, 0.002634280967347204],
[122.044729593255, 299.1385344544104, 0, 1, 0.28976633216709, 0, 0.003342932737916462, 0.01454332151009001, 0.71023366783291, 1, 0.002629516345067345],
[121.7415976418046, 299.4416664058608, 0, 1, 0.2890466170755234, 0, 0.003339548607255639, 0.01452859895833949, 0.7109533829244765, 1, 0.002048173441909903],
[100.5525014446774, 245.9966342936294, 0, 2, 0.2901536638677657, 0, 0.00813019253593826, 0.03537014150717828, 0.5038818209203569, 1, 0.00557117677435947],
[121.7338958430521, 299.4493682046133, 1, 1, 0.2890283309767869, 0.008214638930879783, 0.003339462714500374, -0.0212092975515087, 0.9164626238927729, 0.4945192858463467, 0.003940934109028164]
]
},
"by-site":{
"AVERAGED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[3.27981141058528, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2518380823302653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.27981141058528, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2518380823302653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 9.301386078620919, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.360379645040805, 7.977185789405243, 0, 0, 0.3534230207903723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[8.06327076881103, 4.960221866762931, 0, 0, 0.6191327468321381, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.328330708548861, 10.6951619270251, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2102427924892972, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[1.766495435583436, 9.007308626855885, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 8.682328423715973, 0, 0, 0.2300315091457616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 9.301386078620919, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3000625633294501, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.012833503309126, 7.288552575311797, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[1.766495435583436, 9.007308626855885, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2102427924892972, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.684494278103204, 8.682328423715973, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.328330708548861, 10.6951619270251, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[0.7555142469907964, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2518380823302654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.7555142469907964, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2518380823302654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.905314631273239, 7.66097633050772, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05549813694935476],
[0.9977164493226468, 2.002283550677353, 0, 1, 0.3325721497742157, 0, 0.4994297634127343, 2.172753145355416, 0.6674278502257843, 1, 0.2298603338719541],
[0.8558737216242805, 2.14412627837572, 1, 0, 0.2852912405414267, 1.168396662655089, 0, -5.083072155050274, 1, 0.2852912405414267, 0.2298603338719541],
[1.00442633179605, 1.837568311195275, 0, 0, 0.3534230207903722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.842295005401793, 1.157704994598207, 1, 0, 0.6140983351339309, 0.5428012327384594, 0, -2.361439329679352, 1, 0.6140983351339309, 0.2298603338719541],
[0.5417885135009726, 2.458211486499028, 0, 1, 0.1805961711669909, 0, 0.4067998239745413, 1.769769568859815, 0.8194038288330091, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9985940626139124, 2.001405937386088, 0, 1, 0.3328646875379708, 0, 0.4996487625624006, 2.173705894122362, 0.6671353124620292, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2102427924892973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4080052711367317, 2.076730152709992, 0, 1, 0.1642047146030065, 0, 0.4815262101795305, 2.094864312029449, 0.8357952853969934, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2, 0, 0, 0.2300315091457617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.142601759503586, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.000838655100748, 0, 1, 0.2999745198927192, 0, 0.4997904241057593, 2.174322188116947, 0.7000254801072808, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.678939616106425, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.074860149784757, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.245392143690574, 0, 1, 0.2101757616269209, 0, 0.4453565061274236, 1.937509176226611, 0.7898242383730791, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9973362301330538, 2.002663769866946, 0, 1, 0.3324454100443513, 0, 0.4993349433122458, 2.172340633553613, 0.6675545899556488, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.061171033379281, 1.536337856602838, 0, 0, 0.4085341295546388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.018115448201523, 0, 0, 0.1868266298183815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 4.35046788262763, 0.4444444444444444, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.050678794587526, 0, 0, 0.2948334002684584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9977385107535038, 2.002261489246496, 0, 1, 0.3325795035845013, 0, 0.4994352662580183, 2.172777085307087, 0.6674204964154987, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.484818342896635, 0, 1, 0.4024439061546313, 0, 0.6734830592469414, 2.929966418747619, 0.5975560938453688, 1, 0.2298603338719541],
[0.9986457456849479, 2.001354254315052, 0, 1, 0.332881915228316, 0, 0.499661665516704, 2.17376202801065, 0.667118084771684, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2, 0, 0, 0.3000625633294502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4103961849402337, 2.074421055382294, 0, 1, 0.1651615170244732, 0, 0.4820622107577435, 2.097196165330034, 0.8348384829755268, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.000343703576902, 1.855891480864994, 1, 1, 0.3502315597209364, 0.9996564145146587, 0.5388246081790946, -2.004833972756147, 0.8773378545754402, 0.577800974017313, 0.2298603338719541],
[1.005031914375262, 1.994968085624738, 0, 1, 0.3350106381250872, 0, 0.5012611515972413, 2.180720540832737, 0.6649893618749128, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.400129351422926, 0, 1, 0.1993265503919033, 0, 0.4166442110326871, 1.812597258580433, 0.8006734496080967, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.852924454065249, 1.144814056688256, 1, 0, 0.6181074324589779, 0.5396874102481817, 0, -2.347892744943195, 1, 0.6181074324589779, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6012605467877584, 2.398739453212242, 1, 1, 0.2004201822625861, 1.663172488769655, 0.4168856265989465, -5.421930966414435, 0.9598317505418318, 0.3606721150670039, 0.2298603338719541],
[0.8558732336510421, 2.144126766348959, 1, 1, 0.2852910778836806, 1.168397328812507, 0.4663903346082519, -3.054058881665571, 0.9186090008799678, 0.4891911566473288, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.999341007528556, 0, 2, 0.3334065708066972, 0, 1.000329604839276, 4.351901817894858, 0.4443467998436869, 1, 0.2298603338719541],
[1.853293037376587, 1.146706962623414, 0, 1, 0.6177643457921955, 0, 0.8720623773943255, 3.793879364501907, 0.3822356542078045, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.050678794587526, 0, 0, 0.2948334002684584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.857851810369171, 2.141163418176316, 2, 2, 0.2860444996090355, 2.331405000053929, 0.9340716280793978, -6.079053956098963, 0.9264659423896808, 0.3237763674524824, 0.2298603338719541],
[1.011418981317502, 2.081220002565886, 0.5, 3.5, 0.327040752764319, 0.4943549698352374, 1.681705920414437, 5.421893314541991, 0.404436697728116, 0.7949050056747319, 0.2189919427950788],
[0.4615853311578044, 1.63771189737206, 0, 1, 0.219876120867864, 0, 0.6106080084077312, 2.731206001379151, 0.780123879132136, 1, 0.2235671743908729],
[0.6320296845490152, 2.510234904513334, 0, 2, 0.2011382767539676, 0, 0.7967381843046061, 3.638207753835729, 0.6381800528676204, 1, 0.2189919427950788],
[1.047421529687449, 2.094843059374899, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4773627291671196, 2.179818686817216, 0.6666666666666667, 1, 0.2189919427950788],
[0.6001596312973483, 2.39753934018538, 0, 1, 0.2002067709288689, 0, 0.4170943029959538, 1.814555369210854, 0.7997932290711312, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.245216144883202, 0, 1, 0.2101887740297848, 0, 0.4453914168927468, 1.937661054389908, 0.7898112259702152, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.8559131876119143, 2.144086812388087, 1, 0, 0.285304395870638, 1.168342788116284, 0, -5.08283777559951, 1, 0.2853043958706381, 0.2298603338719541],
[0.9991850777392807, 2.000289612680794, 1, 1, 0.3331200229595354, 1.00081558690064, 0.4999276073127216, -2.179097067991484, 0.8890310503034384, 0.5552710962225096, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8558724864278854, 2.143396525672626, 1, 1, 0.2853603604661266, 1.168398348886822, 0.4665492306357951, -3.053372047401612, 0.9185694646746424, 0.4892901856068954, 0.2298603338719541],
[0.9991628654865879, 2.000837134513412, 0, 1, 0.3330542884955294, 0, 0.4997908039342704, 2.174323840548686, 0.6669457115044706, 1, 0.2298603338719541],
[0.5990108882879331, 2, 1, 0, 0.2304764827986251, 1.669418736040269, 0, -7.262752593800001, 1, 0.2304764827986251, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 1.735684317689656, 0, 0, 0.1899174403311456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.061171033379281, 1.536337856602838, 0, 0, 0.4085341295546388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9965239659184434, 2.003018423187529, 0, 2, 0.3322253319498719, 0, 0.9984930626934898, 4.343912000274523, 0.4459230072894588, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.000314795651722, 1.855746013826266, 0, 1, 0.3502428212775178, 0, 0.5388668452199188, 2.34432290314213, 0.6497571787224822, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.857398240496415, 0, 0, 0.3499687183352749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 4.35046788262763, 0.4444444444444444, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.152803829835469, 0, 1, 0.1772093152139524, 0, 0.4645105077114371, 2.020838044941661, 0.8227906847860476, 1, 0.2298603338719541],
[1.852365473039027, 1.147634526960974, 1, 0, 0.6174551576796755, 0.5398502695903635, 0, -2.348601259280743, 1, 0.6174551576796755, 0.2298603338719541],
[0.8565284822112699, 2.143471517788731, 1, 1, 0.2855094940704232, 1.167503499029402, 0.4665329078091179, -3.049550043770345, 0.9184843287956508, 0.4895033169364975, 0.2298603338719541],
[0.9482062539704706, 2.05179374602953, 1, 0, 0.3160687513234902, 1.054622869035772, 0, -4.588102920024732, 1, 0.3160687513234901, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.678939616106425, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.074860149784757, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4636065586644597, 2.020034643387526, 1, 1, 0.1866640633443461, 2.15700140843728, 0.4950410149021186, -7.230305314273893, 0.9651565274557778, 0.3384846541444703, 0.2298603338719541],
[0.9988484706115207, 2.001151529388479, 0, 1, 0.3329494902038403, 0, 0.4997122833099923, 2.17398223909464, 0.6670505097961597, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.681670340549277, 0, 1, 0.2161260069787569, 0, 0.5946468673957667, 2.586992098110414, 0.7838739930212432, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.018115448201523, 0, 0, 0.1868266298183815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9976377415488681, 2.002362258451132, 0, 1, 0.3325459138496227, 0, 0.499410132097436, 2.172667739948717, 0.6674540861503773, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.001728135509826, 0, 1, 0.2998811971697691, 0, 0.4995683391068024, 2.173356014461772, 0.7001188028302309, 1, 0.2298603338719541],
[1.024839260383574, 2.049678520767147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2242891570975946],
[1.029709599373006, 2.044381438366465, 1, 2, 0.3349639248583223, 0.9711475940487526, 0.9782910187240169, 0.03184917526867333, 0.7385639685496281, 0.7058725124150431, 0.2242891570975946],
[0.7689677876744699, 2.305549993476252, 0, 1, 0.2501100473020074, 0, 0.4337359861332803, 1.933825030804095, 0.7498899526979925, 1, 0.2242891570975946],
[0.6023865239049577, 2.397613476095043, 0, 1, 0.2007955079683192, 0, 0.4170814061441984, 1.814499261871505, 0.7992044920316808, 1, 0.2298603338719541],
[0.9973559755166088, 2.002644024483391, 0, 2, 0.3324519918388696, 0, 0.9986797331672198, 4.34472410417512, 0.4456203431998927, 1, 0.2298603338719541],
[0.7605388150738664, 2.239461184926134, 0, 1, 0.2535129383579555, 0, 0.4465359822849458, 1.942640449368237, 0.7464870616420445, 1, 0.2298603338719541],
[1.007841696522199, 2.028222349941591, 0, 2, 0.3319566653068692, 0, 0.9860851794960235, 4.341502670757169, 0.4462818970279184, 1, 0.2271299258060914],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.175233941313815, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.5363378566028381, 2.463662143397162, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.5389899174523863, 2.461010082547614, 0, 1, 0.1796633058174621, 0, 0.4063372218958199, 1.767757033373901, 0.8203366941825379, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9976380648379426, 2.002361935162057, 0, 1, 0.3325460216126475, 0, 0.4994102127291323, 2.172668090734322, 0.6674539783873525, 1, 0.2298603338719541],
[0.8559037718093733, 2.051793262841492, 1, 0, 0.2943579615103002, 1.168355641062322, 0, -5.082893691928448, 1, 0.2943579615103002, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.142601759503586, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.9993646725999545, 2.000635327400045, 1, 1, 0.3331215575333182, 1.000635731297558, 0.4998412185890792, -2.17869044333439, 0.8890300279065761, 0.5552731429732125, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.208779040840039, 0, 1, 0.1555675302973449, 0, 0.4527388124887684, 1.96962566295136, 0.8444324697026551, 1, 0.2298603338719541],
[0.9927596082646998, 2.0072403917353, 0, 1, 0.3309198694215666, 0, 0.4981964313379922, 2.167387573775636, 0.6690801305784334, 1, 0.2298603338719541],
[0.4633417281771828, 2.018435863421503, 1, 0, 0.1866975226731385, 2.158234277612048, 0, -9.389328907937257, 1, 0.1866975226731385, 0.2298603338719541]
],
"RESOLVED": [
[0, 3.000000000000002, 0, 0, 0, null, 0, null, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[3.27981141058528, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2518380823302653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.27981141058528, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2518380823302653, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 9.301386078620919, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.360379645040805, 7.977185789405243, 0, 0, 0.3534230207903723, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[8.06327076881103, 4.960221866762931, 0, 0, 0.6191327468321381, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.328330708548861, 10.6951619270251, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2102427924892972, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[1.766495435583436, 9.007308626855885, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 8.682328423715973, 0, 0, 0.2300315091457616, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 9.301386078620919, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[3.722106556953043, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3000625633294501, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.012833503309126, 7.288552575311797, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[1.766495435583436, 9.007308626855885, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.593884209457366, 9.743681224988681, 0, 0, 0.2102427924892972, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.684494278103204, 8.682328423715973, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[4.341164211857986, 8.682328423715973, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[2.328330708548861, 10.6951619270251, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.0447188779434893],
[0.7555142469907964, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2518380823302654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.7555142469907964, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2518380823302654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.905314631273239, 7.66097633050772, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.05549813694935476],
[0.9977164493226468, 2.002283550677353, 0, 1, 0.3325721497742157, 0, 0.4994297634127343, 2.172753145355416, 0.6674278502257843, 1, 0.2298603338719541],
[0.8558737216242805, 2.14412627837572, 1, 0, 0.2852912405414267, 1.168396662655089, 0, -5.083072155050274, 1, 0.2852912405414267, 0.2298603338719541],
[1.00442633179605, 1.837568311195275, 0, 0, 0.3534230207903722, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.842295005401793, 1.157704994598207, 1, 0, 0.6140983351339309, 0.5428012327384594, 0, -2.361439329679352, 1, 0.6140983351339309, 0.2298603338719541],
[0.5417885135009726, 2.458211486499028, 0, 1, 0.1805961711669909, 0, 0.4067998239745413, 1.769769568859815, 0.8194038288330091, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9985940626139124, 2.001405937386088, 0, 1, 0.3328646875379708, 0, 0.4996487625624006, 2.173705894122362, 0.6671353124620292, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.244485753009203, 0, 0, 0.2102427924892973, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4080052711367317, 2.076730152709992, 0, 1, 0.1642047146030065, 0, 0.4815262101795305, 2.094864312029449, 0.8357952853969934, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2, 0, 0, 0.2300315091457617, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.142601759503586, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.000838655100748, 0, 1, 0.2999745198927192, 0, 0.4997904241057593, 2.174322188116947, 0.7000254801072808, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.678939616106425, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.074860149784757, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.245392143690574, 0, 1, 0.2101757616269209, 0, 0.4453565061274236, 1.937509176226611, 0.7898242383730791, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9973362301330538, 2.002663769866946, 0, 1, 0.3324454100443513, 0, 0.4993349433122458, 2.172340633553613, 0.6675545899556488, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.061171033379281, 1.536337856602838, 0, 0, 0.4085341295546388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.018115448201523, 0, 0, 0.1868266298183815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 4.35046788262763, 0.4444444444444444, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.050678794587526, 0, 0, 0.2948334002684584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9977385107535038, 2.002261489246496, 0, 1, 0.3325795035845013, 0, 0.4994352662580183, 2.172777085307087, 0.6674204964154987, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.484818342896635, 0, 1, 0.4024439061546313, 0, 0.6734830592469414, 2.929966418747619, 0.5975560938453688, 1, 0.2298603338719541],
[0.9986457456849479, 2.001354254315052, 0, 1, 0.332881915228316, 0, 0.499661665516704, 2.17376202801065, 0.667118084771684, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2, 0, 0, 0.3000625633294502, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4103961849402337, 2.074421055382294, 0, 1, 0.1651615170244732, 0, 0.4820622107577435, 2.097196165330034, 0.8348384829755268, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.000343703576902, 1.855891480864994, 1, 1, 0.3502315597209364, 0.9996564145146587, 0.5388246081790946, -2.004833972756147, 0.8773378545754402, 0.577800974017313, 0.2298603338719541],
[1.005031914375262, 1.994968085624738, 0, 1, 0.3350106381250872, 0, 0.5012611515972413, 2.180720540832737, 0.6649893618749128, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.400129351422926, 0, 1, 0.1993265503919033, 0, 0.4166442110326871, 1.812597258580433, 0.8006734496080967, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.852924454065249, 1.144814056688256, 1, 0, 0.6181074324589779, 0.5396874102481817, 0, -2.347892744943195, 1, 0.6181074324589779, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6012605467877584, 2.398739453212242, 1, 1, 0.2004201822625861, 1.663172488769655, 0.4168856265989465, -5.421930966414435, 0.9598317505418318, 0.3606721150670039, 0.2298603338719541],
[0.8558732336510421, 2.144126766348959, 1, 1, 0.2852910778836806, 1.168397328812507, 0.4663903346082519, -3.054058881665571, 0.9186090008799678, 0.4891911566473288, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.999341007528556, 0, 2, 0.3334065708066972, 0, 1.000329604839276, 4.351901817894858, 0.4443467998436869, 1, 0.2298603338719541],
[1.853293037376587, 1.146706962623414, 0, 1, 0.6177643457921955, 0, 0.8720623773943255, 3.793879364501907, 0.3822356542078045, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.050678794587526, 0, 0, 0.2948334002684584, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.857851810369171, 2.141163418176316, 2, 2, 0.2860444996090355, 2.331405000053929, 0.9340716280793978, -6.079053956098963, 0.9264659423896808, 0.3237763674524824, 0.2298603338719541],
[1.011418981317502, 2.081220002565886, 0.5, 3.5, 0.327040752764319, 0.4943549698352374, 1.681705920414437, 5.421893314541991, 0.404436697728116, 0.7949050056747319, 0.2189919427950788],
[0.4615853311578044, 1.63771189737206, 0, 1, 0.219876120867864, 0, 0.6106080084077312, 2.731206001379151, 0.780123879132136, 1, 0.2235671743908729],
[0.6320296845490152, 2.510234904513334, 0, 2, 0.2011382767539676, 0, 0.7967381843046061, 3.638207753835729, 0.6381800528676204, 1, 0.2189919427950788],
[1.047421529687449, 2.094843059374899, 0, 1, 0.3333333333333333, 0, 0.4773627291671196, 2.179818686817216, 0.6666666666666667, 1, 0.2189919427950788],
[0.6001596312973483, 2.39753934018538, 0, 1, 0.2002067709288689, 0, 0.4170943029959538, 1.814555369210854, 0.7997932290711312, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.245216144883202, 0, 1, 0.2101887740297848, 0, 0.4453914168927468, 1.937661054389908, 0.7898112259702152, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.8559131876119143, 2.144086812388087, 1, 0, 0.285304395870638, 1.168342788116284, 0, -5.08283777559951, 1, 0.2853043958706381, 0.2298603338719541],
[0.9991850777392807, 2.000289612680794, 1, 1, 0.3331200229595354, 1.00081558690064, 0.4999276073127216, -2.179097067991484, 0.8890310503034384, 0.5552710962225096, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.8558724864278854, 2.143396525672626, 1, 1, 0.2853603604661266, 1.168398348886822, 0.4665492306357951, -3.053372047401612, 0.9185694646746424, 0.4892901856068954, 0.2298603338719541],
[0.9991628654865879, 2.000837134513412, 0, 1, 0.3330542884955294, 0, 0.4997908039342704, 2.174323840548686, 0.6669457115044706, 1, 0.2298603338719541],
[0.5990108882879331, 2, 1, 0, 0.2304764827986251, 1.669418736040269, 0, -7.262752593800001, 1, 0.2304764827986251, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 1.735684317689656, 0, 0, 0.1899174403311456, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.061171033379281, 1.536337856602838, 0, 0, 0.4085341295546388, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9965239659184434, 2.003018423187529, 0, 2, 0.3322253319498719, 0, 0.9984930626934898, 4.343912000274523, 0.4459230072894588, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[1.000314795651722, 1.855746013826266, 0, 1, 0.3502428212775178, 0, 0.5388668452199188, 2.34432290314213, 0.6497571787224822, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 1.857398240496415, 0, 0, 0.3499687183352749, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 2, 0.3333333333333334, 0, 1, 4.35046788262763, 0.4444444444444444, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.152803829835469, 0, 1, 0.1772093152139524, 0, 0.4645105077114371, 2.020838044941661, 0.8227906847860476, 1, 0.2298603338719541],
[1.852365473039027, 1.147634526960974, 1, 0, 0.6174551576796755, 0.5398502695903635, 0, -2.348601259280743, 1, 0.6174551576796755, 0.2298603338719541],
[0.8565284822112699, 2.143471517788731, 1, 1, 0.2855094940704232, 1.167503499029402, 0.4665329078091179, -3.049550043770345, 0.9184843287956508, 0.4895033169364975, 0.2298603338719541],
[0.9482062539704706, 2.05179374602953, 1, 0, 0.3160687513234902, 1.054622869035772, 0, -4.588102920024732, 1, 0.3160687513234901, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.678939616106425, 0, 0, 0.2164014574059654, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.074860149784757, 0, 0, 0.1639620903949761, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4636065586644597, 2.020034643387526, 1, 1, 0.1866640633443461, 2.15700140843728, 0.4950410149021186, -7.230305314273893, 0.9651565274557778, 0.3384846541444703, 0.2298603338719541],
[0.9988484706115207, 2.001151529388479, 0, 1, 0.3329494902038403, 0, 0.4997122833099923, 2.17398223909464, 0.6670505097961597, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 1.681670340549277, 0, 1, 0.2161260069787569, 0, 0.5946468673957667, 2.586992098110414, 0.7838739930212432, 1, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.018115448201523, 0, 0, 0.1868266298183815, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9976377415488681, 2.002362258451132, 0, 1, 0.3325459138496227, 0, 0.499410132097436, 2.172667739948717, 0.6674540861503773, 1, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.001728135509826, 0, 1, 0.2998811971697691, 0, 0.4995683391068024, 2.173356014461772, 0.7001188028302309, 1, 0.2298603338719541],
[1.024839260383574, 2.049678520767147, 0, 0, 0.3333333333333333, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2242891570975946],
[1.029709599373006, 2.044381438366465, 1, 2, 0.3349639248583223, 0.9711475940487526, 0.9782910187240169, 0.03184917526867333, 0.7385639685496281, 0.7058725124150431, 0.2242891570975946],
[0.7689677876744699, 2.305549993476252, 0, 1, 0.2501100473020074, 0, 0.4337359861332803, 1.933825030804095, 0.7498899526979925, 1, 0.2242891570975946],
[0.6023865239049577, 2.397613476095043, 0, 1, 0.2007955079683192, 0, 0.4170814061441984, 1.814499261871505, 0.7992044920316808, 1, 0.2298603338719541],
[0.9973559755166088, 2.002644024483391, 0, 2, 0.3324519918388696, 0, 0.9986797331672198, 4.34472410417512, 0.4456203431998927, 1, 0.2298603338719541],
[0.7605388150738664, 2.239461184926134, 0, 1, 0.2535129383579555, 0, 0.4465359822849458, 1.942640449368237, 0.7464870616420445, 1, 0.2298603338719541],
[1.007841696522199, 2.028222349941591, 0, 2, 0.3319566653068692, 0, 0.9860851794960235, 4.341502670757169, 0.4462818970279184, 1, 0.2271299258060914],
[0.9999999999999999, 2, 1, 1, 0.3333333333333334, 1, 0.5000000000000001, -2.175233941313815, 0.888888888888889, 0.5555555555555556, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 1, 0.3333333333333334, 0, 0.5000000000000001, 2.175233941313815, 0.6666666666666666, 1, 0.2298603338719541],
[0.5363378566028381, 2.463662143397162, 0, 0, 0.1787792855342794, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.597508889982119, 2.402491110017882, 0, 0, 0.1991696299940396, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.5389899174523863, 2.461010082547614, 0, 1, 0.1796633058174621, 0, 0.4063372218958199, 1.767757033373901, 0.8203366941825379, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 0, 0, 0.3333333333333334, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9976380648379426, 2.002361935162057, 0, 1, 0.3325460216126475, 0, 0.4994102127291323, 2.172668090734322, 0.6674539783873525, 1, 0.2298603338719541],
[0.8559037718093733, 2.051793262841492, 1, 0, 0.2943579615103002, 1.168355641062322, 0, -5.082893691928448, 1, 0.2943579615103002, 0.2298603338719541],
[0.8573982404964151, 2.142601759503586, 0, 0, 0.2857994134988049, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.9999999999999999, 2, 1, 0, 0.3333333333333334, 1, 0, -4.35046788262763, 1, 0.3333333333333334, 0.2298603338719541],
[0.9993646725999545, 2.000635327400045, 1, 1, 0.3331215575333182, 1.000635731297558, 0.4998412185890792, -2.17869044333439, 0.8890300279065761, 0.5552731429732125, 0.2298603338719541],
[0.463662143397162, 2.154719043559657, 0, 0, 0.1770796955412163, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.6183811869568188, 2, 0, 0, 0.236169275137332, 0, 0, 0, 1, 1, 0.2298603338719541],
[0.4069174418139299, 2.208779040840039, 0, 1, 0.1555675302973449, 0, 0.4527388124887684, 1.96962566295136, 0.8444324697026551, 1, 0.2298603338719541],
[0.9927596082646998, 2.0072403917353, 0, 1, 0.3309198694215666, 0, 0.4981964313379922, 2.167387573775636, 0.6690801305784334, 1, 0.2298603338719541],
[0.4633417281771828, 2.018435863421503, 1, 0, 0.1866975226731385, 2.158234277612048, 0, -9.389328907937257, 1, 0.1866975226731385, 0.2298603338719541]
]
}
}
},
"headers": [
["ES", "Expected synonymous sites"],
["EN", "Expected non-synonymous sites"],
["S", "Inferred synonymous substitutions"],
["N", "Inferred non-synonymous substitutions"],
["P[S]", "Expected proportion of synonymous sites"],
["dS", "Inferred synonymous susbsitution rate"],
["dN", "Inferred non-synonymous susbsitution rate"],
["dN-dS", "Scaled by the length of the tested branches"],
["P [dN/dS > 1]", "Binomial probability that S is no greater than the observed value, with Ps probability of success"],
["P [dN/dS < 1]", "Binomial probability that S is no less than the observed value, with Ps probability of success"],
["Total branch length", "The total length of branches contributing to inference at this site, and used to scale dN-dS"]
]
},
"analysis":{
"authors":"Sergei L Kosakovsky Pond and Simon DW Frost",
"citation":"Not So Different After All: A Comparison of Methods for Detecting Amino Acid Sites Under Selection (2005). _Mol Biol Evol_ 22 (5): 1208-1222",
"contact":"spond@temple.edu",
"info":"SLAC (Single Likelihood Ancestor Counting)\n uses a maximum likelihood ancestral state reconstruction\n and minimum path substitution counting to estimate site - level\n dS and dN,\n and applies a simple binomial - based test to test\n if dS differs drom dN.\n The estimates aggregate information over all branches,\n so the signal is derived from\n pervasive diversification or conservation. A subset of branches can be selected\n for testing as well.\n Multiple partitions within a NEXUS file are also supported\n for recombination - aware analysis.\n ",
"requirements":"in-frame codon alignment and a phylogenetic tree",
"version":"2.00"
},
"branch attributes":{
"0":{
"Node10":{
"Global MG94xREV":0.00121703868161955,
"Nucleotide GTR":0.001244563924677026,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node100":{
"Global MG94xREV":0.003940934109028164,
"Nucleotide GTR":0.004030064529336699,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "F", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCT", "TTT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node101":{
"Global MG94xREV":0.00557117677435947,
"Nucleotide GTR":0.005697177695403607,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "F", "-", "-", "-", "L", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TTC", "---", "---", "---", "CTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node11":{
"Global MG94xREV":0.001342742138595268,
"Nucleotide GTR":0.001373110362947157,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node115":{
"Global MG94xREV":0.002048173441909903,
"Nucleotide GTR":0.002094496104175175,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "F", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "TTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node124":{
"Global MG94xREV":0.002629516345067345,
"Nucleotide GTR":0.00268898699100053,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "V", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "GTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node127":{
"Global MG94xREV":0.002634280967347204,
"Nucleotide GTR":0.002693859372703576,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node137":{
"Global MG94xREV":0.002643579436285612,
"Nucleotide GTR":0.002703368141134893,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node140":{
"Global MG94xREV":0.002548090665749236,
"Nucleotide GTR":0.002605719741937594,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node168":{
"Global MG94xREV":0.002697499759817193,
"Nucleotide GTR":0.002758507957549779,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node169":{
"Global MG94xREV":0.0008034899940358135,
"Nucleotide GTR":0.0008216621833951988,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node170":{
"Global MG94xREV":0.001896794165810944,
"Nucleotide GTR":0.001939693147768091,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node214":{
"Global MG94xREV":0.002026016633582485,
"Nucleotide GTR":0.002071838184795334,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node215":{
"Global MG94xREV":0.0006705108496526151,
"Nucleotide GTR":0.0006856755066089595,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node23":{
"Global MG94xREV":0.002697774889538726,
"Nucleotide GTR":0.002758789309762488,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node234":{
"Global MG94xREV":0.00269590925947514,
"Nucleotide GTR":0.002756881485542111,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node275":{
"Global MG94xREV":0.002696681564401403,
"Nucleotide GTR":0.0027576712573584,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node279":{
"Global MG94xREV":0.002697598666053609,
"Nucleotide GTR":0.002758609100706218,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node28":{
"Global MG94xREV":0.002234719129269387,
"Nucleotide GTR":0.00228526081551758,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "S", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AGC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node289":{
"Global MG94xREV":0.0006278631447346433,
"Nucleotide GTR":0.0006420632567989986,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node290":{
"Global MG94xREV":0.001449020398728833,
"Nucleotide GTR":0.001481792273010738,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node291":{
"Global MG94xREV":0.0006172887624945367,
"Nucleotide GTR":0.0006312497182808395,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node298":{
"Global MG94xREV":0.001985442120588321,
"Nucleotide GTR":0.002030346015403742,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCT", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node304":{
"Global MG94xREV":0.00263855558238923,
"Nucleotide GTR":0.002698230664884782,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "K", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "AAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node310":{
"Global MG94xREV":0.002594088738573644,
"Nucleotide GTR":0.002652758133491216,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "Q", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "CAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node319":{
"Global MG94xREV":0.0008421377175023702,
"Nucleotide GTR":0.0008611839858849617,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node320":{
"Global MG94xREV":0.001339567539191766,
"Nucleotide GTR":0.001369863964987445,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node321":{
"Global MG94xREV":0.0005131132587662295,
"Nucleotide GTR":0.0005247181217643056,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node338":{
"Global MG94xREV":0.002697772401431982,
"Nucleotide GTR":0.002758786765383298,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node341":{
"Global MG94xREV":0.004033735926571818,
"Nucleotide GTR":0.00412496520587526,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "H", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CAT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node356":{
"Global MG94xREV":0.002703662873900794,
"Nucleotide GTR":0.002764810460147244,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "N", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "AAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node362":{
"Global MG94xREV":0.002697377113175329,
"Nucleotide GTR":0.0027583825370613,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "I", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ATT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node363":{
"Global MG94xREV":0.006293159481081206,
"Nucleotide GTR":0.006435489176046791,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "Q", "-", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "CAA", "---", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node364":{
"Global MG94xREV":0.0108683910768753,
"Nucleotide GTR":0.01111419682697405,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node365":{
"Global MG94xREV":0.0004834581603062274,
"Nucleotide GTR":0.0004943923266326752,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node381":{
"Global MG94xREV":0.002569025834537865,
"Nucleotide GTR":0.002627128392479978,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node384":{
"Global MG94xREV":0.002626923736377602,
"Nucleotide GTR":0.002686335746389496,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node388":{
"Global MG94xREV":0.002699529552139022,
"Nucleotide GTR":0.002760583656815947,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node391":{
"Global MG94xREV":0.002698474415775132,
"Nucleotide GTR":0.002759504656884437,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node399":{
"Global MG94xREV":0.002696505049524964,
"Nucleotide GTR":0.002757490750320533,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node40":{
"Global MG94xREV":0.001989240090378757,
"Nucleotide GTR":0.00203422988225167,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "V", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GTG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node406":{
"Global MG94xREV":0.002698017009326021,
"Nucleotide GTR":0.002759036905469401,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node414":{
"Global MG94xREV":0.001850570414254723,
"Nucleotide GTR":0.001892423973403356,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "Q", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "CAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node423":{
"Global MG94xREV":0.0007739586492781675,
"Nucleotide GTR":0.0007914629408504522,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node424":{
"Global MG94xREV":0.001315263483396792,
"Nucleotide GTR":0.001345010234762938,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node428":{
"Global MG94xREV":0.002696653118383208,
"Nucleotide GTR":0.002757642167988782,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node429":{
"Global MG94xREV":0.001653228861037703,
"Nucleotide GTR":0.001690619230725165,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "D", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAT", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node43":{
"Global MG94xREV":0.002016383256138158,
"Nucleotide GTR":0.00206198693337574,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "L", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "CTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node440":{
"Global MG94xREV":0.002628208027778852,
"Nucleotide GTR":0.002687649084059787,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "L", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node448":{
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "I", "I", "I", "F", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ATA", "ATT", "ATT", "TTT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node454":{
"Global MG94xREV":0.002696079829341929,
"Nucleotide GTR":0.002757055913114582,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACG", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node46":{
"Global MG94xREV":0.002124465084197333,
"Nucleotide GTR":0.002172513201888907,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node465":{
"Global MG94xREV":0.002623924774570899,
"Nucleotide GTR":0.00268326895834695,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node468":{
"Global MG94xREV":0.002643665186960565,
"Nucleotide GTR":0.002703455831196163,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node471":{
"Global MG94xREV":0.002697573216647736,
"Nucleotide GTR":0.002758583075722021,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node478":{
"Global MG94xREV":0.002644725584645655,
"Nucleotide GTR":0.002704540211441925,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node483":{
"Global MG94xREV":0.002696735485693984,
"Nucleotide GTR":0.002757726398165778,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node487":{
"Global MG94xREV":0.002641125827043459,
"Nucleotide GTR":0.002700859039662474,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node490":{
"Global MG94xREV":0.002638855009333243,
"Nucleotide GTR":0.002698536863839854,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "H", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CAT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node493":{
"Global MG94xREV":0.002644916609400668,
"Nucleotide GTR":0.002704735556522078,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node496":{
"Global MG94xREV":0.002583046732258624,
"Nucleotide GTR":0.002641466394844553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node499":{
"Global MG94xREV":0.002583046732258624,
"Nucleotide GTR":0.002641466394844553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "TTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node502":{
"Global MG94xREV":0.002608245042165513,
"Nucleotide GTR":0.00266723460414355,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "F", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "TTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node505":{
"Global MG94xREV":0.002595863486357033,
"Nucleotide GTR":0.002654573019985763,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"Node508":{
"Global MG94xREV":0.001221089167449251,
"Nucleotide GTR":0.001248706018611422,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node509":{
"Global MG94xREV":0.00133444482370787,
"Nucleotide GTR":0.001364625391239603,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node519":{
"Global MG94xREV":0.002698927219043256,
"Nucleotide GTR":0.002759967701010309,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node526":{
"Global MG94xREV":0.002201132018161146,
"Nucleotide GTR":0.002250914079090263,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "P", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CCG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node529":{
"Global MG94xREV":0.002698144146562089,
"Nucleotide GTR":0.002759166918113934,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node547":{
"Global MG94xREV":0.001438004742954272,
"Nucleotide GTR":0.001470527480863429,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node548":{
"Global MG94xREV":0.0004592798826677153,
"Nucleotide GTR":0.0004696672192353709,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node552":{
"Global MG94xREV":0.001401620100822147,
"Nucleotide GTR":0.001433319942850203,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node553":{
"Global MG94xREV":0.0006465726051039891,
"Nucleotide GTR":0.0006611958610272185,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node554":{
"Global MG94xREV":0.0006462019159083873,
"Nucleotide GTR":0.0006608167881127078,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node557":{
"Global MG94xREV":0.002730408065862703,
"Nucleotide GTR":0.002792160536670742,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node566":{
"Global MG94xREV":0.002698920435983229,
"Nucleotide GTR":0.002759960764540714,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node571":{
"Global MG94xREV":0.002698760792552046,
"Nucleotide GTR":0.002759797510522368,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node575":{
"Global MG94xREV":0.0009427495433898351,
"Nucleotide GTR":0.000964071306383924,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node576":{
"Global MG94xREV":0.001194717076597192,
"Nucleotide GTR":0.001221737481465915,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node577":{
"Global MG94xREV":0.0005573484048796833,
"Nucleotide GTR":0.0005699537152479574,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node578":{
"Global MG94xREV":0.002434714546887687,
"Nucleotide GTR":0.002489779443912547,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node58":{
"Global MG94xREV":0.002627152758573037,
"Nucleotide GTR":0.002686569948281921,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "C", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "TGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node584":{
"Global MG94xREV":0.002282528109922869,
"Nucleotide GTR":0.002334151071427711,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node589":{
"Global MG94xREV":0.002697483154864828,
"Nucleotide GTR":0.002758490977050311,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node594":{
"Global MG94xREV":0.002060825290686465,
"Nucleotide GTR":0.002107434094401443,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node597":{
"Global MG94xREV":0.001055802553724414,
"Nucleotide GTR":0.001079681188274711,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node598":{
"Global MG94xREV":0.001361438340853261,
"Nucleotide GTR":0.001392229409210995,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node61":{
"Global MG94xREV":0.002644916609400668,
"Nucleotide GTR":0.002704735556522078,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node610":{
"Global MG94xREV":0.002639182388796861,
"Nucleotide GTR":0.002698871647504704,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACC", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node619":{
"Global MG94xREV":0.002577838849488685,
"Nucleotide GTR":0.002636140727618605,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "G", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GGT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node638":{
"Global MG94xREV":0.0006641816333255362,
"Nucleotide GTR":0.0006792031451046598,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node639":{
"Global MG94xREV":0.001342394656832012,
"Nucleotide GTR":0.001372755022337558,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node64":{
"Global MG94xREV":0.002583046732258624,
"Nucleotide GTR":0.002641466394844553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node643":{
"Global MG94xREV":0.002058085021130684,
"Nucleotide GTR":0.002104631849341754,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "S", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "TCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node653":{
"Global MG94xREV":0.002637167100946327,
"Nucleotide GTR":0.002696810780751255,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node662":{
"Global MG94xREV":0.002656898648338785,
"Nucleotide GTR":0.00271698858810741,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAC", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node67":{
"Global MG94xREV":0.002583046732258624,
"Nucleotide GTR":0.002641466394844553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "F", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TTT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node670":{
"Global MG94xREV":0.001221356122857211,
"Nucleotide GTR":0.001248979011635605,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node671":{
"Global MG94xREV":0.001331430716984381,
"Nucleotide GTR":0.001361543115754169,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node679":{
"Global MG94xREV":0.002644036589020645,
"Nucleotide GTR":0.002703835633097703,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAC", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node74":{
"Global MG94xREV":0.002125094024569695,
"Nucleotide GTR":0.002173156366736528,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "F", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TTT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node77":{
"Global MG94xREV":0.002068933749215893,
"Nucleotide GTR":0.002115725938467595,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"Node80":{
"Global MG94xREV":0.002583046732258624,
"Nucleotide GTR":0.002641466394844553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801274094901392,
"Nucleotide GTR":0.002759647888778336,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Q", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAG", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":{
"Global MG94xREV":5.700516977110128e-05,
"Nucleotide GTR":5.615808774107409e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGT", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "YSCWLF", "DAGV", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TNN", "GNT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 13, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799709801077709,
"Nucleotide GTR":0.002758106839954941,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "S", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TCT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.001079298185573635,
"Nucleotide GTR":0.001063260094612562,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "D", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAT", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002805420275483847,
"Nucleotide GTR":0.00276373245819327,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "P", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CCA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002821348027857075,
"Nucleotide GTR":0.002779423528299459,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTG", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "SL", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TNA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417245_England_20200302_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "EAGV", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GNG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417253_England_20200303_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "I", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ATT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799322659577129,
"Nucleotide GTR":0.002757725451276596,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "V", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GTT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002821166413487569,
"Nucleotide GTR":0.002779244612672356,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "R", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "CGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTN", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418691_England_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QH", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAN", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_418731_England_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800315579562282,
"Nucleotide GTR":0.002758703616728437,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "ILV", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "NTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "DAGV", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GNT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799223502891504,
"Nucleotide GTR":0.002757627768033595,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAC", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "TPAS", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "NCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799237399165312,
"Nucleotide GTR":0.002757641457812377,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "V", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "GTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "IM", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATN", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_420739_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800537528916517,
"Nucleotide GTR":0.002758922267972861,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799881931477913,
"Nucleotide GTR":0.002758276412542067,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAC", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":{
"Global MG94xREV":0.002802132721683552,
"Nucleotide GTR":0.00276049375658933,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "S", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "TCA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0]
],
"original name":"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":7.454817118282196e-05,
"Nucleotide GTR":7.344040470420396e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "C", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "TGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421884_England_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "ED", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAN", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421901_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800879999500352,
"Nucleotide GTR":0.002759259649532692,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "S", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "TCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_421990_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "TPAS", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "NCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":7.94682124772573e-05,
"Nucleotide GTR":7.828733546174859e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "L", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTA", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "ED", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAN", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002803128377169568,
"Nucleotide GTR":0.002761474616893191,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "R", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "AGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002794324288191399,
"Nucleotide GTR":0.002752801354392589,
"amino-acid": [
["M", "R", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AGA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "TPAS", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "NCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423055_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "NTSI", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ANT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423187_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "CW", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGN", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423270_England_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "ED", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CT-", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAN", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423333_England_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "EAGV", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GNA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423412_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00013485506661162,
"Nucleotide GTR":0.0001328511553164953,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "S", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "TCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423492_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTN", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423562_England_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "KN", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAN", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423575_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "NTSI", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "ANC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423634_England_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "NHDY", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "NAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423669_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798812226395263,
"Nucleotide GTR":0.00275722260299936,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "A", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GCA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423756_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "LF", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTN", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423802_England_20200223_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "KQE", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "NAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423805_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KTRI", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCN", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ANA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423807_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "ED"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAN"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2]
],
"original name":"epi_isl_423881_England_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
]
},
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "KTRI", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ANA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423934_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "YSCF", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TNC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_423967_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800267223362811,
"Nucleotide GTR":0.002758655979089536,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "H", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "CAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424015_England_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "G", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GGG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800634533129258,
"Nucleotide GTR":0.002759017830728174,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "H", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAT", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":{
"Global MG94xREV":0.002803887532628877,
"Nucleotide GTR":0.002762222491499375,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "T", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "ACT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003640250647143623,
"Nucleotide GTR":0.003586157467167633,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00281010921439487,
"Nucleotide GTR":0.002768351720688847,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "R", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TNA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CGT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001198285324065342,
"Nucleotide GTR":0.0001180479115103296,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "L", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TTA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "HPRL", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CNT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280687293065795,
"Nucleotide GTR":0.002765163527288447,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "Q", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CAA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0007137323248526342,
"Nucleotide GTR":0.0007031264477179854,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "S", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "TCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACG", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806939237594137,
"Nucleotide GTR":0.002765228848920766,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGA", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798936699199528,
"Nucleotide GTR":0.002757345226170052,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACG", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTT", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280308978005497,
"Nucleotide GTR":0.002761436593321701,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "K", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AAA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001198285367383733,
"Nucleotide GTR":0.0001180479157777988,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "TTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTT", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "KTRI", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ANA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0]
],
"original name":"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002793356191727049,
"Nucleotide GTR":0.002751847643590478,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "P", "L", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CCT", "CTA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "Y", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "TAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002800488570902291,
"Nucleotide GTR":0.002758874037462022,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "V", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GTA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002802843888818905,
"Nucleotide GTR":0.002761194355965599,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "I", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "ATA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002820914905652901,
"Nucleotide GTR":0.002778996842178846,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "Q", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "CAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGN", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "SL", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TNA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "KQE", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "NAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "SL", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TNA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "QPRL", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CNA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002820916183766409,
"Nucleotide GTR":0.002778998101299917,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "D", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAC", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799260987122725,
"Nucleotide GTR":0.002757664695258863,
"amino-acid": [
["M", "E", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "GAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801457150441149,
"Nucleotide GTR":0.002759828224160276,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "S", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "AGT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0005143501189298806,
"Nucleotide GTR":0.0005067070096358057,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "P", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CCG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTN", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "KN", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAN", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799407569994029,
"Nucleotide GTR":0.002757809099946739,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "A", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GCT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432501_England_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001049856040972627,
"Nucleotide GTR":0.0001034255452640125,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAG"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432607_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799865718602117,
"Nucleotide GTR":0.002758260440585398,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "F", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "TTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_432806_England_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433051_England_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279992904403687,
"Nucleotide GTR":0.002758322825020624,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGC", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799260987122725,
"Nucleotide GTR":0.002757664695258863,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "A", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "GCA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799881931477716,
"Nucleotide GTR":0.002758276412541874,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "P", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CCT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433767_England_20200406_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433810_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "ILVF", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "-TC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433810_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801718536073448,
"Nucleotide GTR":0.002760085725669907,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "S", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "TCT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_433872_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800129112173701,
"Nucleotide GTR":0.002758519920196858,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGT", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.004364219371162488,
"Nucleotide GTR":0.004299368203816571,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "H", "-", "-", "-", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAT", "---", "---", "---", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002806509450452934,
"Nucleotide GTR":0.002764805448304953,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "D", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GAT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTT", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002802185454156515,
"Nucleotide GTR":0.002760545705471429,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCG", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":6.470391773263078e-05,
"Nucleotide GTR":6.374243430571089e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "H", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CAT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002804637938128299,
"Nucleotide GTR":0.002762961746167808,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "H", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAC", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002820855697365808,
"Nucleotide GTR":0.002778938513711536,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "L", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "QPRL", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "NTSI", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTA", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CNG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ANC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0008827836032233308,
"Nucleotide GTR":0.0008696656679606918,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "Q", "L", "F", "I", "R", "QPRL", "E", "E", "V", "Q", "EAGV", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "CAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CNA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GNA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TTT", "GCA", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "EAGV", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GNA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279895658817947,
"Nucleotide GTR":0.002757364819604916,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "A", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "GCA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTN", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QPRL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CNA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "KNTRSIM", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ANN", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 15.5, 0]
],
"original name":"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7.5, 0]
]
},
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "ILVF", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "NTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002802185453695614,
"Nucleotide GTR":0.002760545705017378,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "V", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "GTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002800469168024898,
"Nucleotide GTR":0.002758854922906351,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "L", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "TTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":6.417504958643956e-05,
"Nucleotide GTR":6.322142500293147e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "F", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TTT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002799777846981948,
"Nucleotide GTR":0.002758173874714704,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "F", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TTT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437079_California_20200426_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006518441809881823,
"Nucleotide GTR":0.0006421579456114607,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGT", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "SRGC", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "NGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCG", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "LF", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTN", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "ED", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAN", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438355_England_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "KQE", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "NAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438382_England_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438743_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "IMLVF", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "KQE", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "-TN", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "NAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 16.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438743_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002800751955412482,
"Nucleotide GTR":0.00275913350814674,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "F", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTT", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438962_Kanto_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002823659447304813,
"Nucleotide GTR":0.002781700600654018,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438962_Kanto_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002825953164577611,
"Nucleotide GTR":0.002783960233883353,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0004779960527104975,
"Nucleotide GTR":0.0004708931554066065,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "S", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AGC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799109496374262,
"Nucleotide GTR":0.002757515455623609,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "C", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TGT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "CTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439443_England_20200401_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "H", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "CAT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439658_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800371287312796,
"Nucleotide GTR":0.002758758496676233,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCC", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439787_England_20200412_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":5.561717537010919e-05,
"Nucleotide GTR":5.479071857669794e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "V", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GTA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_439956_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "ILVF", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "NTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440237_England_20200323_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002832265426448008,
"Nucleotide GTR":0.002790178697180381,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "-", "HPRL", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "---", "C-C", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440408_England_20200314_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "F", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "TTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440445_England_20200314_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00316353580520572,
"Nucleotide GTR":0.003116526484074013,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "NTSI", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "A-C", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440448_England_20200311_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "RS", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGN", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440595_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACN", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440685_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "NHDY", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "NAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440705_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.003507487275307334,
"Nucleotide GTR":0.003455366924584898,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "SRGC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTC", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "-GT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440854_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800699002566573,
"Nucleotide GTR":0.002759081342166379,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "S", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "TCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_440924_England_20200424_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002800606641044499,
"Nucleotide GTR":0.002758990353112557,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "P", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CCC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441000_England_20200402_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "KQE", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "NAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441109_England_20200402_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "ILVF", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "NTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441318_England_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "TPAS", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "NCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":5.581544266410425e-05,
"Nucleotide GTR":5.498603967015441e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATT", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441452_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "KQE", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "NAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441559_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "QPRL", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CNA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441798_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCN", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441821_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441889_England_20200430_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "L", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "CT-", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441889_England_20200430_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800129113200671,
"Nucleotide GTR":0.00275851992120857,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "S", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "TCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_441918_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "TPAS", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "NCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442260_England_20200405_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":7.005985181077078e-05,
"Nucleotide GTR":6.9018780593308e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "V", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "GTA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442331_England_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "KTRI", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ANA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442342_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.000273173197822561,
"Nucleotide GTR":0.0002691139149910259,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442504_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "TPAS", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "NCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442537_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002800696460217345,
"Nucleotide GTR":0.002759078837595802,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "I", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ATA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442776_England_20200406_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002820134618426548,
"Nucleotide GTR":0.002778228149818194,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "N", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAC", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442851_England_20200409_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002802185454198195,
"Nucleotide GTR":0.002760545705512484,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "R", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CGT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442912_England_20200409_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "QH", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAN", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442937_England_20200410_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800207364913735,
"Nucleotide GTR":0.002758597010121482,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "H", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "CAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_442948_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002802854818337286,
"Nucleotide GTR":0.002761205123074168,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "V", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "GTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443024_England_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "HPRL", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CNT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0001130574954273785,
"Nucleotide GTR":0.0001113774903836086,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "Q", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "CAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002814826339496833,
"Nucleotide GTR":0.002772998750535884,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "QHPRL", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "C--", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTA", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 17, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443449_England_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 7, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002802486305546751,
"Nucleotide GTR":0.002760842086288075,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "F", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "TTT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443595_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":{
"Global MG94xREV":0.0001198285206154994,
"Nucleotide GTR":0.0001180478998945067,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "F", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TTT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443609_England_20200414_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002801594220355404,
"Nucleotide GTR":0.002759963257251179,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTT", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443813_England_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "ED", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAN", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_443844_England_20200326_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":{
"Global MG94xREV":6.627645616556157e-05,
"Nucleotide GTR":6.529160522560017e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACC", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444010_England_20200325_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":6.665550285608097e-05,
"Nucleotide GTR":6.566501938066057e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "V", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GTA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444058_California_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":{
"Global MG94xREV":5.621767424861354e-05,
"Nucleotide GTR":5.538229419769646e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAC", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444174_England_20200411_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0002885121240418628,
"Nucleotide GTR":0.000284224908747142,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "F", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "TTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444295_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800880002929327,
"Nucleotide GTR":0.002759259652910712,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "I", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "ATA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444342_England_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGT", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279953411528672,
"Nucleotide GTR":0.002757933764809218,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "P", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "CCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":{
"Global MG94xREV":5.95515736210713e-05,
"Nucleotide GTR":5.866665269062232e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "I", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ATA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799726693313666,
"Nucleotide GTR":0.002758123481176656,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGT", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800322634318742,
"Nucleotide GTR":0.002758710566653045,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "L", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CTT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279972669808751,
"Nucleotide GTR":0.00275812348587956,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "S", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "TCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002800469565240327,
"Nucleotide GTR":0.002758855314219263,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "L", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "TTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "F", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "TTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":{
"Global MG94xREV":5.56172481512521e-05,
"Nucleotide GTR":5.479079027633203e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTT", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0.007296131308835577,
"Nucleotide GTR":0.007187712690923369,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AC-", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "I", "I", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "KTRI", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "ATT", "ATT", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "A-A", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807207729066505,
"Nucleotide GTR":0.00276549335067953,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "I", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "ATT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "KQE", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "NAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002798851165363496,
"Nucleotide GTR":0.002757260963344627,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGG", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007387672354253254,
"Nucleotide GTR":0.0007277893460160938,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCT", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799223510919625,
"Nucleotide GTR":0.002757627775942416,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "P", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "CCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800469288487891,
"Nucleotide GTR":0.002758855041579293,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "I", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "ATA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799407569994029,
"Nucleotide GTR":0.002757809099946739,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCC", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002796300342124147,
"Nucleotide GTR":0.002754748044676682,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "EAGV", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GNG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "SRGC", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "NGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "ILVF", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "NTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002960226109126923,
"Nucleotide GTR":0.002916237917320329,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":{
"Global MG94xREV":0.000629014966519784,
"Nucleotide GTR":0.0006196679673459098,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "F", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "TTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "ILVF", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "NTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":{
"Global MG94xREV":9.367664233752552e-05,
"Nucleotide GTR":9.228463174136335e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "ILVF", "F", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "NTT", "TTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KN", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAN", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.5818863115421934,
"Nucleotide GTR":0.5732396319514578,
"amino-acid": [
["-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "K", "K", "KNTRSIM", "-"]
],
"codon": [
["---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "AAA", "AAA", "ANN", "---"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 13.5, 0]
],
"original name":"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 9.5, 0]
]
},
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002795970329235027,
"Nucleotide GTR":0.002754422935693455,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "V", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GTG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799534115350259,
"Nucleotide GTR":0.002757933764871812,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "CTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002806616302847747,
"Nucleotide GTR":0.002764910712900906,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "T", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "ACT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0008287688893286769,
"Nucleotide GTR":0.0008164535986977593,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "Y", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "TAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":{
"Global MG94xREV":0.0004318329254509776,
"Nucleotide GTR":0.000425416000238889,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "F", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "TTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTN", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAT", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "L", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CTA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002807464459941906,
"Nucleotide GTR":0.002765746266600744,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "N", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "AAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1":{
"Global MG94xREV":0.005628701365107854,
"Nucleotide GTR":0.005545060323463425,
"amino-acid": [
["K", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["AAA", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[1.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0.5, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002801029500663816,
"Nucleotide GTR":0.002759406929147664,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "D", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAT", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0006756514391052098,
"Nucleotide GTR":0.0006656114340508224,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "F", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "TTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799490170017739,
"Nucleotide GTR":0.00275789047255553,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "P", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CCT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799057084526073,
"Nucleotide GTR":0.002757463822601889,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "A", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "GCT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3":{
"Global MG94xREV":0.002800578274024725,
"Nucleotide GTR":0.002758962407619333,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "F", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "TTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_447929_England_20200426_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800878937002222,
"Nucleotide GTR":0.002759258602823006,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTT", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_447929_England_20200426_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448043_England_20200504_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002798851752371566,
"Nucleotide GTR":0.002757261541629908,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTC", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448043_England_20200504_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448079_England_20200507_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799175194088238,
"Nucleotide GTR":0.002757580177086607,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "C", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TGC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448079_England_20200507_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15":{
"Global MG94xREV":7.429114348297607e-05,
"Nucleotide GTR":7.318719636927936e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAT", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002803128377894718,
"Nucleotide GTR":0.002761474617607567,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "K"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "AAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1]
],
"original name":"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448258_England_20200412_null_9":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "V", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GTA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448258_England_20200412_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448281_England_20200415_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800374181205314,
"Nucleotide GTR":0.002758761347566259,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "I", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ATA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448281_England_20200415_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448315_England_20200422_null_1":{
"Global MG94xREV":0.0007058992574246042,
"Nucleotide GTR":0.0006954097776392629,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "L", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "CTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448315_England_20200422_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448317_England_20200423_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "EAGV", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GNA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448317_England_20200423_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448364_England_20200503_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002800784795858971,
"Nucleotide GTR":0.002759165860592716,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "S", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "TCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448364_England_20200503_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448375_England_20200501_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "N", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "AAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448375_England_20200501_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448380_England_20200502_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002800991880115452,
"Nucleotide GTR":0.002759369867630883,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "L", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TTA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448380_England_20200502_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448409_England_20200429_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002802182641640897,
"Nucleotide GTR":0.002760542934749065,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "I", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "ATA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448409_England_20200429_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448469_England_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279988193209965,
"Nucleotide GTR":0.002758276413154566,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "T", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ACT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448469_England_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448504_England_20200405_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002801096093796383,
"Nucleotide GTR":0.002759472532723561,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAT", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448504_England_20200405_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448509_England_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "KQE", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "NAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448509_England_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448548_England_20200101_null_2":{
"Global MG94xREV":0.00281107032412912,
"Nucleotide GTR":0.00276929854858185,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "H", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CAT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448548_England_20200101_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448612_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800521343631724,
"Nucleotide GTR":0.0027589063231972,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATC", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448612_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448734_England_20200101_null_8":{
"Global MG94xREV":0.0006629730104931751,
"Nucleotide GTR":0.0006531214035979268,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "S", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "TCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448734_England_20200101_null_8",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448753_England_20200101_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00279985693663874,
"Nucleotide GTR":0.002758251789119718,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "F", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "TTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448753_England_20200101_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448823_England_20200324_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "HPRL", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CNT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448823_England_20200324_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448869_England_20200417_null_7":{
"Global MG94xREV":5.691617494761683e-05,
"Nucleotide GTR":5.607041535757266e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "I", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ATT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448869_England_20200417_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448889_England_20200415_null_16":{
"Global MG94xREV":7.787855544084448e-05,
"Nucleotide GTR":7.672130031638286e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "D", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAT", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448889_England_20200415_null_16",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448891_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0005950758048514473,
"Nucleotide GTR":0.0005862331328127938,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "S", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "TCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448891_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448902_England_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001237186893186376,
"Nucleotide GTR":0.0001218802617002104,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "G", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GGT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448902_England_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448917_England_20200417_null_38":{
"Global MG94xREV":0.002800172981182857,
"Nucleotide GTR":0.002758563137323923,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAT", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448917_England_20200417_null_38",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7":{
"Global MG94xREV":0.002800669424440644,
"Nucleotide GTR":0.002759052203563725,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "TTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002799823487504528,
"Nucleotide GTR":0.002758218837030963,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "T", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ACA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_448990_England_20200419_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001476965031678711,
"Nucleotide GTR":0.0001455017714578574,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "C", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "TGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_448990_England_20200419_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449036_England_20200503_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "I", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ATA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449036_England_20200503_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449043_England_20200504_null_110":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAG", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449043_England_20200504_null_110",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449114_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "ILV", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "NTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449114_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "KTRI", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ANA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449123_England_20200408_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449147_England_20200408_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTN", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449147_England_20200408_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7":{
"Global MG94xREV":0.0001198285192721278,
"Nucleotide GTR":0.0001180478985710973,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "S", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "TCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10":{
"Global MG94xREV":0.002801029030362684,
"Nucleotide GTR":0.002759406465835081,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "L", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "TTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "L", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CTA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1":{
"Global MG94xREV":0.00280065395417573,
"Nucleotide GTR":0.002759036963182933,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "F", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "TTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCT", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799261016434209,
"Nucleotide GTR":0.002757664724134783,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAG", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449670_England_20200415_null_3":{
"Global MG94xREV":4.287235627416142e-05,
"Nucleotide GTR":4.223528418525107e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAC", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449670_England_20200415_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449706_England_20200414_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0001198285209515253,
"Nucleotide GTR":0.0001180479002255394,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "L", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CTT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449706_England_20200414_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449720_England_20200417_null_2":{
"Global MG94xREV":0.002799494163105218,
"Nucleotide GTR":0.002757894406306765,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "P", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CCC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449720_England_20200417_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449722_England_20200417_null_29":{
"Global MG94xREV":0.00279948823771694,
"Nucleotide GTR":0.00275788856896822,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "V", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GTT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449722_England_20200417_null_29",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KQE", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "NAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5":{
"Global MG94xREV":0.002803457066766437,
"Nucleotide GTR":0.002761798422247949,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "T", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "ACA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002803112526117054,
"Nucleotide GTR":0.002761459001383211,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "I", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "ATA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "L", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6":{
"Global MG94xREV":0.002800471269414635,
"Nucleotide GTR":0.002758856993069979,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "S", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "TCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12":{
"Global MG94xREV":0.002799726698123125,
"Nucleotide GTR":0.002758123485914646,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAT", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002800351161272301,
"Nucleotide GTR":0.002758738669703472,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTC", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0001448763969148754,
"Nucleotide GTR":0.000142723571251967,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "S", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "TCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2":{
"Global MG94xREV":0.001525919471661227,
"Nucleotide GTR":0.001503244704286565,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "F", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCT", "TTT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "IM", "F", "I", "V", "-", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "AT-", "TTT", "ATT", "GTT", "---", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002806509453337614,
"Nucleotide GTR":0.002764805451146768,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCA", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0.003191857448838558,
"Nucleotide GTR":0.003144427275431896,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "CAA", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "F", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "TTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "TCT", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002005553327182517,
"Nucleotide GTR":0.001975751325179206,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "Q", "-", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "CAA", "---", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451329_Sichuan_20200205_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002799223510908857,
"Nucleotide GTR":0.002757627775931813,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCC", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451329_Sichuan_20200205_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451410_New_York_20200326_null_3":{
"Global MG94xREV":0.000594164441730729,
"Nucleotide GTR":0.000585335312311552,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "F", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TTT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451410_New_York_20200326_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451615_New_South_Wales_20200417_null_4":{
"Global MG94xREV":0.002799873970418521,
"Nucleotide GTR":0.002758268569781953,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "L", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "CTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451615_New_South_Wales_20200417_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_97":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "L", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TTA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_97",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0.0007343598366800224,
"Nucleotide GTR":0.0007234474400724322,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "V", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GTG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "RS", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGN", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451684_Jura_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "YSCF", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TNT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451684_Jura_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451686_Bern_20200313_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "TPAS", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "NCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451686_Bern_20200313_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451710_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "YSCF", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TNC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451710_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "KN", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "ILVF", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAN", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "NTC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451724_Schwyz_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "KTRI", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "ANA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451724_Schwyz_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCN", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "TPAS", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "EAGV", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "NCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GNG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "TPAS", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "NCN", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 12, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451742_Basel_Land_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "KTRI", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ANA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451742_Basel_Land_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451749_Uri_20200325_null_2":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "SL", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TNA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451749_Uri_20200325_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCN", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTN", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451761_Zurich_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "QH", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAN", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451761_Zurich_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "KN", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAN", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451763_Graubunden_20200326_null_5":{
"Global MG94xREV":0.0001561076660479471,
"Nucleotide GTR":0.0001537879466402218,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "L", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CTA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451763_Graubunden_20200326_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451771_Bern_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "ED", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "YSCF", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAN", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TNT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451771_Bern_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGN", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "QPRL", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "KTRI", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CNG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGN", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "ANA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "QH", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "ILVF", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAN", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "NTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "EAGV", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "ILVF", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GNG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "NTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "QH", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "ILVF", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAN", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "NTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "ILVF", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "NTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451795_Zurich_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "KTRI", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "YSCF", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ANA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TNT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451795_Zurich_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451802_Geneve_20200330_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "ILVF", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "NTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451802_Geneve_20200330_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "EAGV", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "HPRL", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "ILVF", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GNA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CNT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "NTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCN", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "KQE", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "NAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451816_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "NTSI", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "ILVF", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "EAGV"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "ANC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "NTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GNA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3]
],
"original name":"epi_isl_451816_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "ILVF", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "NTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "ILVF", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "NTT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451830_Bern_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "DAGV", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGN", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GNT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451830_Bern_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451842_Zurich_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "KN", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAN", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451842_Zurich_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "ILVF", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "NTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451855_Zurich_20200331_null_3":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "KQE", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "NAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451855_Zurich_20200331_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451856_Graubunden_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "LF", "DAGV", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTN", "GNT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451856_Graubunden_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "SRGC", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "NGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "QH", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "SRGC", "DAGV", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAN", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "NGT", "GNC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "QH", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "YSCF", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAN", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TNT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "DAGV", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "SRGC", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GNC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAN", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "NGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "ILVF", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "EAGV", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "NTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GNG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "TPAS", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "TPAS", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "HPRL", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "NCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "NCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CNT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "TPAS", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "NCA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0]
],
"original name":"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451882_Vaud_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "KN", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAN", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451882_Vaud_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "RG", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "NGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "RS", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "YSCF", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGN", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TNT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "ILVF", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "NTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "CW", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "NHDY", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGN", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "NAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "DAGV", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "NTSI", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GNT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "ANC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451896_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "EAGV", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "KN", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GNA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAN", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451896_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "QPRL", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "KTRI", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CNG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "ANA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451901_Valais_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "LF", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTN", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451901_Valais_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_3":{
"Global MG94xREV":7.23352241471655e-05,
"Nucleotide GTR":7.126034148724032e-05,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "K", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "AAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451907_Bern_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "EAGV", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GNG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451907_Bern_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0.002809393752568896,
"Nucleotide GTR":0.002767646890439945,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "S", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "YSCF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TCT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TNT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_4":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "LF", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTN", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_4",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "LF", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "ILV", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTN", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "NTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_451916_Aargau_20200407_null_1":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "KQE", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "KQE", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "NAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "NAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACN", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_451916_Aargau_20200407_null_1",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452011_Denmark_20200311_null_3":{
"Global MG94xREV":0.0006600982621167428,
"Nucleotide GTR":0.0006502893732363743,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "L", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CTT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452011_Denmark_20200311_null_3",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452026_Denmark_20200319_null_15":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTT", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452026_Denmark_20200319_null_15",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_7":{
"Global MG94xREV":0.00280075959866901,
"Nucleotide GTR":0.002759141037826461,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "I", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "ATA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_7",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_9":{
"Global MG94xREV":0.0001411424331322668,
"Nucleotide GTR":0.0001390450932022089,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "I", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ATA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_9",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_5":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "SL", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TNA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_5",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2":{
"Global MG94xREV":0.0027993233450559,
"Nucleotide GTR":0.002757726126569334,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "F", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TTT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
},
"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_26207":{
"Global MG94xREV":0,
"Nucleotide GTR":0,
"amino-acid": [
["M", "K", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "-", "I", "I", "-", "L", "F", "L", "A", "L", "I", "T", "L", "A", "T", "C", "E", "L", "Y", "H", "Y", "Q", "E", "C", "V", "R", "G", "T", "T", "V", "L", "L", "K", "E", "P", "C", "S", "S", "G", "T", "Y", "E", "G", "N", "S", "P", "F", "H", "P", "L", "A", "D", "N", "K", "F", "A", "L", "T", "C", "F", "S", "T", "Q", "F", "A", "F", "A", "C", "P", "D", "G", "V", "K", "H", "V", "Y", "Q", "L", "R", "A", "R", "S", "V", "S", "P", "K", "L", "F", "I", "R", "Q", "E", "E", "V", "Q", "E", "L", "Y", "S", "P", "I", "F", "L", "I", "V", "A", "A", "I", "V", "F", "I", "T", "L", "C", "F", "T", "L", "K", "R", "K", "T", "E"]
],
"codon": [
["ATG", "AAA", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "---", "ATT", "ATT", "---", "CTT", "TTC", "TTG", "GCA", "CTG", "ATA", "ACA", "CTC", "GCT", "ACT", "TGT", "GAG", "CTT", "TAT", "CAC", "TAC", "CAA", "GAG", "TGT", "GTT", "AGA", "GGT", "ACA", "ACA", "GTA", "CTT", "TTA", "AAA", "GAA", "CCT", "TGC", "TCT", "TCT", "GGA", "ACA", "TAC", "GAG", "GGC", "AAT", "TCA", "CCA", "TTT", "CAT", "CCT", "CTA", "GCT", "GAT", "AAC", "AAA", "TTT", "GCA", "CTG", "ACT", "TGC", "TTT", "AGC", "ACT", "CAA", "TTT", "GCT", "TTT", "GCT", "TGT", "CCT", "GAC", "GGC", "GTA", "AAA", "CAC", "GTC", "TAT", "CAG", "TTA", "CGT", "GCC", "AGA", "TCA", "GTT", "TCA", "CCT", "AAA", "CTG", "TTC", "ATC", "AGA", "CAA", "GAG", "GAA", "GTT", "CAA", "GAA", "CTT", "TAC", "TCT", "CCA", "ATT", "TTT", "CTT", "ATT", "GTT", "GCG", "GCA", "ATA", "GTG", "TTT", "ATA", "ACA", "CTT", "TGC", "TTC", "ACA", "CTC", "AAA", "AGA", "AAG", "ACA", "GAA"]
],
"nonsynonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
],
"original name":"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_26207",
"synonymous substitution count": [
[0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0]
]
}
},
"attributes":{
"Global MG94xREV":{
"attribute type":"branch length",
"display order":1
},
"Nucleotide GTR":{
"attribute type":"branch length",
"display order":0
},
"amino-acid":{
"attribute type":"node label",
"display order":1
},
"codon":{
"attribute type":"node label",
"display order":0
},
"nonsynonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":1
},
"original name":{
"attribute type":"node label",
"display order":-1
},
"synonymous substitution count":{
"attribute type":"branch label",
"display order":0
}
}
},
"data partitions":{
"0":{
"coverage": [
[0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99, 100, 101, 102, 103, 104, 105, 106, 107, 108, 109, 110, 111, 112, 113, 114, 115, 116, 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126, 127, 128, 129, 130, 131, 132, 133, 134, 135, 136, 137, 138, 139, 140, 141, 142, 143, 144, 145, 146]
],
"name":"slac.filter.default"
}
},
"fits":{
"Global MG94xREV":{
"AIC-c":5344.488441121654,
"Equilibrium frequencies": [
[0.02976155986542073],
[0.01297996524755356],
[0.008837674569704494],
[0.02786723722525002],
[0.02467029793207196],
[0.01075950357619334],
[0.007325827868136289],
[0.02310003400357475],
[0.01434987952749712],
[0.006258440028538465],
[0.004261186777573214],
[0.01343651000669309],
[0.03356248636386543],
[0.0146376704915465],
[0.009966357058408648],
[0.03142623483447699],
[0.02424234663481829],
[0.01057286036961693],
[0.007198748027095933],
[0.02269932179711283],
[0.02009524758641459],
[0.008764178238376037],
[0.005967269839667099],
[0.01881618551322636],
[0.01168872717849898],
[0.005097826634461142],
[0.00347095943239378],
[0.01094473994701197],
[0.02733840000451489],
[0.01192314796626688],
[0.008118118928874729],
[0.02559831143695407],
[0.02785257875302378],
[0.0121473977138223],
[0.008270803951787769],
[0.02607976271926834],
[0.02308788313249522],
[0.01006936202452067],
[0.006855930890417993],
[0.02161833987168258],
[0.01342944225515537],
[0.005857007984600803],
[0.003987863567648515],
[0.0125746585467798],
[0.03140970429049902],
[0.01369877358479133],
[0.009327089914148125],
[0.02941047729340567],
[0.01464975110835135],
[0.03145217122243393],
[0.02784396703541621],
[0.01214364186917661],
[0.00826824670821431],
[0.02607169913729977],
[0.007063546550088984],
[0.004809360004211964],
[0.01516502730236712],
[0.03788007613508335],
[0.01652070906334916],
[0.01124846234778372],
[0.03546901011036698]
],
"Log Likelihood":-2203.963013346112,
"Rate Distributions":{
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *background*": [
[1.034873598156979, 1]
],
"non-synonymous/synonymous rate ratio for *test*": [
[0.9829230189125813, 1]
]
},
"display order":1,
"estimated parameters":464
},
"Nucleotide GTR":{
"AIC-c":5858.233848389708,
"Equilibrium frequencies": [
[0.2950298818400457],
[0.2170394858553928],
[0.1652871954505602],
[0.3226434368540013]
],
"Log Likelihood":-2228.91386667879,
"Rate Distributions":{
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide C":0.2541221917001524,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide G":1,
"Substitution rate from nucleotide A to nucleotide T":0.4216426298399573,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide G":0.2500757843309523,
"Substitution rate from nucleotide C to nucleotide T":2.167426238555411,
"Substitution rate from nucleotide G to nucleotide T":1.164536359987894
},
"display order":0,
"estimated parameters":697
}
},
"input":{
"file name":"/data/shares/veg/SARS-CoV-2/SARS-CoV-2/data/fasta/2020-05-27/sequences.ORF7a.compressed.fas",
"number of sequences":346,
"number of sites":147,
"partition count":1,
"trees":{
"0":"(epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1,epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1,epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1,epi_isl_440685_England_20200405_null_1,epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1,epi_isl_417253_England_20200303_null_1,epi_isl_418731_England_20200313_null_1,epi_isl_441559_England_20200406_null_1,(epi_isl_444010_England_20200325_null_3,epi_isl_451916_Aargau_20200407_null_1)Node610,epi_isl_423634_England_20200321_null_1,epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1,epi_isl_451907_Bern_20200407_null_1,(epi_isl_448902_England_20200415_null_2,epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_1)Node619,epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1,epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1,epi_isl_423805_England_20200324_null_1,epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_451856_Graubunden_20200406_null_1,epi_isl_451830_Bern_20200331_null_1,epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1,epi_isl_451896_Bern_20200407_null_1,((epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1,epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4)Node639,epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_1)Node638,(epi_isl_448734_England_20200101_null_8,epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1)Node643,epi_isl_451882_Vaud_20200407_null_1,epi_isl_423575_England_20200331_null_1,(epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1,epi_isl_436958_LA_20200406_null_1)Node653,epi_isl_438382_England_20200331_null_1,epi_isl_451855_Zurich_20200331_null_3,epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_4,(epi_isl_449670_England_20200415_null_3,epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_1)Node662,epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1,epi_isl_421901_England_20200326_null_1,((epi_isl_448990_England_20200419_null_3,epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1)Node671,epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2)Node670,epi_isl_451710_Zurich_20200316_null_1,epi_isl_448509_England_20200406_null_1,(epi_isl_444174_England_20200411_null_3,epi_isl_451771_Bern_20200326_null_1)Node679,epi_isl_423967_England_20200320_null_1,epi_isl_448317_England_20200423_null_1,epi_isl_442937_England_20200410_null_1,epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1,(epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1,epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4,epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1)Node23,(epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1,epi_isl_451816_Basel_Land_20200331_null_1)Node28,epi_isl_451761_Zurich_20200326_null_1,epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1,(epi_isl_442260_England_20200405_null_2,epi_isl_448891_England_20200417_null_2)Node46,(epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_4,epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1)Node40,(epi_isl_448315_England_20200422_null_1,epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1)Node43,((epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2,epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3)Node509,epi_isl_423055_England_20200319_null_1)Node508,(epi_isl_423881_England_20200318_null_1,epi_isl_432607_England_20200404_null_1)Node505,epi_isl_451724_Schwyz_20200316_null_1,epi_isl_423562_England_20200401_null_1,(epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1,epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1,epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36)Node529,(epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1,epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1,epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1,epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3)Node519,(epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1,epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1)Node526,(epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1,epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8)Node502,(epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1,epi_isl_449114_England_20200408_null_1)Node499,epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_1,epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1,epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3,epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1,epi_isl_451842_Zurich_20200331_null_1,((epi_isl_446866_Wales_20200420_null_3,epi_isl_451890_Bern_20200407_null_1)Node548,epi_isl_423669_England_20200320_null_1)Node547,(((epi_isl_438962_Kanto_20200413_null_1,epi_isl_433051_England_20200404_null_1,(epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1,epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1)Node557,epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2)Node554,epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1)Node553,epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1)Node552,(epi_isl_443609_England_20200414_null_6,epi_isl_451684_Jura_20200313_null_1)Node67,(epi_isl_417245_England_20200302_null_1,epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1)Node64,(epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1,epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1,epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1)Node566,(epi_isl_440408_England_20200314_null_1,epi_isl_440445_England_20200314_null_8)Node571,(epi_isl_421884_England_20200327_null_1,epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1)Node58,(epi_isl_423412_England_20200329_null_1,epi_isl_439956_England_20200323_null_1)Node61,((((epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1,epi_isl_442504_England_20200409_null_4)Node578,epi_isl_449036_England_20200503_null_5)Node577,epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1)Node576,epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1)Node575,(epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14,epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1)Node584,((epi_isl_444295_England_20200324_null_1,epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1)Node598,epi_isl_441318_England_20200403_null_2)Node597,(epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1,epi_isl_423756_England_20200324_null_1,epi_isl_448258_England_20200412_null_9)Node589,(epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1,epi_isl_452011_Denmark_20200311_null_3)Node594,(epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1,epi_isl_449706_England_20200414_null_2)Node496,(epi_isl_442537_England_20200408_null_1,epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7)Node80,(epi_isl_451410_New_York_20200326_null_3,epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1)Node74,(epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1,epi_isl_440595_England_20200403_null_2)Node77,epi_isl_423934_England_20200319_null_1,(epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1,epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4)Node493,(epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1,epi_isl_448823_England_20200324_null_1)Node490,(epi_isl_442342_England_20200405_null_1,epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12)Node487,(epi_isl_423333_England_20200327_null_2,epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1)Node483,epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2,(epi_isl_420739_England_20200327_null_1,epi_isl_441452_England_20200409_null_2)Node478,(epi_isl_440705_England_20200403_null_1,epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1,epi_isl_424015_England_20200319_null_1,epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4)Node471,epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1,epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1,epi_isl_442776_England_20200406_null_4,epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3,epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2,epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2,epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1,(((epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1,epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1)Node170,epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1)Node169,epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1)Node168,epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1,epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5,epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6,epi_isl_436957_LA_20200406_null_5,epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1,epi_isl_433767_England_20200406_null_2,epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4,epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1,epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1,epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1,epi_isl_448079_England_20200507_null_1,epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3,epi_isl_448612_England_20200101_null_1,epi_isl_430903_USA_20200405_null_1,(epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1,epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17)Node234,epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1,((epi_isl_448380_England_20200502_null_2,epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11)Node215,epi_isl_441821_England_20200403_null_1)Node214,epi_isl_451749_Uri_20200325_null_2,epi_isl_442851_England_20200409_null_4,epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_7,epi_isl_423807_England_20200324_null_1,epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1,epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1,epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1,epi_isl_451742_Basel_Land_20200325_null_2,epi_isl_442912_England_20200409_null_2,epi_isl_448469_England_20200407_null_1,epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1,epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1,epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1,epi_isl_448548_England_20200101_null_2,epi_isl_448409_England_20200429_null_7,epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1,epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1,epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12,epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1,epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1,epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1,epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1,epi_isl_421990_England_20200331_null_1,epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1,epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1,epi_isl_444342_England_20200427_null_1,epi_isl_432501_England_20200330_null_1,epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2,epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_26207,(epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1,epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7,epi_isl_448504_England_20200405_null_1)Node279,(epi_isl_439443_England_20200401_null_4,epi_isl_449720_England_20200417_null_2)Node275,epi_isl_449722_England_20200417_null_29,epi_isl_448917_England_20200417_null_38,epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13,(((epi_isl_452026_Denmark_20200319_null_15,epi_isl_443595_England_20200415_null_3,epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1)Node291,epi_isl_449147_England_20200408_null_1)Node290,epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1)Node289,(epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1,epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1)Node298,(epi_isl_441109_England_20200402_null_1,epi_isl_451905_Bern_20200407_null_3)Node304,epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3,epi_isl_437079_California_20200426_null_5,(epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1,epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1)Node310,epi_isl_441918_England_20200410_null_1,epi_isl_451329_Sichuan_20200205_null_1,epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1,(((epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1,epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_97)Node321,epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1)Node320,epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_5)Node319,epi_isl_443813_England_20200326_null_5,epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1,(epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1,epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15)Node384,(epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1,epi_isl_423492_England_20200331_null_1)Node381,epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1,epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1,epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1,(epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1,epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3,(epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1,epi_isl_439658_England_20200324_null_1)Node341,epi_isl_441889_England_20200430_null_2)Node338,epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1,epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1,epi_isl_433872_England_20200408_null_1,epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1,(epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1,epi_isl_448375_England_20200501_null_3)Node356,epi_isl_442948_England_20200411_null_1,((((epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2,epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1)Node365,epi_isl_440854_England_20200417_null_2)Node364,epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1,epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1)Node363,epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1)Node362,epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7,epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4,epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3,epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1,(epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1,epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_4)Node388,(epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1,epi_isl_443449_England_20200413_null_1,epi_isl_448043_England_20200504_null_2)Node391,(epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1,epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1,epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1)Node399,epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2,(epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3,epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1,epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3)Node406,epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1,epi_isl_432806_England_20200320_null_1,(epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1,epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_1)Node414,epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1,epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1,(epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3,epi_isl_451901_Valais_20200407_null_1)Node440,epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1,((epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12,epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1)Node424,epi_isl_451802_Geneve_20200330_null_1)Node423,((epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1,epi_isl_443844_England_20200326_null_2)Node429,epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1,epi_isl_449043_England_20200504_null_110,epi_isl_418691_England_20200317_null_1,epi_isl_423802_England_20200223_null_1)Node428,(epi_isl_423187_England_20200329_null_1,epi_isl_448869_England_20200417_null_7)Node468,(epi_isl_438355_England_20200329_null_1,epi_isl_448889_England_20200415_null_16)Node465,epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1,epi_isl_448753_England_20200101_null_1,epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1,epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2,epi_isl_447929_England_20200426_null_1,epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8,epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1,(epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2,epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3)Node454,epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2,(epi_isl_441798_England_20200403_null_1,epi_isl_451763_Graubunden_20200326_null_5)Node140,(epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1,epi_isl_423270_England_20200326_null_1)Node137,((epi_isl_451795_Zurich_20200330_null_1,epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_9)Node11,epi_isl_449123_England_20200408_null_4)Node10,epi_isl_451686_Bern_20200313_null_1,epi_isl_440237_England_20200323_null_1,epi_isl_443024_England_20200411_null_1,epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1,epi_isl_451615_New_South_Wales_20200417_null_4,(epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1,epi_isl_444058_California_20200428_null_1)Node127,(epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1,epi_isl_442331_England_20200403_null_1)Node124,epi_isl_441000_England_20200402_null_2,epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5,epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1,epi_isl_440924_England_20200424_null_3,epi_isl_448281_England_20200415_null_1,(epi_isl_440448_England_20200311_null_1,epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1)Node115,epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10,epi_isl_448364_England_20200503_null_4,epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1,epi_isl_439787_England_20200412_null_3,((epi_isl_433810_England_20200406_null_1,epi_isl_438743_England_20200427_null_1,epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1)Node101,epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2)Node100,epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2)"
}
},
"tested":{
"0":{
"Node10":"test",
"Node100":"test",
"Node101":"test",
"Node11":"test",
"Node115":"test",
"Node124":"test",
"Node127":"test",
"Node137":"test",
"Node140":"test",
"Node168":"test",
"Node169":"test",
"Node170":"test",
"Node214":"test",
"Node215":"test",
"Node23":"test",
"Node234":"test",
"Node275":"test",
"Node279":"test",
"Node28":"test",
"Node289":"test",
"Node290":"test",
"Node291":"test",
"Node298":"test",
"Node304":"test",
"Node310":"test",
"Node319":"test",
"Node320":"test",
"Node321":"test",
"Node338":"test",
"Node341":"test",
"Node356":"test",
"Node362":"test",
"Node363":"test",
"Node364":"test",
"Node365":"test",
"Node381":"test",
"Node384":"test",
"Node388":"test",
"Node391":"test",
"Node399":"test",
"Node40":"test",
"Node406":"test",
"Node414":"test",
"Node423":"test",
"Node424":"test",
"Node428":"test",
"Node429":"test",
"Node43":"test",
"Node440":"test",
"Node454":"test",
"Node46":"test",
"Node465":"test",
"Node468":"test",
"Node471":"test",
"Node478":"test",
"Node483":"test",
"Node487":"test",
"Node490":"test",
"Node493":"test",
"Node496":"test",
"Node499":"test",
"Node502":"test",
"Node505":"test",
"Node508":"test",
"Node509":"test",
"Node519":"test",
"Node526":"test",
"Node529":"test",
"Node547":"test",
"Node548":"test",
"Node552":"test",
"Node553":"test",
"Node554":"test",
"Node557":"test",
"Node566":"test",
"Node571":"test",
"Node575":"test",
"Node576":"test",
"Node577":"test",
"Node578":"test",
"Node58":"test",
"Node584":"test",
"Node589":"test",
"Node594":"test",
"Node597":"test",
"Node598":"test",
"Node61":"test",
"Node610":"test",
"Node619":"test",
"Node638":"test",
"Node639":"test",
"Node64":"test",
"Node643":"test",
"Node653":"test",
"Node662":"test",
"Node67":"test",
"Node670":"test",
"Node671":"test",
"Node679":"test",
"Node74":"test",
"Node77":"test",
"Node80":"test",
"epi_isl_408482_Shandong_20200119_null_1":"background",
"epi_isl_408487_Henan_20200120_null_1":"background",
"epi_isl_415610_Washington_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_416320_Shanghai_20200128_null_1":"background",
"epi_isl_416367_Shanghai_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_416384_Shanghai_20200204_null_1":"background",
"epi_isl_416425_Hangzhou_20200203_null_1":"background",
"epi_isl_417245_England_20200302_null_1":"background",
"epi_isl_417253_England_20200303_null_1":"background",
"epi_isl_417697_Reykjavik_20200304_null_1":"background",
"epi_isl_418096_Wales_20200312_null_2":"background",
"epi_isl_418164_Wales_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418691_England_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_418731_England_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_419185_ARA_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_419572_Luxembourg_20200310_null_1":"background",
"epi_isl_419592_Luxembourg_20200315_null_1":"background",
"epi_isl_419693_Belarus_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_419735_Victoria_20200224_null_1":"background",
"epi_isl_420022_Virginia_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_420739_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421208_Li_ge_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_421342_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_421498_Portugal_20200324_null_13":"background",
"epi_isl_421884_England_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_421901_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_421990_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_422087_Wales_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422435_Singapore_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_422465_Wisconsin_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_422668_Netherlands_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_422820_Netherlands_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_422988_Washington_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423055_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423187_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423270_England_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_423333_England_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_423412_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_423492_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423562_England_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_423575_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_423634_England_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_423669_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_423756_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423802_England_20200223_null_1":"background",
"epi_isl_423805_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423807_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_423881_England_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_423934_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_423967_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_424015_England_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_424195_Washington_20200321_null_1":"background",
"epi_isl_424595_Reykjavik_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_424608_Reykjavik_20200329_null_8":"background",
"epi_isl_424669_Arizona_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_424862_Georgia_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_425801_Scotland_20200309_null_1":"background",
"epi_isl_426784_Victoria_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_426794_Victoria_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_427025_Victoria_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_427309_Saint_Petersburg_20200324_null_2":"background",
"epi_isl_427545_New_York_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_428317_Wisconsin_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_428402_Connecticut_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_428441_Guangdong_20200129_null_1":"background",
"epi_isl_428687_Madrid_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_428776_New_York_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_428838_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_429676_Minas_gerais_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_429684_Minas_gerais_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_429711_Luxembourg_20200320_null_4":"background",
"epi_isl_430253_Washington_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_430265_Washington_20200320_null_3":"background",
"epi_isl_430324_New_York_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_430493_Victoria_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_430568_Victoria_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_430626_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430627_Victoria_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_430713_Victoria_20200409_null_3":"background",
"epi_isl_430723_Beijing_20200201_null_1":"background",
"epi_isl_430888_Washington_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_430903_USA_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_430945_Connecticut_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432159_Wales_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_432259_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432501_England_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_432607_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_432806_England_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_433051_England_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_433580_Scotland_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_433647_Scotland_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_433767_England_20200406_null_2":"background",
"epi_isl_433810_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_433872_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_434125_Washington_20200310_null_3":"background",
"epi_isl_434525_Louisiana_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_434557_Manila_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_434598_Virginia_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_434619_Occitanie_20200301_null_1":"background",
"epi_isl_434658_Skane_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_434927_Texas_20200327_null_3":"background",
"epi_isl_435083_Tamil_Nadu_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_435104_Ladakh_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_435367_Utah_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_435443_Alaska_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_435697_Singapore_20200318_null_1":"background",
"epi_isl_436117_Victoria_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_436301_Comunitat_Valenciana_20200317_null_1":"background",
"epi_isl_436725_Abruzzo_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_436842_Michigan_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_436900_Iowa_20200504_null_1":"background",
"epi_isl_436957_LA_20200406_null_5":"background",
"epi_isl_436958_LA_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437079_California_20200426_null_5":"background",
"epi_isl_437321_Istanbul_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_437601_Kanto_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_437846_Washington_20200404_null_17":"background",
"epi_isl_437975_Ischgl_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_438355_England_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_438382_England_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_438743_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_438936_Scotland_20200320_null_2":"background",
"epi_isl_438962_Kanto_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_438964_Kanto_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_438972_Kanto_20200327_null_2":"background",
"epi_isl_438984_Scotland_20200421_null_1":"background",
"epi_isl_439171_Scotland_20200420_null_1":"background",
"epi_isl_439288_Scotland_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_439443_England_20200401_null_4":"background",
"epi_isl_439658_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_439787_England_20200412_null_3":"background",
"epi_isl_439956_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440237_England_20200323_null_1":"background",
"epi_isl_440408_England_20200314_null_1":"background",
"epi_isl_440445_England_20200314_null_8":"background",
"epi_isl_440448_England_20200311_null_1":"background",
"epi_isl_440595_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_440685_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_440705_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_440854_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_440924_England_20200424_null_3":"background",
"epi_isl_441000_England_20200402_null_2":"background",
"epi_isl_441109_England_20200402_null_1":"background",
"epi_isl_441318_England_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_441366_Northern_Ireland_20200323_null_2":"background",
"epi_isl_441452_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_441559_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_441798_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441821_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_441889_England_20200430_null_2":"background",
"epi_isl_441918_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442260_England_20200405_null_2":"background",
"epi_isl_442331_England_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_442342_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_442504_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442537_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_442776_England_20200406_null_4":"background",
"epi_isl_442851_England_20200409_null_4":"background",
"epi_isl_442912_England_20200409_null_2":"background",
"epi_isl_442937_England_20200410_null_1":"background",
"epi_isl_442948_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443024_England_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_443244_Singapore_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_443299_Ile_de_France_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_443449_England_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_443595_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_443609_England_20200414_null_6":"background",
"epi_isl_443813_England_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_443844_England_20200326_null_2":"background",
"epi_isl_444010_England_20200325_null_3":"background",
"epi_isl_444058_California_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_444174_England_20200411_null_3":"background",
"epi_isl_444295_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_444342_England_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_444480_Gujarat_20200430_null_3":"background",
"epi_isl_444650_New_York_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_444706_New_York_20200331_null_12":"background",
"epi_isl_444728_New_York_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_444851_Unknown_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_444864_Unknown_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_444916_Unknown_20200328_null_4":"background",
"epi_isl_445061_Luxembourg_20200424_null_4":"background",
"epi_isl_445136_Louisiana_20200331_null_4":"background",
"epi_isl_445213_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445217_Dhaka_20200428_null_1":"background",
"epi_isl_445247_Santiago_20200308_null_1":"background",
"epi_isl_445368_Santiago_20200322_null_1":"background",
"epi_isl_445371_Santiago_20200328_null_1":"background",
"epi_isl_445379_Santiago_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445439_Wales_20200403_null_2":"background",
"epi_isl_445454_Wales_20200403_null_3":"background",
"epi_isl_445462_Wales_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_445485_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_445669_Wales_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_445730_Wales_20200410_null_2":"background",
"epi_isl_445745_Wales_20200412_null_1":"background",
"epi_isl_445865_Wales_20200410_null_3":"background",
"epi_isl_445978_Wales_20200404_null_12":"background",
"epi_isl_445988_Wales_20200404_null_1":"background",
"epi_isl_446360_Wales_20200409_null_8":"background",
"epi_isl_446406_Wales_20200411_null_1":"background",
"epi_isl_446444_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446549_Wales_20200413_null_1":"background",
"epi_isl_446733_Wales_20200414_null_1":"background",
"epi_isl_446762_Wales_20200421_null_4":"background",
"epi_isl_446866_Wales_20200420_null_3":"background",
"epi_isl_446943_Wales_20200418_null_14":"background",
"epi_isl_447020_Bangkok_20200401_null_1":"background",
"epi_isl_447039_Gujarat_20200503_null_1":"background",
"epi_isl_447048_Gujarat_20200427_null_3":"background",
"epi_isl_447082_Michigan_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_447417_North_District_20200326_null_7":"background",
"epi_isl_447426_Tel_Aviv_District_20200403_null_1":"background",
"epi_isl_447465_Tel_Aviv_District_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_447537_Gujarat_20200505_null_1":"background",
"epi_isl_447592_New_Taipei_City_20200329_null_1":"background",
"epi_isl_447804_Villavicencio_20200404_null_2":"background",
"epi_isl_447813_Cundinamarca_20200405_null_3":"background",
"epi_isl_447929_England_20200426_null_1":"background",
"epi_isl_448043_England_20200504_null_2":"background",
"epi_isl_448079_England_20200507_null_1":"background",
"epi_isl_448129_Scotland_20200407_null_15":"background",
"epi_isl_448141_Scotland_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_448258_England_20200412_null_9":"background",
"epi_isl_448281_England_20200415_null_1":"background",
"epi_isl_448315_England_20200422_null_1":"background",
"epi_isl_448317_England_20200423_null_1":"background",
"epi_isl_448364_England_20200503_null_4":"background",
"epi_isl_448375_England_20200501_null_3":"background",
"epi_isl_448380_England_20200502_null_2":"background",
"epi_isl_448409_England_20200429_null_7":"background",
"epi_isl_448469_England_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_448504_England_20200405_null_1":"background",
"epi_isl_448509_England_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_448548_England_20200101_null_2":"background",
"epi_isl_448612_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448734_England_20200101_null_8":"background",
"epi_isl_448753_England_20200101_null_1":"background",
"epi_isl_448823_England_20200324_null_1":"background",
"epi_isl_448869_England_20200417_null_7":"background",
"epi_isl_448889_England_20200415_null_16":"background",
"epi_isl_448891_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_448902_England_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_448917_England_20200417_null_38":"background",
"epi_isl_448944_Northern_Ireland_20200323_null_7":"background",
"epi_isl_448949_Northern_Ireland_20200324_null_5":"background",
"epi_isl_448990_England_20200419_null_3":"background",
"epi_isl_449036_England_20200503_null_5":"background",
"epi_isl_449043_England_20200504_null_110":"background",
"epi_isl_449114_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449123_England_20200408_null_4":"background",
"epi_isl_449147_England_20200408_null_1":"background",
"epi_isl_449193_Scotland_20200422_null_7":"background",
"epi_isl_449224_Scotland_20200415_null_10":"background",
"epi_isl_449227_Scotland_20200416_null_4":"background",
"epi_isl_449232_Scotland_20200425_null_1":"background",
"epi_isl_449258_Scotland_20200428_null_11":"background",
"epi_isl_449326_Scotland_20200427_null_1":"background",
"epi_isl_449670_England_20200415_null_3":"background",
"epi_isl_449706_England_20200414_null_2":"background",
"epi_isl_449720_England_20200417_null_2":"background",
"epi_isl_449722_England_20200417_null_29":"background",
"epi_isl_449804_Utah_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_449892_Washington_20200412_null_5":"background",
"epi_isl_450055_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450131_New_York_20200319_null_1":"background",
"epi_isl_450250_Saint_Petersburg_20200421_null_6":"background",
"epi_isl_450251_Saint_Petersburg_20200420_null_12":"background",
"epi_isl_450305_Quebec_20200327_null_1":"background",
"epi_isl_450517_Beirut_20200309_null_3":"background",
"epi_isl_450555_Utah_20200407_null_2":"background",
"epi_isl_450723_Bangkok_20200320_null_1":"background",
"epi_isl_450764_Minnesota_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_450805_Virgin_Islands_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_450810_Halland_20200401_null_36":"background",
"epi_isl_450848_Florida_20200409_null_1":"background",
"epi_isl_451225_Louisiana_20200430_null_1":"background",
"epi_isl_451329_Sichuan_20200205_null_1":"background",
"epi_isl_451410_New_York_20200326_null_3":"background",
"epi_isl_451615_New_South_Wales_20200417_null_4":"background",
"epi_isl_451634_New_South_Wales_20200321_null_97":"background",
"epi_isl_451643_New_South_Wales_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_451679_Zurich_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451684_Jura_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451686_Bern_20200313_null_1":"background",
"epi_isl_451710_Zurich_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451719_Basel_Land_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451724_Schwyz_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451726_Zurich_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451729_Sankt_Gallen_20200316_null_1":"background",
"epi_isl_451741_Basel_Land_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451742_Basel_Land_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451749_Uri_20200325_null_2":"background",
"epi_isl_451753_Zurich_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451761_Zurich_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451762_Vaud_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451763_Graubunden_20200326_null_5":"background",
"epi_isl_451771_Bern_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451773_Ticino_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451774_Basel_Stadt_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451777_Schwyz_20200326_null_1":"background",
"epi_isl_451785_Basel_Land_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451789_Aargau_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451793_Vaud_20200325_null_1":"background",
"epi_isl_451795_Zurich_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451802_Geneve_20200330_null_1":"background",
"epi_isl_451811_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451814_Basel_Stadt_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451815_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451816_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451819_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451823_Aargau_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451830_Bern_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451842_Zurich_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451844_Basel_Land_20200331_null_1":"background",
"epi_isl_451855_Zurich_20200331_null_3":"background",
"epi_isl_451856_Graubunden_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451864_Zurich_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451867_Aargau_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451869_Vaud_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451874_Basel_Stadt_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451876_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451878_Glarus_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451879_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451882_Vaud_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451883_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451886_Bern_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451887_Vaud_20200406_null_1":"background",
"epi_isl_451890_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451894_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451896_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451900_Basel_Land_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451901_Valais_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451905_Bern_20200407_null_3":"background",
"epi_isl_451907_Bern_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451909_Aargau_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451912_Aargau_20200407_null_4":"background",
"epi_isl_451913_Vaud_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_451916_Aargau_20200407_null_1":"background",
"epi_isl_452011_Denmark_20200311_null_3":"background",
"epi_isl_452026_Denmark_20200319_null_15":"background",
"epi_isl_452075_Denmark_20200428_null_7":"background",
"epi_isl_452083_Denmark_20200423_null_9":"background",
"epi_isl_452131_Indiana_20200309_null_5":"background",
"epi_isl_452163_Utah_20200415_null_2":"background",
"epi_isl_452189_Veneto_20200401_null_26207":"background"
}
},
"timers":{
"Model fitting":{
"order":1,
"timer":24
},
"Primary SLAC analysis":{
"order":2,
"timer":5
},
"Total time":{
"order":0,
"timer":30
}
}
}